产前外显子组测序成功诊断骨骼发育不良

【字体: 时间:2018年04月03日 来源:生物通

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  一项最新发表在《Genetics in Medicine》上的研究发现,产前外显子组测序和靶向分析能够对大多数的胎儿骨骼发育不良病例做出诊断。

  

生物通报道:一项最新发表在《Genetics in Medicine》上的研究发现,产前外显子组测序和靶向分析能够对大多数的胎儿骨骼发育不良病例做出诊断。

据统计,胎儿异常的发生率大约为2%至5%。尽管细胞遗传学和基因芯片的方法能够对大约40%的病例做出诊断,但大多数的胎儿异常仍然无法确诊。一般来说,只有在表型明确且致病变异数量有限的情况下才能及时诊断。

于是,伦敦大奥曼德街儿童医院Lyn Chitty领导的团队探索了胎儿及父母的产前靶向外显子组测序是否能够提供诊断,并为妊娠管理提出建议。他们在重点关注骨骼发育不良后,发现81%的病例可以实现明确的分子诊断。

“对于那些在超声检查中发现异常状况而面临艰难抉择的准父母来说,我们相信这将改善产前诊断和咨询,”Chitty及其同事在论文中写道。

在这项研究中,Chitty及其同事招募了英国的一些孕妇。这些孕妇在超声检查中发现胎儿存在异常状况,有可能出现骨骼发育不良,之后她们接受了侵入性检查。在19个转诊病例中,16个接受了测序。

研究人员重点关注与骨骼发育不良相关的240个基因。利用Illumina的NextSeq 500测序平台,她们对所有病例的父母及胎儿DNA开展外显子组测序,有一个例外。对于12号病例,她们测序了父母及兄弟姐妹的DNA,因为胎儿的DNA量太少。之后她们利用Sanger测序证实了所有分析结果。

对于16个病例中的13个,研究人员能够做出明确的分子诊断。她们发现了四种隐性疾病(也就是说胎儿从父母那儿各遗传了一个致病变异),六个新生的显性致病变异以及两个母系遗传的致病变异。对于另一个病例,她们指出情况更为复杂。至于另外3个研究人员无法诊断的病例,两个携带意义不明的变异,另一个未检测到致病变异。

研究人员惊讶地发现,有些胎儿的疾病是遗传自母亲,但她却不知道自己患病。例如,8号病例的胎儿腿骨短且弯曲,而他的母亲也是身材矮小,有骨折病史,且牙齿变色。测序发现她和未出生的孩子都携带COL1A2基因中的致病变异,确认他们都患有IV型常染色体显性成骨不全症。

Chitty及其同事指出,她们能够在11-41天的时间内获得检测结果。由于她们的方法变得更加简化,故周转时间变得更快。

这种周转时间让她们能够在胎儿出生前向父母提供信息,并为他们提供更准确的风险咨询。 研究人员指出,这有助于未来怀孕和终止妊娠的决策过程。 在这一项研究中,她们注意到一些父母在疾病严重的情况下选择了终止妊娠。

不过,研究人员也承认,这项研究的规模比较小,未来还需要更大规模的研究,才能确定这些结果是否广泛适用。(生物通 薄荷)

原文检索

Rapid prenatal diagnosis using targeted exome sequencing: a cohort study to assess feasibility and potential impact on prenatal counseling and pregnancy management

Genetics in Medicine
doi:10.1038/gim.2018.30

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