中科院学者Nature Methods首次分离RNA结合蛋白

【字体: 时间:2018年03月01日 来源:中科院

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  中国科学院广州生物医药与健康研究院的研究人员发表了题为“Capturing the interactome of newly transcribed RNA”的文章,介绍了分离RNA结合蛋白的新技术—RICK,该技术是全面分析细胞内的RNA-蛋白相互作用的重要工具,有助于揭开基因组中的“暗物质”-非编码RNA的未知功能。

  

来自中国科学院广州生物医药与健康研究院的研究人员发表了题为“Capturing the interactome of newly transcribed RNA”的文章,介绍了分离RNA结合蛋白的新技术—RICK,该技术是全面分析细胞内的RNA-蛋白相互作用的重要工具,有助于揭开基因组中的“暗物质”-非编码RNA的未知功能。

这一研究成果公布在Nature Methods杂志上,文章的通讯作者为广州生物院研究员Miguel A. Esteban(米格尔·埃斯特班)和张必良,鲍习琛。

RICK技术原理图

有数以百计的蛋白质可以与RNA结合,其中很多涉及神经退行性病变、自身免疫缺陷和癌症等疾病。那么,如何系统地分离RNA结合蛋白的问题变得引人注目。前期科学家们系统地分离了细胞内mRNA结合蛋白,这只是众多转录本中的一部分,细胞还包含了很多非polyA RNA。

在这篇文章中,研究人员设计了RICK(Newly Transcribed RNA interactome using click chemistry)技术,利用核酸标记技术,巧妙地将新合成的RNA标记上生物素,通过链霉亲和素偶联的磁珠,分离得到相应被标记RNA分子和与其相结合的蛋白分子。

通过这一技术,研究人员系统地分离了包括非polyA尾RNA和新生RNA在内的一系列RNA分子及其结合蛋白。进一步地分析发现,细胞分裂调控因子作为新的RNA结合蛋白,存在结合非polyA尾RNA的潜能。研究人员缩短标记的时间,成功地在细胞中分离了新生RNA结合蛋白。这些蛋白与新生RNA的转录及后续的加工、剪切等调控密切相关。这一技术的应用将有助于深入地剖析RNA结合蛋白的作用机制,也是细胞命运转变过程中分析RNA蛋白相互作用的重要工具。

研究工作获得国家重点研发计划项目、国家自然科学基金委、广州珠江科技新星、中科院青年创新促进会等项目的资助。

原文标题:

Capturing the interactome of newly transcribed RNA



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