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  • 如何预测和鉴定miRNA的靶基因?

    miRNA虽只有短短22个核苷酸,却通过调控大量的靶基因,在基因表达中扮演了重要角色。研究发现,每个哺乳动物miRNA可能调控了约200个靶基因。到目前为止,仍有许多miRNA的功能并不清楚,原因在于已经确定的miRNA靶基因数量很少,而靶基因的预测和鉴定的难度又颇大。于是,科学家们也在利用各种生物信息学方法和实验方法来寻找miRNA的靶基因。 [2014/9/25]

  • 怎样解决RNAi的脱靶问题

    RNAi是一种常用的基因失活工具,它的主要缺陷在于会引起序列特异性的脱靶效应。日前,Regensburg大学的Gunter Meister领导研究团队在Nucleic Acids Research杂志上发表文章,描述了一种能克服上述问题的新方法。这种被称为siPools的低成本方法,能够简单而精确的生成含有多达60种siRNA的混合物,将脱靶效应降低到检出限以下。 [2014/7/16]

  • Nature Methods:12种miRNA表达平台的比较

    microRNA(miRNA)作为基因表达的重要调节因子,在近年来被广泛研究。目前,人们利用各种不同的技术来确定生物样品中miRNA的相对丰度,包括小RNA测序、RT-qPCR和芯片等。这些技术究竟孰优孰劣?比利时根特大学领导的团队比较了12种miRNA表达分析平台,并将其结果发表在6月29日的《Nature Methods》在线版上。 [2014/7/7]

  • 巴西队让一让,最新21.0版microRNA数据库上场了

    随着巴西世界杯进入激烈的八强争夺赛,microRNA(miRNA)研究首选数据库Sanger miRBase最新21.0版终于在6月26日正式发布了。最新版数据库更新耗时较以往更长,这意味着miRNA数据增加的也比以往更多。新版数据库收录miRNAs总数量已突破35000条,相比上一版本增长近20%,新增4196条发夹前体序列和5441条成熟体miRNAs。 [2014/6/30]

  • 从miRNA快速筛选到功能分析的整体解决方案[新品推荐]

    默克密理博创新一代Muse™智能触控细胞分析仪。内置Pad版触屏式电脑,结合全面的预置细胞分析常规实验方案,为您开创前所未有的流式操作新体验。在当下热门的miRNA研究中,Muse™智能触控基因分析平台能为您做些什么? [2014/3/31]

  • miRNA表达谱分析 样品不够怎么办?[创新技巧]

    利用qPCR,我们只需要1.5 µg总RNA,即可开展miRNA组(miRNome)分析。然而,RNA有时很难得到,但我们还是希望能分析多个miRNA甚至miRNome,怎么办?在此,我们提供了一些技巧,帮助您克服样品量的限制,同时还为您奉上处理不同类型样品的注意事项。 [2014/2/24]

  • RNA干扰也要由内而外

    与传统RNAi技术中直接转入化学合成的siRNA不同,transOMIC公司的 PLATINUM Select™ shRNA-mir 干扰载体是采用最新的内源性RNAi干扰技术:shRNA-mir是通过转入的质粒表达初级转录产物 shRNA-mir,并通过一系列酶切加工成 siRNA来起作用;并且使用来自冷泉港Dr.Greg实验室的shERWOOD算法筛选出来干扰序列能够确保100%的干扰效果。 [2014/1/22]

  • 如何优化你的RNAi

    RNA干扰(RNAi)可以帮助人们特异性关闭基因的表达,是生物学领域的常用技术。本文介绍了一些实用工具和小窍门,希望能帮你优化实验条件,使RNAi更加完美。 [2013/12/12]

  • 从互作揭开lncRNA的秘密(上)

    近年来,长非编码RNA(lncRNA)得到了研究界的广泛关注。如今,人们已经鉴定了大量lncRNA,但大多数lncRNA的功能还未明确。为了解决这一问题,研究者们开始对lncRNA的互作蛋白进行研究,并为此开发出了越来越多的分析工具。 [2013/11/28]

  • 从互作揭开lncRNA的秘密(下)

    近年来,长非编码RNA(lncRNA)得到了研究界的广泛关注。如今,人们已经鉴定了大量lncRNA,但大多数lncRNA的功能还未明确。为了解决这一问题,研究者们开始对lncRNA的互作蛋白进行研究,并为此开发出了越来越多的分析工具。 [2013/11/28]

  • 单细胞水平的miRNA表达谱分析[新品推荐]

    Fluidigm公司近日宣布在其C1™ 单细胞自动制备系统上添加miRNA表达谱分析方案,有助于揭开单细胞中miRNA的秘密。这一方案为研究人员带来了简单、快速且灵活的流程,可扩增单个细胞中数百个miRNA,同时平行处理96个细胞。 [2013/8/16]

  • 使用自动化的微流控芯片系统在单细胞中检测MicroRNA的异质性[创新技巧]

    Fluidigm 公司开发了一种在C1™单细胞自动制备系统及Biomark™ HD系统上检测单细胞miRNA表达谱的实验方案。此方案可以在小于24小时的时间内,平行处理96个单细胞,在一张GE 96.96芯片对每个单细胞分别检测多达96种miRNA。配套的SINGuLAR™ 2.0分析软件可以对数据进行非监督式聚类分析及PCA分析,有效的根据miRNA表达类型在单细胞水平揭示细胞群体的异质性,为研究miRNA调控提供更多数据。 [2013/8/15]

  • 轻松捕获microRNA的靶标[新品推荐]

    为了更好地了解miRNA影响健康和疾病的机制,我们首先需要知道miRNA会对哪些基因起作用。然而,这并非易事。每个miRNA都能够调控数以百计的靶基因。之前的miRNA靶标预测主要是通过一些算法来实现,而Clontech公司(Takara旗下)近日推出一种新工具,能协助鉴定细胞中的miRNA靶标。 [2013/7/23]

  • miRNA研究如何克服样本量的限制[新品推荐]

    qRT-PCR这种经典技术是miRNA表达谱分析的首选方法。然而,对于某些样本,如分选后的细胞、激光捕获组织、循环肿瘤细胞,样本量有限,未必能开展miRNome分析。在此,我们就介绍一个基于PCR的系统,它能将miRNome分析所需的样本量降低了几个数量级,同时带来了出色的重复性和精确性。 [2013/7/10]

  • lncRNA:一个全新的世界

    长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度超过200 nt的RNA分子,它们不编码蛋白。lncRNA的表达受到发育调控,是组织和细胞特异的。相当一部分lncRNA只位于细胞核内。它们包含许多类型的转录本,在结构上类似mRNA,有时也转录成编码基因的反义转录本。lncRNA被认为执行了重要的调控功能,也与疾病发展息息相关。 [2013/7/3]

  • microRNA数据库最新20.0版发布

    在大家苦苦期盼10个月后,microRNA(miRNA)权威数据库Sanger miRBase最新20.0版终于在2013年6月24日正式发布了。新版数据库收录了来自约40篇新文献报道的3355条新的发夹前体序列和5393条新的成熟体microRNA,总计达到24521条发夹前体序列和30424条成熟体序列。 [2013/6/26]

  • 两种畅销miRNA定量分析的比较[心得点评]

    英国LGC有限公司的研究人员比较了市场上两种畅销的microRNA(miRNA)定量PCR分析,Life Technologies的Taqman miRNA Assay和Exiqon的miRCURY LNA Universal RT microRNA PCR assay,并评估了小RNA富集方法对qPCR分析的影响。该成果近日发表在《BioTechniques》杂志上。 [2013/4/2]

  • Sigma推出miRNA长效抑制剂[新品推荐]

    Sigma-Aldrich公司近日宣布,旗下Sigma生命科学通过与东京大学的Hideo Iba和Takeshi Haraguchi教授合作,推出基于Tough Decoy(TuD)的MISSION® 合成及慢病毒microRNA抑制剂,能够长效抑制人或小鼠中的任何miRNA。其他物种的microRNA抑制剂也可根据要求定制。 [2013/2/19]

  • 准确检测血液样本中microRNA的利器与应用[新品推荐]

    血液循环中的microRNA表达变化指征着疾病的发生和发展阶段。同时,血液样品在临床易于获取,且稳定不易降解,因此对于microRNA标记物筛选具有广阔研究前景。丹麦Exiqon 公司miRCURY LNA™ Universal RT microRNA PCR芯片,将芯片的高通量优势与PCR的准确灵敏特点完整结合,实现对血清血浆等各种临床样本中的microRNA准确特异检测。 [2012/12/4]

  • 从体液中高效提取microRNA[新品推荐]

    miRCURY™ RNA Isolation Kit – Biofluids让研究人员能够从几乎所有类型的体液中获得高质量的miRNA。整个流程由6个简单步骤组成,而时间仅需45分钟。试剂盒采用一种专利的树脂作为分离基质,无需使用酚氯仿等危险化学品。 [2012/12/3]


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