血细胞的遗传调节:基因与遗传变化的接近性起着重要作用

【字体: 时间:2021年09月24日 来源:Universität Leipzig

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  研究人员对血细胞的遗传调控有了重大的新认识。他们通过分析一个包含31000多名研究参与者的数据集实现了这一目标,这是迄今为止同类数据集中最大的一个。

  

因此,国际eQTLGen联盟进行了大规模的研究,研究遗传变异如何影响血液中基因的表达。这项研究的一个主要发现是,在被分析的所有基因中,有88%的基因与基因接近。这些被称为顺式效应。研究还显示,37%的与性状相关的遗传变异是由遥远的基因调控的,这种现象被称为反式效应。

确定第一次月经发生的机制

基因表达上的许多顺式和反式效应为解释广泛的性状和疾病的分子关系提供了许多新的方法。例如,研究人员发现了由ZNF131基因引起的反式机制,该基因决定了首次月经的发生。在某些情况下,这些机制已经在实验室中得到了证实。另一个例子是关于FADS1和FADS2基因如何影响脂肪酸代谢的新机制的见解。

Markus Scholz教授说:“这些结果极大地扩展了我们对血液中基因表达如何调控的知识,远远超出了目前可用的数据库,如全球迄今最大的数据库GTEx。”“我们希望这能让我们更好地理解遗传关联。尽管这在科学界并不典型,但在我们的研究发表之前,其他研究小组就已经在使用我们的研究数据来解释他们发现的遗传关联,”这位莱比锡生物信息学研究员说。

来自莱比锡大学医学院7524名受试者和患者的数据

该联盟成立于2014年,包括37项研究,共有31684名受试者和患者。莱比锡大学医学院(Leipzig University's Faculty of Medicine)对总人数的贡献很大,因为对其三个队列(Sorben, LIFE Adult和LIFE Heart)的数据分析来自7524人。

该联盟由医学信息学、统计和流行病学研究所(IMISE)的研究人员建立,由格罗宁根大学的一个团队领导。研究人员还共同制定了一个全面的分析计划。IMISE的研究员霍尔格·柯尔斯顿博士说:“这些分析非常复杂,因为首先,要进行数十亿次测试,错误率的控制必须根据所研究的相关性类型进行调整。”

Journal Reference:

  1. Urmo Võsa, Annique Claringbould, Harm-Jan Westra, Marc Jan Bonder, Patrick Deelen, Biao Zeng, Holger Kirsten, Ashis Saha, Roman Kreuzhuber, Seyhan Yazar, Harm Brugge, Roy Oelen, Dylan H. de Vries, Monique G. P. van der Wijst, Silva Kasela, Natalia Pervjakova, Isabel Alves, Marie-Julie Favé, Mawussé Agbessi, Mark W. Christiansen, Rick Jansen, Ilkka Seppälä, Lin Tong, Alexander Teumer, Katharina Schramm, Gibran Hemani, Joost Verlouw, Hanieh Yaghootkar, Reyhan Sönmez Flitman, Andrew Brown, Viktorija Kukushkina, Anette Kalnapenkis, Sina Rüeger, Eleonora Porcu, Jaanika Kronberg, Johannes Kettunen, Bernett Lee, Futao Zhang, Ting Qi, Jose Alquicira Hernandez, Wibowo Arindrarto, Frank Beutner, Peter A. C. ’t Hoen, Joyce van Meurs, Jenny van Dongen, Maarten van Iterson, Morris A. Swertz, Marc Jan Bonder, Julia Dmitrieva, Mahmoud Elansary, Benjamin P. Fairfax, Michel Georges, Bastiaan T. Heijmans, Alex W. Hewitt, Mika Kähönen, Yungil Kim, Julian C. Knight, Peter Kovacs, Knut Krohn, Shuang Li, Markus Loeffler, Urko M. Marigorta, Hailang Mei, Yukihide Momozawa, Martina Müller-Nurasyid, Matthias Nauck, Michel G. Nivard, Brenda W. J. H. Penninx, Jonathan K. Pritchard, Olli T. Raitakari, Olaf Rotzschke, Eline P. Slagboom, Coen D. A. Stehouwer, Michael Stumvoll, Patrick Sullivan, Peter A. C. ’t Hoen, Joachim Thiery, Anke Tönjes, Jenny van Dongen, Maarten van Iterson, Jan H. Veldink, Uwe Völker, Robert Warmerdam, Cisca Wijmenga, Morris Swertz, Anand Andiappan, Grant W. Montgomery, Samuli Ripatti, Markus Perola, Zoltan Kutalik, Emmanouil Dermitzakis, Sven Bergmann, Timothy Frayling, Joyce van Meurs, Holger Prokisch, Habibul Ahsan, Brandon L. Pierce, Terho Lehtimäki, Dorret I. Boomsma, Bruce M. Psaty, Sina A. Gharib, Philip Awadalla, Lili Milani, Willem H. Ouwehand, Kate Downes, Oliver Stegle, Alexis Battle, Peter M. Visscher, Jian Yang, Markus Scholz, Joseph Powell, Greg Gibson, Tõnu Esko, Lude Franke. Large-scale cis- and trans-eQTL analyses identify thousands of genetic loci and polygenic scores that regulate blood gene expression. Nature Genetics, 2021; 53 (9): 1300 DOI: 10.1038/s41588-021-00913-z

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