生物通 | 新技术专栏

长片段DNA打断,无需打断仪,搭配离心机即可轻松打断!

【字体: 时间:2020年08月24日 来源:基因有限公司

编辑推荐:

  单分子测序,mate-pair测序等往往需要长片段基因组DNA,基因有限公司代理的Covaris g-TUBE仅需搭配离心机使用,轻松实现6-20kb的长片段DNA打断,是三代测序Pacbio等推荐的长片段DNA打断耗材。

单分子测序,mate-pair测序等往往需要长片段基因组DNA,基因有限公司代理的Covaris g-TUBE仅需搭配离心机使用,轻松实现6-20kb的长片段DNA打断,是三代测序Pacbio等推荐的长片段DNA打断耗材。

突破性的DNA剪切技术

▪ 剪切DNA片段范围:6kb-20kb
▪ 简单易用的剪切耗材,仅需搭配离心机
▪ 结果高度可重复
▪ 密闭打断,>90%的高样本回收率
▪ 整个过程仅需3min,可同时处理多达24个样品
▪ 满足二代mate-pair、三代单分子测序等应用长片段DNA需求
 
g-TUBE的原理是利用离心力推动样品通过精确制造的孔口,对样本产生剪切力,从而使DNA片段化。通过调整离心机转子转速和时间,改变通过孔口的流量,从而改变剪切力,达到控制剪切片段大小的目的,较高的离心转速将产生较短的DNA片段,参照Protocol设置离心转速和时间,即可剪切得到目的片段。
g-TUBE整个操作过程见下,加入样品,离心再倒转离心一次,完成!就是这么简单易用!

剪切过程

剪切性能优


图1. 使用g-TUBE搭配离心机对基因组样本进行剪切,以获得6kb、8kb、10kb、20kb的DNA片段。剪切结果经0.5%琼脂糖凝胶以及Agilent 2100检测,结果显示g-TUBE可对DNA进行高质量的剪切,DNA片段紧密分布在指定大小范围内。

重复性高


图2. 18个相同DNA样品,均用g-TUBE在8000 rpm 处理 60s,琼脂糖跑胶结果显示均剪切至10kb左右,表现出良好的重复性。

测序结果对比

分别用Covaris g-TUBE 和 Hydroshear DNA片段化仪对同一E Coli 基因组DNA 超声打断道10kb,进行2个不同input DNA 量(7.5μg和15μg)的重复。文库构建按照Libraries PacBio RS protocols ,并用PacBio RS 测序。测序结果对比如下,用Covaris g-TUBE打断的基因组样本构建的文库测序无论是从文库产出还是测序覆盖度等方面均远优于Hydroshear 组。


图3. Covaris g-TUBE 和 Hydroshear DNA 制备的长片段DNA 进行Pacbio 单分子文库构建测序的结果对比。

除了6-20kb长片段剪切, Covaris 提供从100bp-5kb的全套核酸解决方案,并配备高通量片段化核酸到文库构建一体化方案,满足您的不同需求。

我来说两句
0  条评论    0 人次参与
登录 注册发布
最新评论刷新
查看更多评论 > >

订阅生物通快讯

订阅快讯:

最新文章

限时促销

会展信息

关注订阅号/掌握最新资讯

今日动态 | 生物通商城 | 人才市场 | 核心刊物 | 特价专栏 | 仪器云展台 | 免费试用 | 今日视角 | 新技术专栏 | 技术讲座 | 技术期刊 | 会展中心 | 中国科学人 | 正牌代理商

版权所有 生物通

Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

联系信箱:

粤ICP备09063491号