130万名个体筛查发现与血压相关的稀有变异

【字体: 时间:2020年11月25日 来源:生物通

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  最近,剑桥大学、伦敦玛丽女王大学等机构领导的大型研究团队采用特殊的变异关联方法,对血压性状进行了大规模的分析。

  

到目前为止,血压(blood pressure)的遗传研究主要集中在常见变异上,也就是次要等位基因频率 > 0.05的变异。最近,剑桥大学、伦敦玛丽女王大学等机构领导的大型研究团队采用特殊的变异关联方法,对血压性状(包括高血压)进行了大规模的分析。

这项成果于11月23日发表在《Nature Genetics》杂志上。研究人员发现了106个与血压性状相关的新位点,以及87个稀有变异(次要等位基因频率 ≤ 0.01)。

“我们的研究结果表明,稀有的血压相关变异导致了普通人群的血压变化,其鉴定为人们提供了候选基因和潜在致病途径的信息,”通讯作者Joanna Howson和Patricia Munroe及其同事在文中写道。

研究人员此次收集了130多万名个体的外显子组和基因分型芯片数据。这些人曾参与英国生物样本库(UK Biobank)等研究计划,主要包括欧洲人、非裔美国人、南亚人和西班牙人。他们搜索了与四个血压性状相关的稀有变异:高血压、收缩压、舒张压或脉压。

他们没有像往常一样采用全基因组关联研究(GWAS),而是开展了外显子组芯片关联研究(EAWAS)和以稀有变异为重点的全基因组关联研究(RV-GWAS),以及精细作图和具体基因分析,来寻找与血压性状相关联的稀有变异。

“以往的大多数血压研究主要集中在常见变异的关联上,我们的研究则不同,它主要对稀有变异进行了广泛的分析,无论是单独分析还是整合分析,”作者解释说。

通过EAWAS和RV-GWAS方法,研究人员发现了106个以前未检测到的基因位点,以及87个与血压相关的稀有变异。他们强调,与1,000多个常见变异相比,单个稀有变异的影响更大。RP11和VTN基因附近的两个新位点与所有的血压性状都存在关联。

研究人员还发现,与血压相关的变异,包括稀有变异和常见变异,集中在胎儿组织中活跃的染色质区域,这些区域参与了胎儿血管、心脏、肌肉及其他组织或器官的发育。有些变异所在的基因与先天性心脏缺陷存在潜在关联,或在心脏发育过程中表达增强。

基于这些结果,作者认为“心脏组织的早期发育和/或重塑可能是后续发育过程中血压调节的重要驱动力”。未来,他们打算对参与英国生物样本库或其他项目的个体进行更多的稀有变异关联研究。(生物通 薄荷)

原文检索

Surendran, P., Feofanova, E.V., Lahrouchi, N. et al. Discovery of rare variants associated with blood pressure regulation through meta-analysis of 1.3 million individuals. Nat Genet (2020). https://doi.org/10.1038/s41588-020-00713-x

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