两篇《柳叶刀》:外显子组测序可改善产前诊断

【字体: 时间:2019年02月13日 来源:生物通

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  根据权威医学杂志《The Lancet》(柳叶刀)上最新发表的两项研究,在产前诊断中增加全外显子组测序,可以改善胎儿的基因诊断,发现胎儿的结构异常。

  

根据权威医学杂志《The Lancet》(柳叶刀)上最新发表的两项研究,在产前诊断中增加全外显子组测序,可以改善胎儿的基因诊断,发现胎儿的结构异常。

超声波检查发现大约3%的妊娠存在胎儿异常,而后续的核型分析和染色体芯片分析发现,这些病例中大约三分之一存在异常核型,而另外6%存在与疾病相关的拷贝数变异。

最近的两项研究致力于了解,产前的全外显子组测序是否能够改善胎儿的基因诊断。两组研究人员对父母-胎儿开展了家系外显子组测序,并得出了相似的结论:增加测序有望从8-12%的胎儿中发现临床上有意义的变异。

哥伦比亚大学基因组医学研究所的Ronald Wapner表示:“根据我们的研究结果,全外显子组测序可作为标准的产前基因检测的补充,有望通过明确的诊断来改善遗传病患儿的围产期护理,并缓解父母的恐惧。”

在他们的前瞻性队列研究中,Wapner及其同事对234个家系开展全外显子组测序,这些胎儿有正常的核型和染色体芯片结果,但超声波检查发现结构异常。之后,他们筛查测序数据,以寻找致病变异。

研究人员报告称,在这234个胎儿中,有24个胎儿被发现带有致病性或可能致病性的遗传变异,诊断率达到10%。其中,63%的变异是新生突变,不过有3例是常染色体显性突变,从未确诊的父母那里遗传得到。

他们认为,在胎儿出现异常的情况下,若使用核型检测和染色体芯片无法确定其原因,那么全外显子组测序可以带来临床相关的信息,协助医生管理妊娠。随着更多变异的发现,这种方法有望在未来进一步提高诊断率。

无独有偶,英国的研究人员也开展了一项前瞻性队列研究,对596个家族的外显子组开展了测序。这些胎儿存在结构异常,但非整倍体或拷贝数变异CNV检测结果为阴性。之后,他们评估了184个与发育障碍相关的基因,以鉴定321个变异。

研究人员发现,52个(8.5%)胎儿存在与结构异常相关的致病性或可能致病性的变异。他们还指出,另外20多个胎儿带有遗传变异,不过无法诊断,需要额外的临床和分子检测。若将这些变异包含在内,则可以将诊断率提高到12.5%。

两个研究小组补充说,他们的诊断率随着胎儿结构异常的数量而发生变化。对于存在多处异常的胎儿,Wapner团队的诊断率为19%,英国团队为15.4%。此外,诊断率也随着异常发生的部位而变化,如骨骼异常的胎儿诊断率更高。(生物通 薄荷)

原文检索

Whole-exome sequencing in the evaluation of fetal structural anomalies: a prospective cohort study

Prenatal exome sequencing analysis in fetal structural anomalies detected by ultrasonography (PAGE): a cohort study

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