温州医科大学Nature子刊构建人类脂肪组织lncRNAs资源库

【字体: 时间:2018年04月24日 来源:生物通

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  来自温州医科大学,杜克-新加坡国立大学的研究人员发表了题为“De novo reconstruction of human adipose transcriptome reveals conserved lncRNAs as regulators of brown adipogenesis”的文章,对人类胎儿棕色脂肪、成人内脏和皮下脂肪分别进行了深度RNA-seq测序,由此构建包含3149个lncRNAs的人类脂肪组织活性目录。

  

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来自温州医科大学,杜克-新加坡国立大学的研究人员发表了题为“De novo reconstruction of human adipose transcriptome reveals conserved lncRNAs as regulators of brown adipogenesis”的文章,对人类胎儿棕色脂肪、成人内脏和皮下脂肪分别进行了深度RNA-seq测序,由此构建包含3149个lncRNAs的人类脂肪组织活性目录,并由此建立了一个可以在脂肪细胞发育中发现功能性lncRNAs的路线图。

这一研究成果公布在4月6日的Nature Communications杂志上,文章的通讯作者分别为温州医科大学的徐聃与杜克-新加坡国立大学医学院的孙磊,温州医科大学丁春明为论文的第一作者及并列通讯作者,林艳卿为并列第一作者。(本研究中使用的干扰腺病毒载体由赛业生物提供)

由于糖尿病,血脂异常和高血压等代谢风险因素的影响,肥胖已经成为越来越受关注的健康危机。之前的研究证明了lncRNA在调节小鼠脂肪发育中的多方面作用,但它们在人类脂肪细胞中的意义仍然尚属于空白。

脂肪细胞分为棕色脂肪细胞和白色脂肪细胞,这两者有着明显的形态学区别,它们的生物学功能也大不相同。棕色脂肪组织在全身的能量代谢调控中起着重要的作用,它可以“燃烧”掉多余的能量从而减少体内以脂肪形式堆积的能量。

过去的观点认为,在啮齿类动物的一生中都存在棕色脂肪组织,而人的肩胛区的棕色脂肪只存在于幼年阶段,并随着我们的成长而退化,所以以前的观点认为成年人体内没有棕色脂肪组织。但新近利用成像技术的研究表明,成年人在颈-锁骨区域有相当数量的Ucp1阳性的脂肪细胞,其活性与BMI呈负相关,而与基础代谢速率呈正相关。

此前,研究人员分离并鉴定了多个棕色脂肪组织发育的蛋白调控因子,而近期的高通量测序中获得的新证据显示,大量的长非编码RNAs(lncRNAs)在脂肪发育过程中被严格调控。尽管缺乏蛋白质编码能力,但lncRNAs在脂肪发育和代谢过程中仍行使重要功能。

这一研究团队的早期研究发现了一组对小鼠棕色脂肪发育必不可少的lncRNAs 如lncBATE1、lncBATE10 和 Blnc1。近期孙磊团队又在小鼠中发现了一个对leptin有调控作用的lncRNA (lnc-Leptin)。

但由于大多数lncRNA在小鼠和人之间的保守性较差,人的脂肪样本采集困难,因此至今缺乏完整的人的脂肪的lncRNA目录,特别是在棕色脂肪中,阻碍了我们对人体脂肪中lncRNA的理解。

在最新这篇文章中,研究人员构建了包含3149个lncRNAs的脂肪活性目录,其中909个是通过对成人皮下,网膜白色脂肪组织和胎儿脂肪进行深度RNA-seq,特异性检测到的,318个是人和小鼠之间保守的lncRNAs。而且169种保守的人类lncRNA与其附近的mRNAs呈正相关。

此外,研究人员发现其中一个保守的lncRNA:lnc-dPrdm16,是棕色脂肪发育所必需的调控因子。

这项成果为今后研究人类脂肪中的lncRNAs提供了一个有价值的资源,而且也建立了一个可以在脂肪细胞发育中发现功能性lncRNAs的路线图。

原文标题:

De novo reconstruction of human adipose transcriptome reveals conserved lncRNAs as regulators of brown adipogenesis





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