生物通 | 新技术专栏

科学家证明ddPCR在定量癌症标志物上的价值

【字体: 时间:2020年08月05日 来源:生物通

编辑推荐:

  近日,在美国癌症研究协会的年会上,科学家们展示了40多篇摘要,证明了ddPCR技术在定量癌症标志物上的价值。这些标志物能够协助患者诊断,指导治疗决策,并以新颖的方式鉴定癌症机制。

Bio-Rad的微滴式数字PCR(ddPCR)技术已应用于基础研究和临床诊断领域。今年初,科学家介绍了如何利用ddPCR来监测毛细胞白血病和慢性粒细胞白血病的生物标志物。不久前,基于ddPCR的新冠病毒检测产品也获得了美国FDA的紧急使用授权。

近日,在美国癌症研究协会的年会上,科学家们展示了40多篇摘要,证明了ddPCR技术在定量癌症标志物上的价值。这些标志物能够协助患者诊断,指导治疗决策,并以新颖的方式鉴定癌症机制。

以下是一些应用实例,展示了ddPCR技术在定量遗传、表观遗传和miRNA标志物上的优势。这些研究举例说明了如何利用不同的分子信号来诊断患者、指导治疗并发现残留病。

评估miRNA是否可作为口腔癌的标志物

最近,意大利卡塔尼亚大学的博士生Luca Falzone及其同事开展了口腔癌的病例-对照验证研究。他们对患有口腔鳞状细胞癌的患者及没有口腔疾病的健康对照进行了评估,以确定特定miRNA作为生物标志物的敏感性和特异性。

研究人员在初步鉴定与口腔鳞状细胞癌相关的miRNA后,利用miRNA TaqMan探针和ddPCR技术来鉴定血浆及匹配的唾液样本中miRNA的表达水平。

“我们之所以选择ddPCR技术,是因为它能有效检测低水平的靶点,如循环miRNA,”Falzone谈道。“凭借这项技术出色的灵敏度和精确度,我们能够定量某些miRNA的细微变化,从而预测肿瘤的存在或了解患者的预后。”

定量DNA甲基化标志物

尽管表观遗传标志物也具有诊断和预后的潜力,但测定DNA甲基化的标准方法是首先进行亚硫酸氢盐转化,这一步容易出错。为此,荷兰莱顿大学医学中心的研究人员Rogier J. Nell开发出一种新方法,能够对DNA甲基化的数量、密度和等位基因特异性进行绝对定量。

Nell将甲基化敏感的限制性酶与ddPCR技术结合使用,开发出一种不依赖亚硫酸氢盐的方法来定量表观遗传标志物。通过分析甲基化标志物以及物理上相关的遗传标志物,Nell能够将甲基化水平与特定等位基因相关联。

Nell表示:“通过这种方法,我们能够在多重的数字实验中评估DNA甲基化的数量和密度。我们的方法为定量对癌症护理很重要的表观遗传标志物提供了新机会,甚至能处理微量的DNA。”

可靠定量循环肿瘤DNA

随着ddPCR技术不断应用于临床,俄罗斯NN Petrov肿瘤研究所的Ekaterina Kuligina博士希望了解环境变量是否会独立地影响实验结果。

Kuligina及其团队分析了大约100名癌症患者的近500份血液样本,这些人患有各种类型的癌症。他们发现,疾病进展和远端转移会影响循环肿瘤DNA(ctDNA)的浓度,但昼夜节律、体育锻炼和最近的食物摄取都没有影响。

这项研究表明,ddPCR技术比其他技术更为可靠。Kuligina表示:“我们的研究表明,血浆中ctDNA的存在对癌症患者而言是高度特异性的。样本采集环境似乎对结果没有影响。”(生物通 薄荷)

我来说两句
0  条评论    0 人次参与
登录 注册发布
最新评论刷新
查看更多评论 > >

订阅生物通快讯

订阅快讯:

最新文章

限时促销

会展信息

关注订阅号/掌握最新资讯

今日动态 | 生物通商城 | 人才市场 | 核心刊物 | 特价专栏 | 仪器云展台 | 免费试用 | 今日视角 | 新技术专栏 | 技术讲座 | 技术期刊 | 会展中心 | 中国科学人 | 正牌代理商

版权所有 生物通

Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

联系信箱:

粤ICP备09063491号