南方医科大学发表Nature Medicine文章：肠道菌群诊断的区域化特征

　　

采样图：采样区域和肠道微生物的区域变化

来自南方医科大学珠江医院，广东省公共卫生研究院的研究人员发表了题为“Regional variation limits applications of healthy gut microbiome reference ranges and disease models”的文章，在广东省开展了迄今为止规模最大的人群肠道菌群与慢病项目——广东省肠道菌群计划（GGMP），获得了肠道菌群诊断和评估疾病风险的区域化特征研究重要进展。

这一研究成果公布在8月27日Nature Medicine杂志上，文章的通讯作者为南方医科大学珠江医院周宏伟教授，广东省公共卫生研究院马文军研究员。第一作者为何彦，吴为，郑慧敏，李攀。

以肠道菌群为代表的人体微生物组已成为众多疾病新的干预靶标，菌群检测也具有疾病诊断和风险评价的潜在价值。但准确确定特定疾病相关的菌群紊乱谱，迄今却仍存在许多挑战。

过往研究中，对于同一类疾病，其报道的相关菌谱不一致甚至出现矛盾冲突屡见不鲜，其原因尚不明晰。该现象不仅限制了菌群用于疾病诊断的可靠性，并且动摇相关菌群与疾病机制研究的信心，增加了人们对菌群理解的复杂度。

周宏伟教授团队与马文军研究员团队合作，在广东省开展了迄今为止规模最大的人群肠道菌群与慢病项目——广东省肠道菌群计划（GGMP）。通过数据挖掘，发现区域因素对菌群的影响显著大于年龄、疾病、生活方式等其他因素。而传统的疾病特征菌以及基于机器学习的菌群疾病模型，均明显受到区域化限制。不同的疾病，其区域范围也存在差异。就该项目比较的四类代谢性疾病，脂肪肝相关菌群特征更为普适，而2型糖尿病则相对范围较小。对于代谢性疾病，该研究的“本地化”范围大体在街道/镇层级。

研究结果进一步提出了理解不同疾病特征菌谱的一般化研究框架。从应用角度，该研究对当前未经大人群基础数据确认的商业化菌群检测提出了风险警示，指出大人群研究是菌群这类复杂靶标研究的重要基础和必经之路，且需要扎实的数据分析积累。

原文标题：

Regional variation limits applications of healthy gut microbiome reference ranges and disease models