马达加斯加首次开展DNA测序以追踪结核病

　　

一提到马达加斯加，大家的印象也许还停留在那部卡通电影和美丽的自然风光。其实，尽管旅游资源丰富，但马达加斯加是世界上最不发达的国家之一。耐药性结核杆菌在这个非洲岛国传播。2016年有59,000人患上结核病，大约13,000人死于结核病。

为此，马达加斯加的国家结核病项目及其合作伙伴一直在寻找新方法，以便快速确定并中断疾病的转播。近日，马达加斯加的科学家利用便携式的测序设备，在国内首次完成了DNA测序，并快速鉴定结核杆菌及其耐药性。

这是马达加斯加国内首次开展DNA测序，使用的是英国Oxford Nanopore公司出品的小巧便携的MinION测序仪。研究团队除了将样本提交给国家参考实验室，还与当地结核病诊所合作，评估在现场开展分析的能力。他们的目标是让TB DNA测序离患者更进一步。

结核病是一种古老的疾病。即便在抗生素普及的今天，结核病仍然是许多欠发达地区人口死亡的主要原因之一。在高收入国家，DNA测序已被越来越多地用于疾病的诊断和监控。与传统方法相比，它能够快速精准地提供耐药细菌的丰富信息，并鉴定患者之间的传播。

然而，由于DNA测序系统成本高且复杂，中低收入的国家无力购买，但它们受结核病的影响又最大。MinION测序仪的出现，大大降低了DNA测序的门槛，使得这些国家也能快速获取疾病相关的信息。

这个项目的参与者之一、马达加斯加巴斯德研究所的Niaina Rakotosamimanana表示：“这项工作证明我们可以利用实时DNA测序技术来鉴定结核病及其耐药性。我们已经在实验室完成了这项工作，目前正将其推广到实验室设备和资源非常有限的农村地区。这也是结核病实际发生的地方。”

纽约州立大学石溪分校等机构的科学家负责此次的培训工作。研究协调员Simon Grandjean Lapierre表示：“我们已经培训了22名科学家利用MinION平台开展DNA测序工作。这有助于更好地鉴定和了解威胁马达加斯加公众健康的各种传染病。”

如今，马达加斯加的DNA测序工作不仅仅限于追踪结核病。马达加斯加巴斯德研究所的科学家也开始测序该国特有的其他病毒和细菌，包括冠状病毒、呼吸道合胞病毒、肺炎克雷伯氏菌以及鼠疫杆菌等。这些研究将有助于未来更好地控制疫情。

从欧洲到非洲，从地球到太空，看来，地球人已经无法阻止MinION前进的脚步啦。（生物通 薄荷）