Science:新德里疫情凸显了面对德尔塔变种要达到群体免疫的严峻挑战

【字体: 时间:2021年10月20日 来源:Science

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  一个国际科学家团队在《科学》杂志上写道,2021年在印度德里爆发的COVID-19严重疫情表明,SARS-CoV2的Delta变种不仅具有极高的传染性,而且它还可以感染以前感染过另一种冠状病毒变种的个人。

  

一个国际科学家团队在《科学》杂志上写道,2021年在印度德里爆发的COVID-19严重疫情表明,SARS-CoV2的Delta变种不仅具有极高的传染性,而且它还可以感染以前感染过另一种冠状病毒变种的个人。

在第一波中,SARS-CoV-2在印度广泛传播,印度医学研究委员会的初步结果发现,五分之一(21%)的成年人和四分之一(25%)的10至17岁青少年被感染。在印度的大城市,这一数字要高得多:到2021年2月,德里超过一半(56%)的人被认为已被感染。

自2020年3月德里发现首例COVID-19病例以来,该城市在2020年6月、9月和11月经历了多次疫情暴发。在2020年11月达到每天近9000例的高点后,新病例稳步下降,2020年12月至2021年3月期间新感染病例很少。

2021年4月,情况急剧逆转,从3月31日至4月16日,每天约2000例病例增至2万例。与此同时,住院和加护病房的人数迅速增加,给医疗系统带来了严重压力,每日死亡人数飙升至之前几次浪潮的三倍。

在今天发表的一项研究中,一个国际科学家团队使用基因组和流行病学数据,以及数学模型来研究疫情。这项工作由印度国家疾病控制中心和CSIR基因组学和综合生物学研究所领导,来自英国剑桥大学、伦敦帝国理工学院和丹麦哥本哈根大学的合作者。

为了确定SARS-CoV-2变异是否导致了2021年4月德里的疫情,该团队对来自德里的2020年11月至2021年6月上一次疫情的病毒样本进行了测序和分析。他们发现,2020年德里的疫情与任何不同的担忧无关。Alpha变体(B.1.1.7)在2021年1月之前只是偶尔发现,主要是在外国旅行者中发现。2021年3月,Alpha变异在德里的病例中增加到约40%,随后在4月被Delta变异(B.1.617.2)的迅速增加所取代。

通过对流行病学和基因组数据进行数学建模,研究人员发现,Delta变异比德里以前的SARS-CoV-2谱系(包括Alpha变异)的传染性高出30-70%。重要的是,该模型还表明,德尔塔变种能够感染以前感染过SARS-CoV-2的人——先前的感染仅提供了 50-90% 的保护。

为了寻找再次感染的实际证据来支持他们的建模工作,研究人员检查了印度科学和工业研究理事会(CSIR)招募的一组个人。今年2月,参与这项研究的未接种疫苗的受试者中,有42.1%的人对SARS-CoV-2抗体检测呈阳性。6月,该数字为88.5%,说明第二波感染率非常高。在德尔塔之前有感染史的91名受试者中,约有四分之一(27.5%)的抗体水平升高,为再次感染提供了证据。

当研究小组在研究期间对一个中心的所有疫苗突破病例样本进行测序时,他们发现在24例报告的病例中,德尔塔血统导致疫苗突破的可能性是非德尔塔血统的7倍。

印度国家疾病控制中心和CSIR基因组学和综合生物学研究所的Anurag Agrawal博士是资深作者和联合首席研究员,他说:“这项工作有助于了解德尔塔病毒在全球的爆发,包括在高度接种疫苗的人群中,因为德尔塔病毒变体可以通过接种疫苗或以前感染过的人传播,从而找到那些易感染的人。”

来自英国剑桥大学剑桥免疫和传染病研究所的拉维·古普塔教授说:“群体免疫的概念对结束疫情至关重要,但德里的情况表明,感染以前的冠状病毒变体不足以达到针对德尔塔的群体免疫。结束或防止德尔塔病毒爆发的唯一方法要么是感染这种变体,要么是使用提高抗体水平的疫苗增强剂,以克服德尔塔病毒逃避中和的能力。”

古普塔教授之前领导的研究表明,德尔塔变体很可能是通过其逃避中和抗体的能力和增强的传染性传播的。

这项研究得到了印度卫生和家庭福利部、科学和工业研究理事会以及生物技术司的支持。

参考Mahesh Dhar, Robin Marwal, Radhakrishnan VS, Kalaiarasan Ponnusamy, Bani Jolly, Rahul Bhoyar等。印度德里一种新出现的SARS-CoV-2变异的基因组特征和流行病学科学;2021年10月14日;DOI: 10.1126 / science.abj9932


杂志

科学

DOI

10.1126 / science.abj9932

文章标题

印度德里一种新出现的SARS-CoV-2变异的基因组特征和流行病学

文章出版日期

10月14 - - 2021

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