准妈妈的微生物组原来在不断变化

　　

越来越多的研究表明，微生物组与人体的健康和疾病息息相关，在怀孕期间也是如此。近期一项发表在《Genome Research》上的研究发现，准妈妈的微生物组在怀孕期间会发生变化，因身体部位而异，也与某些并发症相关。

斯坦福大学、Palo Alto退伍军人医疗系统等机构的研究人员利用宏基因组测序来分析10名孕妇的阴道、肠道和口腔样本中的微生物群落。他们开始梳理怀孕期间每个身体部位的微生物多样性动态，寻找与妊娠时间或分娩并发症相关的微生物。例如，口腔和肠道中的某些微生物变化与先兆子痫一致。

文章的通讯作者、斯坦福大学的David Relman教授及其同事指出：“这项工作强调了怀孕期间微生物组的动态行为，并表明了弄清这种行为的来源对胎儿发育和妊娠结果的重要性。”

几年前，研究团队从10名孕妇的口腔、肠道和阴道中采集了样本。他们平均每周采集一次，从孕早期一直持续到分娩。他们当时对这些样本开展了16S rRNA测序分析，并将结果发表在PNAS上。

为了了解微生物组如何反映甚至影响怀孕期间发现的状况，研究人员此次利用鸟枪法宏基因组测序来分析292个样本。他们指出，在这10名孕妇中，有4名孕妇早产，而另5名出现妊娠并发症，如先兆子痫或2型糖尿病。

他们的分析表明，微生物群落中存在超过22,700个预测的蛋白编码基因和约1,553个微生物分类群，且微生物组成和多样性随时间和采样点的不同而变化。

例如，阴道微生物组中的某些微生物往往会掩盖其他微生物代表。以惰性乳杆菌（Lactobacillus iners）为主的阴道微生物组通常表现出微生物多样性增强，而以卷曲乳杆菌（Lactobacillus crispatus）为主的阴道微生物组则更加稳定。

研究人员发现，口腔和肠道微生物组在总体上通常都保持稳定，不过具体的群落组成随时间而变化。他们还指出，就口腔和肠道微生物组而言，三名患有先兆子痫的妇女与未患病的妇女有所不同。

此外，研究人员能够拼装出六种阴道加德纳菌（Gardnerella vaginalis）的基因组草图，这种细菌与早产相关，在两名早产孕妇的阴道样本中大量存在。当他们与GenBank中34个完整或部分的阴道加德纳菌基因组进行比对时，追踪到5个不同的进化枝。

尽管这项研究离临床应用尚有一段距离，但Relman预计它将有助于医生在妊娠期间制定更明智的靶向干预措施，以加强或恢复母体微生物组的重要功能，促进胎儿发育，并减少怀孕风险。（生物通 薄荷）

原文检索

Metagenomic analysis with strain-level resolution reveals fine-scale variation in the human pregnancy microbiome

Genome Research, 2018; DOI: 10.1101/gr.236000.118