这个新网址有助于研究2型糖尿病的遗传基础

【字体: 时间:2021年10月13日 来源:生物通

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  研究人员开发了一种资源,用于分析驱动2型糖尿病的细胞中的遗传变异可能导致该疾病。

  

人类基因组中的许多变异都与2型糖尿病有关,但由于大多数变异并不存在于编码蛋白质的基因中,因此尚不清楚它们是如何致病的。现在,一个包括麻省总医院(MGH)研究人员在内的国际团队开发了一种资源,帮助揭示这些基因变异的影响。

《细胞报告》(Cell Reports)对这项工作进行了描述,其依据是一种知识,即胰岛细胞群的异常会产生和释放调节血糖水平的激素,从而推动2型糖尿病的发展。然而,不幸的是,获取人类胰岛样本非常困难。为了克服这一挑战,来自西班牙、比利时、意大利、瑞典、芬兰、英国和美国的科学家联合起来,从2型糖尿病和非2型糖尿病患者身上获取了500多个人类胰岛样本,并从这些样本中提取了基因组和基因表达数据。根据这些数据,研究人员创建了他们命名为TIGER(转化型人类胰岛基因型组织表达资源)。

这项研究需要收集和检查大量的信息,这是通过使用超级计算资源和新的统计方法实现的。

TIGER的分析显示,2型糖尿病患者胰岛的某些遗传变异控制着特定基因的表达。到目前为止,已经确定了32个可能导致2型糖尿病风险的新基因。

MGH糖尿病部门和基因组医学中心的研究科学家Josep M. Mercader博士说:“这一资源对于识别可能与我们发现的与2型糖尿病相关的遗传变异相关的基因非常有用。了解特定基因关联背后的基因是识别潜在药物靶点的第一步,或者更好地理解不同类型糖尿病的生理机制。”

TIGER的数据是公开的,糖尿病研究群体可以通过TIGER的网站门户(tiger.bsc.es).轻松获取。

“我们感到自豪的是,我们现在能够以一种方便的方式向科学界分享这些丰富的数据,为2型糖尿病领域的所有研究人员提供方便,而不需要计算或生物信息专业知识,”TIGER门户网站的开发者之一、西班牙巴塞罗那超级计算中心的洛雷纳·阿隆索说。

https://doi.org/10.1016/j.celrep.2021.109807

Article Title

TIGER: The gene expression regulatory variation landscape of human pancreatic islets


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