Nature子刊：应用癌症基因组学方法，发现与年龄相关的血液疾病

-巴塞罗那生物医学研究所的生物医学基因组学实验室确定了64个驱动克隆造血的基因，这是一种与多种心血管疾病有关的情况。-研究人员应用了一种创新的“反向突变调用”方法，从12000名癌症患者的数据中检测血液体细胞突变。-然后，他们应用癌症基因组学中发展的方法，在正选择下识别基因，发现这些克隆造血驱动。-研究结果发表在《自然通讯》杂志上。

　　

   

   

图片:用于识别癌症驱动基因的工具和数据集也可以促进克隆造血的研究。    

克隆造血是一种生物过程，在这个过程中，血液干细胞(产生多种血细胞类型的细胞群)获得了有利的突变，超过了邻近的细胞。当这种突变出现在一个特定个体2%的血细胞中时，克隆造血就被诊断出来。驱动克隆造血的有利突变处于正选择状态，就像导致细胞恶性化的癌症基因突变一样。

在ICREA研究教授Núria López-Bigas博士的领导下，巴塞罗那IRB生物医学基因组学实验室的科学家们重新利用了最初设计于癌症基因组学领域的计算工具，以精确定位驱动克隆造血的基因。这一策略背后的基本原理是，癌症和克隆造血的发展都受制于正选择，因此，如果适当调整，用于识别癌症驱动基因的工具和数据集也可以推进克隆造血的研究。

首先，为了识别血细胞中的体细胞突变，研究人员反转了在癌症中使用的方法，即使用癌症患者的血细胞基因组作为参考来识别肿瘤样本中的体细胞突变。相反，他们进行了“反向召唤”，也就是说，他们使用肿瘤基因组作为参考，以确定存在于血细胞基因组中的体细胞突变，因为克隆造血已经扩大了。应用该小组开发的整合肿瘤基因组学(IntOGen)管道，然后他们使用这些血液体细胞突变来识别克隆造血中正选择下的基因。

克隆造血在60多年前首次被发现，但对所有能够驱动这种疾病的基因仍然缺乏充分的了解。“在这项工作中，我们提出了一种新的方法，可以导致识别其驱动基因的目录，从而提高我们对潜在机制的理解，并有助于早期检测人群中的克隆造血，”与López-Bigas博士共同领导该项目的IRB巴塞罗那研究助理Abel González-Pérez博士说。

克隆造血是一个全球性的健康问题  

克隆造血是一个与衰老密切相关的过程，接受过化疗的癌症患者也更容易出现这种情况。

“在之前的工作中，我们研究了在癌症治疗下血细胞的进化，我们观察到，尽管克隆造血发生在暴露于化疗之前，但治疗是如何促进这一过程的，”该研究的第一作者、IRB巴塞罗那校友Oriol Pich博士解释说，他目前是伦敦弗朗西斯克里克研究所的博士后研究员。

克隆造血虽然不是一种疾病，但会增加晚年患血液恶性肿瘤和几种心血管疾病的可能性。因此，早期发现和随后的监测是早期和适当监测和管理相关并发症的关键。

生物医学基因组学实验室目前正在参与两个研究项目，评估克隆造血对健康人群的影响，特别是对动脉粥样硬化和心肌梗死的影响。

这项研究之所以成为可能，要感谢为科学研究捐赠样本的患者(及其家人)，以及癌症基因组学科学家辛勤分析样本并将其序列公开的人。这项工作涉及三个特定的捐助者群体，分别由TCGA、哈特威格医学基金会和msn - impact提供资助。