BioTechniques比较四款RNA提取试剂盒的表现

【字体: 时间:2021年10月20日 来源:生物通

编辑推荐:

  近日,印度医学研究委员会地区医学研究中心的研究人员比较了市场上的四种基于硅胶膜和磁珠的RNA提取试剂盒,发现各个试剂盒在产量和纯度上存在显著差异。

许多实验都离不开RNA提取,比如新冠病毒的检测。在RNA提取过程中,纯度和完整性是两个重要的考量因素。近日,印度医学研究委员会地区医学研究中心的研究人员比较了市场上的四种基于硅胶膜和磁珠的RNA提取试剂盒,发现各个试剂盒在产量和纯度上存在显著差异。

这篇题为“Yielding quality viral RNA by using two different chemistries: a comparative performance study”的论文发表在《BioTechniques》杂志上,提醒人们考虑RNA提取试剂盒的实际差异。

由于 RNA 的单链性质和普遍存在的 RNase,RNA 不稳定且很容易降解,因此需要选择RNA 提取试剂盒,能够最大限度提高质量、纯度和完整性。许多RNA提取试剂盒是为手动操作设计的,但适用于自动化系统的试剂盒也越来越多。

研究人员此次比较了RNA提取的两种方法:离心柱法和磁珠法。两种试剂盒采用离心柱法,分别是QIAGEN的Viral RNA mini kit(Kit A)和印度的Karwa试剂盒(Kit B)。另两种试剂盒采用磁珠法,分别是赛默飞的MagMAX试剂盒(Kit C)和Zybio POCT试剂盒(Kit D)。


(图片来自原文)

这项研究的目的是将离心柱法和磁珠法进行比较,同时考虑手动和自动提取方案对RNA产量和纯度的影响。许多试剂盒通常用于诊断实验室,可从不同类型的生物样本中提取RNA。不过,若将试剂盒从一种类型换成另一种类型,则提取出的核酸数量和质量就变得不确定。因此,这些信息有助于操作标准化和流程优化。

研究人员从150名疑似患有COVID-19的个体中采集了咽喉或鼻拭子样本,然后利用四种试剂盒来提取RNA。其中,Kit C是自动操作,其余是手动操作。他们发现,基于离心柱法的试剂盒在产量上更胜一筹。Kit A和Kit B都能够回收大量RNA,随后成功扩增。而且,Kit A的260: 280比值也最高。

他们指出,在考虑样品质量时尽管纯度很重要,但最好的指标是其在下游应用中的表现。尽管Kit C 的RNA质量低一些,但不会影响试剂盒的灵敏度和特异性,这可以通过实时定量PCR扩增看出来。同时,他们认为Kit D在用于自动化系统时可能表现更佳。

总的来说,研究人员认为Kit A(离心柱法)更胜一筹。不过Kit C(磁珠法)的操作可在仪器上自动完成,与其他试剂盒相比耗时更短,体验更佳。Kit B表现出良好的特异性,而Kit D可通过升级为自动化而提高其性能。他们认为,就检测新冠而言,RNA质量比产量更重要。

原文检索

Yielding quality viral RNA by using two different chemistries: a comparative performance study

Published Online:16 Sep 2021 https://doi.org/10.2144/btn-2021-0054

订阅生物通快讯

订阅快讯:

最新文章

限时促销

会展信息

关注订阅号/掌握最新资讯

今日动态 | 生物通商城 | 人才市场 | 核心刊物 | 特价专栏 | 仪器云展台 | 免费试用 | 今日视角 | 新技术专栏 | 技术讲座 | 技术期刊 | 会展中心 | 中国科学人 | 正牌代理商

版权所有 生物通

Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

联系信箱:

粤ICP备09063491号