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上海交大陈海峰与冯雁课题组指导本科生在全新蛋白质序列设计方法研究中取得重要进展
近日,上海交通大学生命科学技术学院陈海峰教授课题组与冯雁教授课题组合作在中科院Top期刊《Briefings in Bioinformatics》在线发表题为Graphormer Supervised De Novo Protein Design Method and Function Validation的研究成果,该研究开发了一种原创而高效的全新蛋白序列设计方法GPD,该方法与当前的SOTA方法proteinMPNN相比,序列多样性显著更高,生成速度快2.2倍,能够显著提升工业酶及蛋白质药物的从头设计能力。生命科学技术学院本科生穆俊羲为第一作者,博
来源:上海交大 新闻学术网
时间:2024-04-08
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诸颖课题组开发空间转录组语义注释新算法Pianno
空间转录组学技术(如 10x Visium、Slide-seq 和 Stereo-seq)的最新进展彻底改变了对组织内基因表达模式的研究。然而,仅仅获得组织内特定物理坐标的基因表达谱不足以全面了解生物系统的复杂性。为了获得更深入的见解,必须辨别组织内每个空间点的生物学身份。2024年4月,复旦大学脑科学研究院诸颖团队,在《自然通讯》(Nature Communications)上发表了题为“Pianno: a probabilistic framework automating semantic annotation for spatial transcriptomics(Pianno:为空间
来源:复旦大学脑科学研究院
时间:2024-04-08
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北大第三医院魏蕊、洪天配、张哲研究团队在Diabetes发表胰岛β细胞再生机制研究最新成果
3月12日,北京大学第三医院内分泌科魏蕊研究员/洪天配教授团队与泌尿外科/生殖医学中心男科张哲副研究员团队合作,在内分泌代谢专业顶级期刊、美国糖尿病学会官方期刊《糖尿病》(Diabetes)在线发表关于胰岛β细胞再生机制研究最新成果。论文题目为《肠道菌群-色氨酸代谢-GLP-1轴参与介导达格列净促进胰岛β细胞再生》(Gut microbiota-tryptophan metabolism-GLP-1 axis participates in β-cell regeneration induced by dapagliflozin)。原文截图2型糖尿病是一种复杂的慢性代谢性疾病,
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生命科学学院张哲课题组与合作者共同揭示了SLC19A3蛋白识别底物和药物的分子机制
维生素B1(硫胺素)和B6是两类水溶性维生素。它们的活性形式硫胺素焦磷酸和磷酸吡哆醛是多种代谢酶的辅因子,在维持人体的物质和能量代谢方面发挥关键作用。相应地,这两类维生素的缺乏会引起多种疾病,尤其与神经和心血管系统异常相关。哺乳动物不能从头合成这些维生素,只能从饮食中摄取,SLC19A2和SLC19A3蛋白是二者跨膜转运的主要途径。这两种转运蛋白的功能异常会直接导致与相应维生素缺乏相关的疾病,如生物素反应性基底神经节病、韦尼克氏脑病和硫胺素敏感型巨幼细胞性贫血综合征等。北京大学生命科学学院和生命科学联合中心张哲课题组于2024年3月19日在Cell Research杂志发表了题
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我国学者研制出适用于可穿戴集成电路的三维液体二极管
图 (a)基于三维液体二极管的柔性透气集成电路原理示意图; (b)三维液体二极管的流体动力学仿真 在国家自然科学基金项目(批准号:62122002)等资助下,香港城市大学于欣格副教授团队在柔性、透气可穿戴集成电子器件方面取得进展。研究成果以“一种适用于柔性、集成透气电子的三维液体二极管(A three-dimensional liquid diode for soft, in
来源:国家自然科学基金委员会
时间:2024-04-08
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HIV-1糖链靶向的分子印迹人工中和抗体研究重要进展
HIV-1是导致获得性免疫缺陷综合征(AIDS)的主要病原体,其可利用宿主细胞糖基化等途径来加工病毒包膜蛋白(Env),Env表面的糖链能够遮蔽抗原表位,保护蛋白质免受免疫监视,被称之为“糖盾”。研究发现Env的糖基化修饰有着高度保守的结构,被视为抑制 HIV-1 感染的重要突破口之一,但由于免疫原性较弱,针对病毒糖链的抗体难以获得,且现有靶向Env糖链的中和抗体存在半衰期短和易于引发逃逸突变等缺点。分子印迹(Molecular Imprinting)技术通过模板分子空间结构和结合位点来模拟抗原-抗体之间的相互作用,从而精确识别目标分子。分子印迹材料有着卓越的分子识别性能和稳定性,被称之为人工
来源:吉林大学生命科学学院
时间:2024-04-07
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上海交大马杰课题组与合作者发表研究成果:空位调控Zintl相热电材料的晶格非谐性
近日,上海交通大学物理与天文学院马杰课题组与中国散裂中子源高能非弹谱仪团队、哈尔滨工业大学张倩教授课题组以及香港大学陈粤课题组等合作,在《Nature Communication》期刊上发表题为“Vacancies tailoring lattice anharmonicity of Zintl-type thermoelectrics”的最新研究成果。文章报道了空位可以在声子热输运中起到的关键作用,确定了Zintl型热电材料超低晶格热导率的物理起源,并提出了利用晶格缺陷调控声子群速度与晶格非谐性从而降低晶格热导率的新方法。超低的晶格热导率在量子能源材
来源:上海交大 新闻学术网
时间:2024-04-06
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柯杨/何忠虎课题组发布首个“食管癌内镜筛查有效性”的随机对照研究证据
2024年3月9日,肿瘤学领域权威期刊Journal of Clinical Oncology发表了北京大学肿瘤医院柯杨/何忠虎课题组“评价内镜筛查食管癌效果的人群随机对照研究(ESECC trial,NCT01688908)”的阶段报告。该研究为国际范围内首次通过大规模社区人群随机对照设计,证明规范的碘染内镜筛查可降低食管癌发病率和死亡率,为我国乃至全球广泛开展的食管癌人群早诊早治工作提供了目前最高等级的科学证据。2022年全球食管癌年龄标化发病率(左)、死亡率(右)地域分布食管癌是我国高发肿瘤,全球超半数新发病例发生在我国。由于食管癌具有可检出的早期病变阶段且具备有效的临床
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利用口服离子液体-非天然氨基酸提高基因密码子扩展系统治疗无义突变疾病的疗效
2024年1月30日,北京大学药学院夏青教授团队和石玉杰博士在Adv Sci在线发表了题为“Unnatural Amino Acid-Based Ionic Liquid Enables Oral Treatment of Nonsense Mutation Disease in Mice”的研究论文,首次报道利用离子液体技术提高基因密码子扩展系统在治疗无义突变小鼠模型中的作用。该研究建立了一种简单而经济的策略来优化非天然氨基酸(UAA)的底物形式,实现无创而高效的口服给药,显著提高了UAA在体内的暴露及其在靶细胞中的利用率,并观察到更为快速、稳定和持久的全长蛋白恢复表达。论文截图基
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昆明植物所在茶树的分子物种界定研究中取得新进展
作物野生近缘种是指与作物遗传关系较近的植物类群,是宝贵的植物遗传资源,对于改良作物品种、提高作物的产量和质量具有十分重要的意义。茶是我国重要的木本经济作物之一,广义上的茶树指山茶属茶组(Camellia sect. Thea)的全部物种,是极其宝贵的遗传种质资源,对于拓宽茶树栽培品种的遗传基础、改良品种、创制新品种具有重要作用。茶组植物在建立之初仅有2种,后续主要的分类系统如Sealy、张宏达和闵天禄系统认为茶组分别包含5种1变种、32种4变种和12种6变种。自《中国植物志》英文版出版之后,仍不断有茶组新分类群被相继发表,反映了茶树的物种多样性仍未被充分认识。虽然学者们对茶组的分类研究已逾百年
来源:中国科学院昆明植物研究所
时间:2024-04-04
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蛋白质设施用户张余研究组揭示酵母mRNA转录终止的机制
蛋白质设施用户张余研究组揭示酵母mRNA转录终止的机制 中国科学院上海高等研究院国家蛋白质科学研究(上海)设施用户中国科学院分子植物科学卓越创新中心/中国科学院合成生物学重点实验室张余研究组研究揭示了酵母mRNA转录终止的分子机制,该成果于2024年3月28日以“Structural basis of exoribonuclease-mediated mRNA transcription termination”为题在Nature上发表。 &nbs
来源:国家蛋白质科学中心
时间:2024-04-04
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胆道外科李富宇教授团队在Molecular Cancer发文:系统研究了外泌体运输的非编码RNA促进胆囊癌血管生成的作用机制
2024年3月27日,胆道外科李富宇教授团队在Molecular Cancer(IF:37.3)发表文章“Exosomal long non-coding RNA TRPM2-AS promotes angiogenesis in gallbladder cancer through interacting with PABPC1 to activate NOTCH1 signaling pathway”。系统研究了由外泌体运输的lncRNA TRPM2-AS促进胆囊癌血管生成的作用机制,包括加强miRNA介导的mRNA降解、NOTCH1通路的
来源:四川大学华西医院
时间:2024-04-04
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钱利纯实验室在FRONTIERS IN MICROBIOLOGY发表论文
标题:Effects of fecal microbiota transplantation on metabolic health of DBA mice(IF=6.2)作者: Ye, Wenxin ; Fan, Jinghui ; Wu, Wenzi ; Chen, Zhuo ; Huang, Qixin ; Qian, Lichun*(钱利纯)来源出版物:FRONTIERS IN MICROBIOLOGY Volume15DOI10.3389/fmicb.2
来源:浙江大学动物科学学院
时间:2024-04-04
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尹兆正实验室在FRONTIERS IN PHYSIOLOGY发表论文
标题:Identification and functional analysis of ovarian lncRNAs during different egg laying periods in Taihe Black-Bone Chickens(IF=4.7)作者: Huang, Yunyan ; Li, Shibao ; Tan, Yuting ; Xu, Chunhui ; Huang, Xuan ; Yin, Zhaozheng*(尹兆正)来源出版物:FRONTIERS IN
来源:浙江大学动物科学学院
时间:2024-04-04
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施巍实验室在JOURNAL OF HAZARDOUS MATERIALS发表论文
标题:Microplastics weaken the exoskeletal mechanical properties of Pacific whiteleg shrimp Litopenaeus vannamei(IF=12.7)作者: Tong, Difei ; Yu, Yingying ; Lu, Lingzheng ; Zhou, Weishang ; Yu, Yihan ; Zhang, Xunyi ; Tian, Dandan ;&nb
来源:浙江大学动物科学学院
时间:2024-04-04
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汪海峰实验室在GUT MICROBES发表论文
标题:IgA-mediated control of host-microbial interaction during weaning reaction influences gut inflammation(IF=12.4)作者: Tang, Wenjie ; Wei, Yusen ; Ni, Zhixiang ; Hou, Kangwei ; Luo, Xin M. ; Wang, Haifeng *(汪海峰)来源出版物:GUT MICROBES
来源:浙江大学动物科学学院
时间:2024-04-04
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王敏奇实验室在NUTRIENTS发表论文
标题:Effects of Clostridium tyrobutyricum on Lipid Metabolism, Intestinal Barrier Function, and Gut Microbiota in Obese Mice Induced by High-Fat Diet(IF=6.6)作者: Luo, Yanqiu ; Jin, Yuyue ; Wang, Haidong ; Wang, Geng ; Lin, Yueying ; Chen
来源:浙江大学动物科学学院
时间:2024-04-04
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付爱坤实验室在INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLEC...
标题:Carboxymethyl konjac glucomannan-chitosan complex nanogels stabilized emulsions incorporated into alginate as microcapsule matrix for intestinal-targeted delivery of probiotics: In vivo and in vitro studies(IF=7.8)作者: Ding, Xiaoqing ; Li, Danlei ; Xu, Yibin ; Wang, Y
来源:浙江大学动物科学学院
时间:2024-04-04
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乐敏实验室在MICROBIAL BIOTECHNOLOGY 发表论文
标题:Climate change affects the spread of typhoid pathogens(IF=6.4)作者: Jia, Chenghao ; Cao, Qianzhe ; Wang, Zining ; van den Dool, Annemieke ; Yue, Min*(乐敏)来源出版物:MICROBIAL BIOTECHNOLOGY Volume:17 Issue:2DOI10.1111/1751-7915.14417出版时间:FE
来源:浙江大学动物科学学院
时间:2024-04-04
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廖敏实验室在 BIOLOGY METHODS & PROTOCOLS 发表论文
标题:Development of a highly sensitive TaqMan method based on multi-probe strategy: its application in ASFV detection(IF=3.6)作者: Ding, Shuxiang ; Shen, Tianren ; Feng, Zixuan ; Diao, Sujing ; Yan, Yan ; Du, Zhenkun ; Jin, Yulan ;
来源:浙江大学动物科学学院
时间:2024-04-04