畅享建库黑科技,轻松完成RNA测序[新品推荐]

【字体: 时间:2019年04月24日 来源:生物通

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  样品制备往往成为测序的限速瓶颈,步骤多,耗时长。为此,QIAGEN发布了几项测序“黑科技”,助力你在RNA测序之前轻松制备文库。

良好的开端等于成功的一半,这句话特别适用于新一代测序。样品质量在很大程度上决定了测序结果。然而,样品制备往往成为测序的限速瓶颈,步骤多,耗时长。为此,QIAGEN发布了几项测序“黑科技”,助力你在RNA测序之前轻松制备文库。

一号“黑科技”

在RNA测序过程中,首先要解决的问题是如何去除核糖体RNA(rRNA)。这些rRNA在平时抽提到的总RNA中占到80%以上。它们所含的转录组信息很少,浪费了宝贵的测序资源,也让mRNA和非编码RNA的检测变得困难。同时,在对血液样本进行RNA测序时,球蛋白(globin)mRNA也产生了无任何价值的数据。

目前,相关的RNA去除方法基本上都是采用磁珠纯化(基于杂交捕获)或通过特定酶消化来完成的。不过,它们通常需要若干个手动操作步骤,而且需要2小时才能完成,大大降低了文库制备的效率。

QIAGEN的一号“黑科技”QIAseq FastSelect RNA Removal Kit可通过极为简单的超快速流程,高效去除组织细胞、FFPE、血清血浆、外泌体等各类样本中超过99%的rRNA和(或)globin mRNA。

制备过程仅需简单的1步加样操作,而类似试剂盒至少需要29步。将FastSelect试剂加入到RNA样品中,与总RNA直接结合,随后通过加热片段化过程(可选)及程序性降温孵育(从75ºC到25ºC),在20分钟内即可完成rRNA去除,而无需任何额外的纯化步骤。据介绍,此款产品可与QIAseq Stranded RNA Library Kit或其他任何RNA建库试剂盒兼容。

此外,QIAseq FastSelect也经得起各种考验和比较。研究人员利用poly-A富集、QIAseq FastSelect及同类试剂盒来处理100 ng通用型人类参考RNA(UHRR)样品,并将测序结果进行比较。他们发现,QIAseq FastSelect显示出极高的rRNA去除效率,并对需要保留的其他类型RNA具有极高的保留率。

在针对FFPE等疑难样品时,QIAseq FastSelect也同样有着十分优异的表现。从正常和肺癌组织的FFPE样本中提取总RNA后,采用QIAseq FastSelect及同类试剂盒进行rRNA去除平行处理并完成后续建库测序过程,之后对产生的结果进行分析。QIAseq FastSelect除了操作简便、耗时更短之外,也能够更有效地去除FFPE样品中的rRNA,有助于实现更为精准灵敏的检测。

二号“黑科技”

QIAseq Stranded RNA Library Kit便是QIAGEN的二号“黑科技”。它通过独特优化的实验流程,无需使用放线菌素D或dUTP,即可简单快速地生成高质量的链特异性RNA文库,并且很好地兼容FFPE等出现降解的特殊样本。

此外,利用试剂盒内置的CleanStart PCR方案在实现高保真文库扩增的同时,还可利用特殊的设计流程对前序残留的文库污染进行清除,防止样本间文库交叉污染的发生,非常适合于大规模高要求的建库实验室,结合之前更为“天然”的文库构建方案,可确保获得极为高质量的RNA文库构建结果。

如今,有了这两项测序“黑科技”,您对RNA文库构建肯定是信心倍增吧。还有一个好消息,现在购买24或96次反应包装的QIAseq FastSelect RNA Removal Kit,即可赠送同等包装规格的QIAseq Stranded Total RNA Library Kit。赶紧联系QIAGEN抢购吧。

深入了解QIAGEN测序黑科技,轻松制备测序文库

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