QIAGEN推出新品,同时制备DNA和RNA测序文库[新品推荐]

【字体: 时间:2019年11月13日 来源:生物通

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  在近日召开的2019年美国分子病理学会年会上,QIAGEN宣布QIAseq NGS产品家族添了新成员。QIAseq® Multimodal Panel能够在一天的时间内利用一份样本同时制备DNA和RNA测序文库。

在近日召开的2019年美国分子病理学会年会上,QIAGEN宣布QIAseq NGS产品家族添了新成员。QIAseq® Multimodal Panel能够在一天的时间内利用一份样本同时制备DNA和RNA测序文库。

新一代测序(NGS)技术的进步让研究人员能够检测生物样本中的DNA和RNA变化。不过,目前的方法需要采用两套不同的流程来制备DNA和RNA的文库,且需要较大的样本量才能生成文库并测序。这个过程不仅复杂,费用高,周转时间也很长。

不同于以往需要通过两套流程分别检测DNA与RNA的方式,QIAseq Multimodal Panel通过整合的NGS流程,在一管反应中一次性构建DNA和RNA两种文库,可同时检测单个样本中的DNA变异、RNA融合以及基因表达水平,而核酸起始量低至10 ng。

这个前所未有的解决方案将以往2-3天的流程缩短到9小时左右。而且,两个文库都是从同一样本生成的,这不仅提高了样本利用率,也降低了采样引起的偏倚。如此一来,实验室能够利用这一方案检测各种生物标志物,包括SNV、InDel、CNV、RNA融合、外显子跳读和基因表达水平。

QIAseq Multimodal Panel之所以能够同时对DNA和RNA文库进行靶向扩增而文库之间却互不影响,主要得益于QIAGEN特有的单端特异性引物延伸 (Single Primer Extension, SPE) 技术。与一般的扩增子技术不同,SPE技术能够实现在一个反应管中最多兼容2万条特异性引物的PCR反应,而特异性依旧可高达90%以上。

此外,在每条原始模板上引入的特异分子条形码 (Unique Molecular Indices, UMI) ,有效解决PCR扩增所带来的偏倚,为检测的准确性、灵敏性及全面性提供了前所未有的保证。数据表明,通过QIAseq Multimodal以及分别使用QIAseq Targeted DNA 和RNAscan Panel对标准样本进行检测,DNA突变及RNA融合检测结果高度一致。

作为QIAseq Multimodal的早期试用者,NeoGenomics Laboratories的研发副总裁Vincent Funari表示:“我们利用全新的QIAseq Multimodal Panel实现了肿瘤的全面分析。这种组合的解决方案让我们能够从同一样本中获得更多见解,而无需大幅增加周转时间。同时拥有基因组和转录水平信息,我们的实验室能够扩大分析内容以满足新的需求,从而节省了员工的时间。”

目前,QIAGEN基于QIAseq Multimodal Panel系统已经推出针对肺癌、肉瘤、白血病检测的预制化产品,并能够根据用户的特殊检测目标提供定制产品。

立即索取QIAseq Multimodal Panel及更多建库产品的资料

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