Nature子刊：一种免费工具有助于简化癌症研究

　　

每个细胞中都包含大量蛋白质，每种蛋白质都有特定的功能，例如作为另一个分子的受体或催化化学反应的酶。这种机制的紊乱会严重影响细胞，引起疾病，出现癌症等疾病。对于这些细胞来说，它们的功能已经与健康细胞产量了根本不同。

因此，以蛋白质为靶标的药物非常普遍，药物可以抑制或刺激蛋白产生或吸收。但同时，有许多批准的药物对某些疾病具有经过验证的作用，但没有已知的蛋白质靶标。对于这些药物，它们的作用机理依然还是，或者说部分还是谜团。

为此，近期来自瑞典卡罗林斯卡研究所的科学家对开发一种相对简单的方法，这种方法能够确定哪种蛋白质受某种药物影响。实际上已经有一些方法具有这种功能，但各自都有局限性。最新研究提出的方法能带来提供更加可靠和精确的结果。

这一成果公布在Nature Communications杂志上， 由生物化学和生物物理学系教授ROMAN ZUBAREV领导完成。

瑞典卡罗林斯卡研究所生物化学和生物物理学系教授Roman Zubarev

研究人员在56种不同药物治疗的肺癌细胞中展开了研究，由此开发出了这一新工具。

对于每种药物，研究人员首先计算出48小时后杀死一半细胞的剂量，然后将此剂量用于​​所有药物。一旦一半的细胞死亡，他们将检查每个细胞的蛋白质组（即存在哪些蛋白质及其丰度），确定药物靶向的蛋白质。在进一步的实验中，他们在乳腺癌和肠道肿瘤的其他细胞上测试了药物，并得出了关于药物在靶向癌细胞方面具有特异性或普遍性的结论。

这些实验的结果在研究人员现在创建的可搜索数据库中进行了描述（http://protargetminer.genexplain.com），从而其他研究人员能够使用相同的模型对其他药物进行类似的实验，进而用更多的靶蛋白来扩展更多物质的数据库。

Zubarev教授说：“我们发现细胞被不同的药物杀死的方式不同。不久前，我们曾经以为细胞只能以三种方式死亡：坏死，凋亡或自噬，但现在我们已经观察到至少十三种不同的细胞可以死亡的方式。这种方法可以帮助加速某些新药开发过程，增进我们对现有药物的了解。”

（生物通）

原文标题：

ProTargetMiner as a proteome signature library of anticancer molecules for functional discovery