首次完成多细胞动物中一个种类的长非编码RNA敲除

【字体: 时间:2019年01月11日 来源:中科院

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  这是第一篇在多细胞动物中利用基因编辑技术、在全基因组水平上、对一个种类的长非编码RNA进行敲除并系统分析其在动物中生理功能及功能机理的研究。

  

中国科学技术大学生命科学学院非编码RNA功能及功能机理研究团队近日在国际期刊《基因组生物学》(Genome Biology)发表了题为Systematic evaluation of C. elegans lincRNAs with CRISPR knockout mutants 的文章,报道了实验室最新的研究成果。该实验室通过优化的基因编辑技术,对秀丽线虫中155个基因间的长链非编码RNA(lincRNA)进行逐一敲除(秀丽线虫已知的全部lincRNA共170个),系统地研究了秀丽线虫中lincRNA的功能。

这是第一篇在多细胞动物中利用基因编辑技术、在全基因组水平上、对一个种类的长非编码RNA进行敲除并系统分析其在动物中生理功能及功能机理的研究。

研究人员对155个lincRNA敲除突变体进行六个方面表型的筛选发现,23个lincRNA突变体分别在其中一个或者两个生理表型上具有不同程度的缺陷。通过对秀丽线虫不同发育时期的转录组测序进行分析,研究了lincRNA和mRNA共表达情况,同时建立了lincRNA和microRNA共表达及调控网络。通过对秀丽线虫不同发育时期近300个转录因子的分析来探究转录因子在线虫不同发育阶段对lincRNA表达的调控,进而研究了这23个lincRNA行使其生理调控功能的机理。

研究系统地探索了lincRNA在多细胞动物中的生理功能,一定程度拓宽了lincRNA研究领域。同时该研究获得的lincRNA敲除线虫株,为后续进一步研究长链非编码RNA在衰老和疾病等中的作用提供了有力支持。文章的共同第一作者是博士生卫帅、博士后陈禾和最近博士毕业的国际学生Emmanuel Enoch Dzakah,通讯作者为中国科大教授单革。

该研究得到科技部、国家基金委和中科院“衰老的生物学基础和干预策略”先导科技专项(培育)的经费支持。

原文标题:

Systematic evaluation of C. elegans lincRNAs with CRISPR knockout mutants

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