对于不明原因的肝病，外显子组测序显神威

　　

据统计，大约两成肝病患者患有“不明原因的肝病”，就是将甲、乙、丙、丁、戊型肝炎病毒全查一遍，也找不到致病的原因。这让医生和患者都很郁闷。不过，最新研究表明，外显子组测序能够发现部分患者中的突变。

耶鲁大学医学院和密歇根大学的研究人员近日对19名不明原因的肝病患者进行了深度表型分析和外显子组测序分析。他们成功地对其中5名患者进行了诊断，发现了四种单基因疾病。这项成果发表在《Journal of Hepatology》杂志上。

耶鲁大学医学院的Silvia Vilarinho及其同事表示：“我们提供了数据，支持外显子组测序（WES）在不明原因肝病患者的诊断和管理中的作用，这可能涉及到其他疾病。”

耶鲁大学在2015年10月至2018年8月期间招募了19名原因不明的肝病患者，他们没有过量饮酒史，诊断时的年龄介于22岁至73岁，利用Illumina测序仪，研究人员对这些患者的蛋白质编码区域进行了测序。

他们将这些序列与人类参考基因组进行比较以鉴定变异，同时利用一种专有的程序来获取外显子组中的拷贝数变异。通过这些分析，他们成功对5名亚洲、欧洲和非洲裔患者进行了诊断，发现他们患有四种不同的单基因疾病。

研究人员解释称，追踪这些变化不仅有助于部分病例的诊断，还有助于人们深入了解肝病生物学、与各种突变相关的临床表现，以及个别患者的潜在治疗方法。

对于一名肝病患者，他们发现了影响PPARG基因的杂合突变，此基因的改变与家族性部分脂肪营养不良3型有关。于是，研究人员采用了瘦素替代疗法，改善了该患者的几种症状。

研究人员还发现两名患者的ABCB4基因中存在隐性突变，导致多药耐药蛋白3（MDR3）出现缺陷。对于另外两名患者，外显子组数据指向了纯合的NDUFB3变异和杂合的APOB变异，这两种变异分别引起非酒精性脂肪性肝炎和肝脏脂肪变性。

基于这些发现，作者认为“一部分患有不明原因肝病的成年患者，存在潜在的孟德尔遗传病，这种疾病在整个童年期间可能无法判断，直到他们进行基因检测”。

在同期杂志的一篇相关社论中，梅奥诊所的Filippo Pinto e Vairo和Konstantinos Lazaridis表示，这项研究强调了外显子组测序在诊断不明原因肝病患者的孟德尔疾病上的重要性，即使没有家族病史。

他们指出，新诊断的个体都不到40岁，这表明外显子组测序方法可能对年轻患者特别有益。他们主张对40岁之前出现症状的患者进行外显子组测序。（生物通 薄荷）

原文检索

Clinical utility of genomic analysis in adults with idiopathic liver disease

DOI: https://doi.org/10.1016/j.jhep.2019.01.036