使用RNA测序技术首次了解人类精子的微生物组

研究利用RNA测序技术对人类精子微生物组进行分析，利用人类精子RNA-seq数据评估射精内相关微生物组多样性的能力。

　　

Wayne州立大学医学院，CReATe生育力中心和马萨诸塞州Amherst大学的研究团队发表的一项新的合作研究首次深入研究了利用RNA测序技术对人类精子微生物组进行分析，识别其中的致病细菌定植和污染。

该研究旨在评估人类精子RNA-seq数据评估射精内相关微生物组多样性的能力。

方法
收集精液样本，并在收集时评估精液参数。分离出精子RNA并进行RNA-seq。通过将未映射到人类基因组的测序读数与RNA-Seq之后的NCBI RefSeq细菌，病毒和古细菌基因组进行比对来确定微生物的组成。

结果
根据微生物相关RNA来表征每个样品中的微生物组成。已知与男性生殖道有关的细菌以相似的水平存在，一个例外异常值与所有其他样本均存在显着差异。异常样本显示链球菌急剧增加，多个测试表明存在两种 S. agalactiae 和 S. dysgalactiae (p = 0.009), 。

结论
这些结果为微生物组作为人类精子RNA测序的组成部分提供了初步认识，人类精子RNA测序具有足够的灵敏度来识别污染或潜在的病原性细菌定植。

CS Mott 的Stephen Krawetz博士说：“我们证明了对人类精子RNA的非靶向测序，具有提供其中微生物（细菌，病毒，古细菌）概况的潜力。”“这些信息是从常规核酸测序中舍弃的一部分数据中回收的。与目前的方法相比，测序技术的灵敏度和特异性增强了，可作为微生物状况的诊断工具，作为常规评估的一部分。我们将转向个性化护理。”

发表在《辅助生殖与遗传学杂志》上的这项研究“ 人类精子RNA-Seq告诉我们有关微生物组的内容 ” 旨在确定与目前的定向培养方法相比，人类精子RNA测序数据是否可以提供一种敏感的方法来检测包括细菌在内的微生物、病毒和古细菌。研究人员收集了85个精液样本，分离出精子RNA并进行了RNA测序。

与Krawetz博士合作的博士后研究员Grace Swanson博士发现了一个微生物序列水平异常高的样品。仔细观察后，发现样品中含有大量无乳链球菌细菌。该细菌是怀孕和分娩后新生儿感染的主要原因，与早产中的高死亡率相关，在成年人，特别是老年人中，这种细菌也可能危及生命。

用于测试男性生殖道微生物组的当前方法依赖于培养样品。该研究报告说，培养样品可能是有限制性的，因为大多数病原体无法培养。RNA测序的成本已大大下降，并将继续下降，这将有望提供对人类生物群系的更完整描述。

“鉴于链球菌（agalactiae）以及成人，新生儿和新生儿中链球菌感染的近期增加和严重程度，非靶向人类精子RNA测序数据除了可以提供生育状况外，还可以作为诊断微生物状况的有用工具。 ”，Krawetz博士说。