Oxford Nanopore发布小巧经济的测序设备Flongle

【字体: 时间:2019年03月18日 来源:生物通

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  Oxford Nanopore公司本周推出了一款新的测序设备——Flongle流动槽适配器,允许用户开展更小型的测序分析。它引入了一种测序新模式,能够以经济的价格快速获得丰富的数据。

Oxford Nanopore公司本周推出了一款新的测序设备——Flongle流动槽适配器,允许用户开展更小型的测序分析。它引入了一种测序新模式,能够以经济的价格快速获得丰富的数据。

据介绍,Oxford Nanopore的目标是让任何人在任何地点实现任何生物的分析。Flongle的出现离这个目标又近了一步。它体积小巧,让用户能够在任何地点开展测序分析,包括实验室、农场、医疗机构或户外环境。

Flongle其实是MinION和GridION X5测序仪的适配器(adapter),仅供一次性使用。它与Oxford Nanopore的其他设备采用相同的纳米孔测序技术,产生实时的测序数据。不同于MinION流动槽含有512个通道,Flongle含有126个通道。它目前最多能生成1.8 Gb数据,理论上最高产量超过3 Gb。

因此,它适合多个类型的测序应用,包括小型基因组测序、靶向panel或扩增子测序,以及宏基因组测序,从而鉴定病毒和细菌以及确定微生物组。它还适用于大型纳米孔实验的质量控制。

Flongle的价格低至90美元,能够以经济的价格实现随时随地的测序,而不用像以往那样集齐一批样本。整个测序流程简单快速,文库制备低至10分钟,并且采用实时的数据分析。

伯明翰大学的Matt Loose博士在早期试用计划中测试了Flongle。“我们一直在用它来测试和开发新方案,比如在CRISPR实验中选择靶向区域,以及在PromethION大规模运行之前测试新样本。我们对通量和产量非常满意,期待早日将量产的Flongle整合到我们的流程中,”Loose博士谈道。

加州大学圣克鲁兹分校的Miten Jain也一直在试用Flongle。“Flongle测序是检验文库的最好办法。我们通常在Flongle流动槽上测序RNA和DNA文库,然后在PromethION上大规模运行。我们发现,Flongle测序能够很好地预测文库质量和后续测序表现。它将成为我们未来纳米孔测序工作不可或缺的一部分。”

Oxford Nanopore目前已推出Flongle新用户套装。这些套装包括Flongle适配器,而用户可选择在MinION或GridION设备上运行。用户也可以额外购买流动槽,价格为每个90美元。样品制备试剂盒与MinION、GridION和PromethION兼容。(生物通 薄荷)

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