单细胞RNA测序发现新视网膜神经节细胞亚型

【字体: 时间:2018年07月20日 来源:生物通

编辑推荐:

  单细胞测序技术填补了生命科学领域的许多空白,依靠这项技术,康涅狄格大学健康中心和杰克逊实验室(JAX)的研究人员已经鉴定出了40种视网膜神经节细胞(retinal ganglion cells,RGCs)亚型,以及用于区分它们的遗传标记和转录因子。

  

单细胞测序技术填补了生命科学领域的许多空白,依靠这项技术,康涅狄格大学健康中心和杰克逊实验室(JAX)的研究人员已经鉴定出了40种视网膜神经节细胞(retinal ganglion cells,RGCs)亚型,以及用于区分它们的遗传标记和转录因子。

得益于液滴单细胞RNA测序技术(droplet-based single-cell RNA sequencing),研究人员现在能单独分离每个细胞并扩增其遗传物质来探查RNA组成。这才允许科研人员对给定类型细胞(例如RGCs)进行详细普查,识别它们不同亚型之间的细微分子差异。

RGCs将视觉数据从眼睛传递给大脑,之前已经识别了30种RGCs亚型,利用单细胞RNA测序,研究小组分析了6225个来自新生小鼠左右眼的单个RGCs,检测到大约5000个表达基因,通过聚类算法运行所得数据,将细胞分类为40个子类型。

由神经科学系教授Ephraim F. Trakhtenberg博士领导的这项研究发表于《Nature Communications》,他们为生物学领域的一大类问题提供了新参考:细胞的亚型或类型由什么决定?

哺乳动物中枢神经系统高度复杂,涉及许多专门的神经元类型和亚型以及它们之间的相互作用。研究小组之所以选择调查RGCs,是因为与其他主要神经元类型相比,它们是迄今为止鉴定出最多亚型的一类细胞。并且,其他视网膜细胞类型(例如,光感受器)已经在单细胞水平上被广泛研究了。因此,研究人员希望测定RGCs亚型之间的分子差异,并找到它们的独特标记。

除了鉴定新RGC亚型和生物标记,研究人员还指出了将细胞分化为这些亚型所需的基因表达变异量,并提出了从细胞型群体到亚型群体的层次结构。目前,该研究公开数据可访问UConn Health网站“RGC Subtypes Gene Browser”免费获取。

原文检索:Single cell transcriptome profiling of retinal ganglion cells identifies cellular subtypes

(生物通:伍松)

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 搜索
  • 国际
  • 国内
  • 人物
  • 产业
  • 热点
  • 科普
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号