从寒冷冰川到热带丛林,纳米孔现场测序显神威

【字体: 时间:2019年01月24日 来源:生物通

编辑推荐:

  有时,为了检测传染病,测序也需要在条件艰苦的户外进行。为此,Oxford Nanopore Technologies公司近日推出现场测序试剂盒Field Sequencing Kit,在无需冷链的情况下能够完成基因组DNA的文库制备。

测序,并不是都在设施完善的实验室中进行。有时,为了检测传染病,测序也需要在条件艰苦的户外进行。为此,Oxford Nanopore Technologies公司近日推出现场测序试剂盒Field Sequencing Kit,在无需冷链的情况下能够完成基因组DNA的文库制备。

此试剂盒以400 ng高分子量DNA作为起始材料,利用两步法方案可在10分钟内生成文库。转座酶在切割模板分子的同时加上标签。值得一提的是,未开封的试剂盒可在30° C放置一个月,或在2-8° C放置三个月。

一直以来,生命科学行业都依赖冷链物流来运输试剂,这使得人们很难在实验室以外的偏远地区采用测序技术。为了打破这种依赖性,Oxford Nanopore开发出Field Sequencing Kit。

这款试剂盒在运输时不需要冷冻包装,在一个月内使用时也无需冷藏。它包含冻干的测序试剂,只需要极少量的实验室设备,即可制备测序文库。若试剂盒未开封,可在30° C放置一个月,或在2-8° C放置三个月。

目前,Field Sequencing Kit已经受了多个极端环境的测试,从格陵兰岛到热带丛林。Oxford Nanopore认为,这款试剂盒将开辟传统实验室以外的测序新局面。

乔治城大学的Sarah Johnson及其团队就在遥远的冰岛使用了现场测序试剂盒。他们采用这种技术来鉴定冰川土壤和水样中的细菌。仅仅30分钟的样本处理后,研究团队就能够从MinION测序仪上获取实时的测序信息。

“我们最终能够在现场完成整个过程,从原始样本到分析好的数据。看到我们所有的努力融合在一起,为我们带来了样本的信息,以及在现场可以开展哪些实验,真令人兴奋,”研究人员谈道。

意大利维罗纳大学的Massimo Delledonne与Taxon Expeditions组织的合作者在科学考察时也使用现场测序试剂盒,以便发现新物种,并了解各种环境中野生动物的进化和多样性。

研究人员曾前往婆罗洲、黑山和刚果等多个生物多样性丰富的地区。去年9月,他们前往马来西亚婆罗洲时,就使用了现场测序试剂盒。顺便提一下,这个组织去年还在婆罗洲发现了一种全新的甲虫,并将其命名为Leonardo DiCaprio(莱昂纳多•迪卡普里奥)。

即使在格陵兰岛,现场测序试剂盒也能发挥作用。阿伯里斯特维斯大学的Arwyn Edwards及其同事将纳米孔流动槽放在胸前口袋中保暖,并使用最先进的笔记本电脑,最终成功提取出DNA,并利用MinION测序仪开展宏基因组测序。

Oxford Nanopore公司表示,他们将继续开发一系列解决方案,以便人们更加广泛地使用纳米孔测序技术。(生物通 薄荷)

我来说两句
0  条评论    0 人次参与
登录 注册发布
最新评论刷新
查看更多评论 > >

订阅生物通快讯

订阅快讯:

最新文章

限时促销

会展信息

关注订阅号/掌握最新资讯

生物通首页 | 今日动态 | 生物通商城 | 人才市场 | 核心刊物 | 特价专栏 | 仪器龙虎榜

版权所有 生物通

Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

联系信箱:

粤ICP备09063491号