哪些病毒引发哪些癌症？Nature Genetics发表系统性病毒与癌症精确关系

　　

德国癌症研究中心的科学家系统地研究了来自38个不同类型癌症患者的2,600多个肿瘤样本DNA，在这些研究样本的13％中他们发现了病毒。此外研究人员还确定了病原体触发DNA致癌突变的机制。

这一研究发现公布在Nature Genetics杂志上，这项工作是国际癌症基因组联盟（ICGC）发起的全基因组泛癌基因分析（PCAWG）的一部分。

世界卫生组织（WHO）估计，所有癌症中有15％以上直接或间接归因于传染性病原体。里昂国际癌症研究机构（IARC）已将11种不同的病原体（病毒，细菌和线虫）归为致癌物质，并估计十分之一的癌症与病毒有关。全世界每年仅由人乳头瘤病毒（HPV）引起的癌症就有640,000例。

由德国癌症研究中心（DKFZ）的Peter Lichter领导的国际基因组研究团队最新发表了一篇新论文，提供了有关哪些病毒在哪些癌症中起作用的精确概述。研究人员还寻找了以前与致癌作用甚至完全未知的病毒。本研究的第一作者，DKFZ的Marc Zapatka解释说：“与癌症有关的病毒问题与医学密切相关。这是因为与病毒有关的癌症，是真正的可以预防的：如果发现了致癌病毒，就有机会避免被感染，从而预防癌症的发展。”

DFKZ小组在356名癌症患者中发现了总共23种不同病毒类型的痕迹。不出所料，最常见的已知肿瘤引发和生长的病毒驱动因素是：EBV，已知会引起多种不同类型的癌症，尤其是淋巴瘤，胃癌和鼻咽癌。在330例肝癌中有62例发现了乙肝病毒（HBV）的DNA。

研究人员还在宫颈癌（研究的20例癌症病例中的19例）和头颈部肿瘤（57例中的18例）中发现了人类乳头瘤病毒，最常见的是HPV16。

在一些情况中，研究小组还发现了其他已知会引起癌症的病毒，例如肾癌中的逆转录病毒。有时在正常感染的组织类型肿瘤中发现其他病原体，例如胃癌中的巨细胞病毒。尽管进行了全面的生物信息学分析，但是研究人员并未发现任何完全未知的病毒。

在一些与HPV和EBV相关的肿瘤中，研究人员观察到，这些癌症类型的细胞正常生长所依赖的特征性驱动基因突变缺失了，这说明病毒的存在可能通过其他因素支持了恶性细胞的变性。

DKFZ研究人员确定了针对病毒的细胞防御是导致被感染细胞DNA突变的另一个关键机制：细胞利用其APOBEC蛋白攻击危险病毒的DNA，但这通常也导致细胞自身基因组的突变。结果，例如在HPV感染后可能会出现子宫颈癌和头颈部肿瘤。

“在分析整个癌症基因组时，我们发现的病毒痕迹比以前仅基于研究RNA的早期研究多得多，尽管如此，我们仍无法得到确定性的结论，”Peter Lichter说， “但是我们现在对病原体在许多情况下，如何引起细胞恶性突变有了更清晰的认识。”

（生物通）

原文标题：

PCAWG Consortium: The landscape of viral associations in human cancers. Nature Genetics 2020, DOI: 10.1038/s41588-019-0558-9