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PLoS Biology:新的小型CRISPR/Cas9工具

【字体: 时间:2020年04月21日 来源:复旦大学

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  研究者开发出了一个新的小型CRISPR/Cas9工具,具有活性高(和SaCas9相当)、编辑范围大的优点。该Cas9来源于耳氏葡萄球菌(Staphylococcus auricularis),被命名为SauriCas9,识别NNGG PAM序列,编辑范围与常用的SpCas9一样。

SpCas9是最常用的基因编辑工具,具有活性高、编辑范围大的优点(识别NGG PAM)。但是SpCas9比较大,不能被包装到AAV病毒中用于基因治疗。随后科研人员开发出了几个小型CRISPR/Cas9工具,能够被包装到AAV病毒中。其中SaCas9活性较高,但是编辑范围小(识别NNGRRT PAM)。其它几个小型CRISPR/Cas9活性偏低。

近期,复旦大学王永明课题组联合复旦大学王红艳课题组在PLOS Biology上在线发表了题为“A compact Cas9 ortholog from staphylococcus auricularis (SauriCas9) expands the DNA targeting scope”的研究论文。研究者开发出了一个新的小型CRISPR/Cas9工具,具有活性高(和SaCas9相当)、编辑范围大的优点。该Cas9来源于耳氏葡萄球菌(Staphylococcus auricularis),被命名为SauriCas9,识别NNGG PAM序列,编辑范围与常用的SpCas9一样。

SauriCas9通过AAV病毒包装后,在多种细胞类型中实现了基因编辑(图),说明SauriCas9具有用于基因治疗的潜力。

此外,研究者还把SauriCas9与脱氨酶融合,制作了两种新的碱基编辑器,本别是SauriBE4max和SauriABEmax,可以实现C-T或者A-G两种碱基转换。


参考文献:

Jinek M, Chylinski K, Fonfara I, Hauer M, Doudna JA, Charpentier E. A programmable dual-RNA-guided DNA endonuclease in adaptive bacterial immunity. Science. 2012;337(6096):816-21.
Wu Z, Yang H, Colosi P. Effect of genome size on AAV vector packaging. Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy. 2010;18(1):80-6.
Ran FA, Cong L, Yan WX, Scott DA, Gootenberg JS, Kriz AJ, et al. In vivo genome editing using Staphylococcus aureus Cas9. Nature. 2015;520(7546):186-91.

https://journals.plos.org/plosbiology/article?id=10.1371/journal.pbio.3000686

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