长链非编码RNA化身套马索调控基因表达

【字体: 时间:2018年04月28日 来源:生物通

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  细胞核中的长链非编码RNA(lncRNA)对控制基因表达是必不可少的。丹麦和德国的一个研究小组近日开展的一项研究揭示了这些非编码RNA在细胞内是如何动态分布的,以及这如何影响它们与癌症的关系。

  

细胞核中的长链非编码RNA(lncRNA)对控制基因表达是必不可少的。丹麦和德国的一个研究小组近日开展的一项研究揭示了这些非编码RNA在细胞内是如何动态分布的,以及这如何影响它们与癌症的关系。这些成果发表在《Nature Communications》上。

众所周知,DNA含有我们的遗传信息,位于控制基因生产的细胞核中。细胞核则分为可溶的核质和不溶的染色质。长链非编码RNA也在细胞核中起作用,它们是调控基因表达的重要组分。不过具体如何调控,人们了解得不多。

研究团队特别注意到一些长链非编码RNA,它们可以增强乳腺癌细胞中特定mRNA的生产,从而提高蛋白质的产量。这表明,长链非编码RNA的表达可能导致特定蛋白质的表达水平特别高,从而参与癌症。

这项研究中的新颖之处在于,它表明这种调控不仅与长链非编码RNA的位置和数量有关系,还与它们在细胞内的动态分布有关。

研究人员发现,一种被称为A-ROD(DKK1表达的激活调控因子)的长链非编码RNA只有在从染色质释放到核质的那一刻才起作用。之前悬挂在染色质上,或之后漂浮在核质中,对基因表达的影响都不大。

在这个短暂的时刻,它可以将转录因子带到DNA上的特定位点以增强基因表达。从染色质完全释放后,A-ROD不再发挥增强基因表达的作用。从某种程度上说,A-ROD的功能就类似一个套马索,从DNA中抛出来捕捉蛋白质。


 
在这幅图中,一种被称为A-ROD的lncRNA从染色质释放后就立即起作用。它将转录因子EBP1(圆形)带到DNA上的特定位点以增强基因表达。旗子符号代表转录起始点;椭圆形代表RNA聚合酶II。

从实验和治疗的角度来看,这些结果令人兴奋,因为在细胞质、核质和染色质中靶向RNA表达的策略差异很大。研究团队认为可以利用这些差异来优化疾病治疗时的靶向策略。未来,他们的目标是鉴定出更多的非编码RNA套索,以充分理解其在基因表达调控中的潜力和应用。(生物通 薄荷)

原文检索

Long ncRNA A-ROD Activates Its Target Gene DKK1 at Its Release from Chromatin.

Nature Communicationsvolume 9, Article number: 1636 (2018)
doi:10.1038/s41467-018-04100-3

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