25种癌症三维组织模型表观遗传学图谱

【字体: 时间:2020年05月12日 来源:

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  科学家们利用3D模型来分解癌细胞的DNA行为,这是一项突破性的新研究,可能会彻底改变癌症治疗。

  

这是一个癌症类器官↓

科学家们利用3D模型来分解癌细胞的DNA行为,这是一项突破性的新研究,可能会彻底改变癌症治疗。

在Josep Carreras白血病研究所主任Manel Esteller博士领导下,科学界第一次用3D模型(类器官)描述了人类癌症的表观遗传指纹。文章发表在《Epigenetics》杂志。

Esteller博士解释道:“通常,有希望的癌症治疗方法在实际的临床环境中都会失败。尽管有许多新治疗方法在实验室临床前阶段显示出了有希望的结果,但这种情况还是经常发生。一种解释是,早期研究阶段使用的许多肿瘤模型都是在二维(2D)培养瓶中建立的细胞系,这些细胞系已经生长了几十年。这些癌细胞可能不完全类似于从病人身上扩展到三维(3D)的真实肿瘤的特征。直到最近,我们才开始在实验室里‘种植’癌症,这种3D结构被称为类器官(organoids)。我们对这些细胞知之甚少,它们是否真能模仿体内肿瘤的构象,特别是DNA的化学行为(我们称为修饰),表观遗传学,如DNA甲基化。

“我们的文章解决的是癌症研究领域未满足的生物医学需求:人类癌症器官的表观遗传指纹特征。已开发的研究表明,这些肿瘤模型对生物医学研究界和制药公司开发抗癌药物非常有用。”

Esteller教授专门研究了25种人类癌症器官,这些器官来自美国类型培养收集(ATTC),他说,在他们的研究过程中,研究小组围绕癌细胞的特性做出了一些有趣的发现。

“首先,我们发现每一种癌的类器官都保留了原发组织的特性,因此这表明,如果样本是从结肠癌或胰腺癌手术中获得的,类器官与原发肿瘤非常相似。

“其次,我们发现正常细胞没有受到污染,因此,可以在没有干扰的情况下分析纯转化的恶性细胞。最后,与常用的二维细胞系相比,三维类器官癌更接近患者的肿瘤。

他们现在正应用这项研究形成大数据,以便其他研究人员从易于访问的公共数据库中共享,促进更多的合作研究。

Esteller博士解释说:“通过数据挖掘,使用不同的生物测定方法或专注特定基因,这将进一步促进新的癌症发现。

“而且最重要的是,癌症类器官可以方便地从可靠的提供者(例如ATCC)获得。研究人员可以利用这些可共享样本的表观遗传信息来开展他们自己的研究。”

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原文检索:Identification of 20 novel loci associated with ischaemic stroke. Epigenome-wide association study

(生物通:伍松)

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