Nature子刊:一种新颖的高灵敏表观基因组技术

【字体: 时间:2019年12月05日 来源:生物通

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  这种方法十分新颖,因为到目前为止,常规方法每次测定都需要数千万个细胞。而通过这种新的测序方法,该团队发现他们可以每个测定只需要少至100个细胞,一次运行即可完成多达8个测定。

  

关于疾病,以及我们的身体对疾病的反应方式,至今我们仍然知之甚少,部分原因在于人类基因组是一个完整的DNA组装体,我们每个人都有独一无二的序列。

弗吉尼亚理工大学的一个研究小组近期研发了一种新的表观基因组技术,可以帮助我们了解人体如何对抗疾病。这一研究成果公布在Nature Protocols杂志上。


从左到右,Bohan Zhu 和Yuan-Pang Hsieh、Chang Lu

弗吉尼亚理工大学化学工程学教授Chang Lu和他的两个博士生:Bohan Zhu和Yuan-Pang Hsieh,研发了一种介绍了微流体新技术,可以研究从乳腺癌、脑癌到精神分裂症和药物成瘾等多种疾病。

Chang Lu表示:“由于缺乏先进和精确的技术,即使经过了多年的研究,许多疾病的分子基础仍然难以捉摸。”

最新文章介绍了开发的这一新技术有关的设备制造,设置和操作的详细说明,该技术是基于微流体振荡洗涤的染色质免疫沉淀,其次是称为MOWChIP-seq的测序方法,这种方法是一种低输入技术,使用最少100个细胞即可表征表观基因组。

这种方法十分新颖,因为到目前为止,常规方法每次测定都需要数千万个细胞。而通过这种新的测序方法,该团队发现他们可以每个测定只需要少至100个细胞,一次运行即可完成多达8个测定,生成组蛋白修饰图。

Lu说:“通过比较正常和患病的表观基因组,可以发现有用的标记和模式,可以将其用于基于个体患者表观基因组特征的精准医学。”

这项研究基于Lu先前在开发MOWChIP-seq方面的工作,该工作于2015年在Nature Methods论文上首次发表。Lu和他的前博士生Zhenning Cao也由此申请并获得了美国专利。与2015年的原始出版物相比,Lu和他的团队在最新方案中详细介绍了他们最近在自动化MOWChIP-seq过程和一次运行并行处理八个样本方面的工作。

这一技术的流程是半自动化的,可减少人工,提高可重复性,并且具有可扩展性。

(生物通)

原文标题:

Unveiling how intramolecular stacking modes of covalently linked dimers dictate photoswitching properties


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