瑞士蝙蝠中发现了与MERS冠状病毒高度同源的病毒

来自苏黎世大学和瑞士蝙蝠基金会的研究人员近日使用基于宏基因组测序的筛选策略，在瑞士的蝙蝠中鉴定出数十种DNA和RNA病毒，包括引起中东呼吸综合征的冠状病毒（MERS-CoV）。

　　

来自苏黎世大学和瑞士蝙蝠基金会的研究人员使用基于宏基因组测序的筛选策略，在瑞士的蝙蝠中鉴定出数十种DNA和RNA病毒，包括引起中东呼吸综合征的冠状病毒（MERS-CoV）。

根据6月16日发表在《PLOS One》上的一篇论文，研究人员收集了近年来在瑞士境内发现的约 7,000 只蝙蝠的粪便或器官组织样本，开展DNA测序和RNA测序。通过将这些样本中的序列与现有数据库中的序列进行比较，他们追踪到39个不同病毒科的代表，其中16个病毒科中的病毒会感染其他脊椎动物。

研究小组特别指出，对在一个普通蝙蝠栖息地收集到的粪便样本进行宏基因组测序时，他们发现了几乎完整的冠状病毒基因组序列，与MERS-CoV亲缘关系最近。不过这种病毒是否会跳跃到其他物种，以及这种感染会造成怎样的后果，还有待观察。

苏黎世大学病毒学研究所的Jakub Kubacki及其同事在文中写道：“研究这种蝙蝠 β 冠状病毒的人畜共患病潜力以及不断监测发现病毒的栖息地将会很有趣，因为这将使我们能够评估突变在自然宿主中的积累。”

研究人员在 2015 年至 2020 年间从瑞士各地栖息地中的健康生活、患病或死亡蝙蝠上采集了新鲜粪便或器官组织样本，利用宏基因组 DNA 测序和 RNA测序来寻找可识别的病毒序列。此次研究的蝙蝠涉及到14个瑞士本土物种和4个迁徙物种。

通过这些序列，研究人员大致了解了在瑞士蝙蝠中发现的病毒，以及不同地点、物种、样本类型之间的不同病毒组特征。他们发现，尽管大多数与脊椎动物相关的病毒序列属于圆环病毒科，但检测的蝙蝠还携带了类双生病毒科、冠状病毒科以及腺病毒科的病毒，以及之前在昆虫、植物或真菌宿主中发现的病毒科。

Kubacki 博士表示，新一代测序（NGS）非常适合病毒组的研究，即特定环境中存在的全部病毒。他指出苏黎世大学是第一个基于诊断目的提供NGS的瑞士兽医诊断实验室，特别是用于未知原因的疾病、牧群筛查以及监测或发现环境样本中的新病毒。

“蝙蝠栖息地粪便样本的宏基因组分析代表了一种理想的非侵入性高通量方法，可以监测病毒基因组的多样性，”作者在文中写道。“它还能够检测有人畜共患病潜力的病毒，并评估它们传播给包括人类在内的其他物种的潜在风险。”

此次分析突出了与39个病毒科相对应的序列，包括冠状病毒、腺病毒、肝炎病毒、轮状病毒和细小病毒。其中16个病毒科中的病毒也在其他脊椎动物宿主中发现，暗示了蝙蝠传播病毒的人畜共患潜力。

作者写道：“人类与野生动物的互动是人畜共患病溢出的主要原因之一，应该重新评估这种影响。”他们指出，“对瑞士蝙蝠病毒组的首次评估为未来深入研究病毒流行、病毒生物学、病毒-宿主相互作用以及病毒出现提供了一个平台。”

###

Hardmeier I, Aeberhard N, Qi W, Schoenbaechler K, Kraettli H, Hatt J-M, et al. (2021) Metagenomic analysis of fecal and tissue samples from 18 endemic bat species in Switzerland revealed a diverse virus composition including potentially zoonotic viruses. PLoS ONE 16(6): e0252534. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0252534