创新方法重新定义蛋白质组学研究中的数据分析

【字体: 时间:2021年11月02日 来源:thermofisher

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  Thermo Fisher Scientific和MSAID继续合作,为蛋白质组学数据分析提供变革性的深度学习工具。在10月31日至11月4日于宾夕法尼亚州费城会议中心举行的第69届美国质谱学会(ASMS)质谱及相关主题会议上,赛默飞和MSAID展示了他们的新软件解决方案。

2021年11月1日,费城/美通社/—ASMS合作为蛋白质组学研究人员提供先进的质谱软件,通过使用人工智能(AI)和深度学习大幅提高肽识别和定量能力,从获取的数据进而推导出更多更深入的生物信息。

Thermo Scientific Proteome Discoverer 3.0软件结合了MSAID公司的CHIMERYS,利用人工智能(AI)大幅提高了蛋白质组学数据中独特肽的识别率和数量。与现有方法相比,CHIMERYS识别出了能够解释获得的串联质谱的最小肽集,现有方法通常假设串联质谱中的所有峰都来自单个肽。与现有工具相比,这种创新方法提供了1.8倍的独特肽识别数量和1.5倍的典型蛋白质组学数据集的蛋白质识别数量。除了改进的蛋白质覆盖和定量能力,与CHIMERYS配对的Proteome Discoverer 3.0软件也有助于更快的数据采集,以增加样品吞吐量。

在10月31日至11月4日于宾夕法尼亚州费城会议中心举行的第69届美国质谱学会(ASMS)质谱及相关主题会议上,赛默飞世尔科学公司和MSAID展示了他们的新软件解决方案。

“以前的技术无法完全解释使用质谱生成的数据,因为质谱可能包含多个共分离肽的片段,而这些片段无法使用当前的算法进行识别,”赛默飞世尔公司负责研发、色谱和质谱分析的副总裁August Specht说。“通过使用Proteome Discoverer 3.0软件和CHIMERYS,科学家现在可以利用人工智能来更深入地挖掘蛋白质组数据。这不仅提高了蛋白质组学的覆盖面,而且扩大了蛋白质组学科学家获取和应用数据的方式。”

MSAID首席执行官Martin Frejno说:“嵌合光谱是基于质谱的蛋白质组学的长期问题。通过CHIMERYS,我们重新构想了串联质谱分析,并使用人工智能来解决它。”

Proteome Discoverer 3.0软件版本还包括更新的INFERYS预测模型,扩展了对串联质量标记(TMT)、碰撞诱导解离(CID)的支持,并为免疫肽组学提供了改进的结果。通过将Proteome Discoverer 3.0软件和CHIMERYS与Thermo Scientific Vanquish Neo Ultra-High Performance Liquid Chromatography (UHPLC)系统和Thermo Scientific Orbitrap质谱平台的领先硬件技术结合起来进行智能数据分析,研究人员将被授权继续推动蛋白质组学研究的边界。

有关Thermo Scientific Proteome Discoverer 3.0软件和MSAID公司的CHIMERYS的更多信息,请访问www.thermofisher.com/proteomediscoverer,或加入我们于2021年10月31日至11月4日举行的ASMS 2021。

赛默飞世尔科学有限公司是世界领先的科学服务公司,年收入约350亿美元。我们的使命是让我们的客户使世界更健康、更清洁、更安全。无论我们的客户是在加速生命科学研究,解决复杂的分析挑战,改善患者诊断和治疗,还是提高实验室的生产率,我们都在这里为他们提供支持。我们的全球团队拥有9万多名员工,通过我们的行业领先品牌,包括Thermo Scientific、Applied Biosystems、Invitrogen、Fisher Scientific、Unity Lab services和Patheon,提供无与伦比的创新技术、采购便利和制药服务。欲了解更多信息,请访问www.thermofisher.com。

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SOURCE Thermo Fisher Scientific

         

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