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PathFusion数字病理成像分析解决方案助您事半功倍(一)

【字体: 时间:2020年08月31日 来源:基因有限公司

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  肿瘤等医学样本的基因组项目,比如TCGA(The Cancer Genome Atlas),每个样本首先需要进行病理分析,确保用于下游基因组分析的样本肿瘤细胞比例尽可能高且坏死细胞比例尽可能低。因此,医学样本的病理质控是基因组学研究的关键环节。

肿瘤等医学样本的基因组项目,比如TCGA(The Cancer Genome Atlas),每个样本首先需要进行病理分析,确保用于下游基因组分析的样本肿瘤细胞比例尽可能高且坏死细胞比例尽可能低。因此,医学样本的病理质控是基因组学研究的关键环节。

病理学分为组织病理学和分子病理学。HE染色是组织病理学中最常见的染色方法,主要是进行形态学上的观察。比如,当正常的组织发生癌变以后,就会发生细胞质变小,出现多个细胞核,核仁变大,以及染色质变粗糙等这些形态上的改变,以此作为病理分析的标准之一。

 

分子病理学是通过对组织中蛋白或者基因的表达进行准确的相对定量分析,以此能够更加准确地进行疾病进程的评估,或者是药物的药理药效的评估等。常用的分子病理学的技术方法包括免疫组化,荧光原位杂交以及免疫荧光。免疫组化 通过在明场成像下对细胞以及组织中特定蛋白的表达进行分析。FISH荧光原位杂交技术使用不同的荧光探针进行细胞内特定基因的标记,成像后对特定基因的表达进行一个准确的相对定量的分析。免疫荧光通过荧光抗体对组织里面的多种蛋白的表达进行标记,成像以后进行针对特定蛋白表达的准确的相对定量分析。随着病理学的不断发展,越来越多的研究者已经意识到分子病理学的重要性。只通过形态上的改变进行定性分析是远远不够的,还同时需要定量分子的表达来进行更加准确的评估和判断。

  

传统的病理学样本定量分析,采用显微镜下人工数数,一方面会存在主观因素引入的误差,另一方面由于计数的细胞数量有限或过少,因此分析的准确性会有所妥协。不同的病理学家分析同一张切片,同一个人在不同的时间分析同一张切片等都会存在重复性差的问题。因此,非常需要一种能够通过自动化标准化的分析,给出准确客观的分析结果的一种方法。数字病理成像及分析系统可以自动化的对多张切片进行连续的扫描,形成数字化的图片。分析人员可以坐在电脑前,对整个组织切片进行计算机辅助的分析。所有的这些数据都可以变成易于存储的数字化的结果。另外,相对于传统病理这种多人头教学的方式,数字病理可以实现在宽敞明亮的环境里进行大屏幕病理教学。

传统手工计数准确性和重复性差


Low general hospital针对于非小细胞肺癌组织样本中PD-L1的表达,分别使用手动分析的方法以及计算机辅助分析的方法做了一项对比研究。该医院的病理和实验医学中心的DR Lija博士对Hipath Pro数字病理分析系统提出了非常高的评价。她说,在对于免疫组化的切片进行评分和判断的时候,尤其是在进行染色非常不一致的肿瘤区域进行分析的时候,使用HiPath Pro数字病理成像分析系统能够非常快速的进行评分和分析,提高了分析结果的准确性和重复性,让他们对分析结果非常自信。

在这项研究中,病理学家人工分析的方法和HipathPro计算机辅助分析的方法分析结果的一致性为83%。这种不一致性主要是来源于属于边界情况分类的case。病理学家认为这些case低于1%的阳性率,而High Path Pro自动分析的方法认为是1%-49%的阳性率的中等表达。导致这种结果差异的原因是手工分析的方法计数的区域较小,计数的细胞数量过少。当手工计数的方法统计更大的肿瘤区域和更多的细胞数量时,这种一致性可以达到91%。在进行细胞数量统计的时候,High Path Pro统计了平均2300个细胞,而手工分析的方法,只计数了平均一百个细胞。对于中等表达的case,两者的一致性可以达到100%。

以色列厂家ASI以GenASI为产品的识别名称,主要的应用领域包括细胞遗传学诊断分析,数字病理诊断分析,高光谱成像分析几个领域,在临床医学领域,多项技术具有美国FDA的认证。ASI的应用软件,包括做染色体带型分析的软件,做FISH分析的软件,做光谱核型分析的软件,做免疫组化以及基于显色法的原位杂交分析的软件,做组织FISH的软件和多光谱成像分析的软件等。PathFusion数字病理成像及分析系统,支持全玻片扫描成像,基于免疫组化成像及分析,HE切片和FISH切片的自动组织匹配,以及FISH分析。

通过全面的数字病理解决方案,带给客户更好的体验。

全玻片成像

IHC分析

Tissue Matching(组织匹配)

FISH成像及分析

基因有限公司作为ASI厂家在国内的全国代理商,为您提供产品咨询、DEMO试用、售后应用支持和培训、仪器维护等一系列的服务,让您的数字病理成像及分析无后顾之忧。后续我们将会继续介绍ASI数字病理成像分析系统的特色功能及分析软件,请持续关注!

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