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  • 让我们来谈谈困难样本的NGS文库制备[选购宝典]

    面对一些难以对付的样本,比如核酸量有限的、高度降解的或富含抑制剂的,过去人们只能摊摊手,表示无能为力。当然,科研人员的智慧是无穷的,这些问题可难不倒他们。 [2017/8/11]

  • 啥!?人类基因组还没有真正完成全基因组测序呢!

    或许大家还记得2003年来自“纽约时报”的报道—— “科学家称人类基因组已经完成了DNA的测序”。那一年“人类基因组”这一历史性成就不仅被《Science》和《Nature》杂志争相报道了,同时也登上了世界各地的新闻头条。然而,事实却存在着一些问题。 [2017/8/4]

  • 首个DNA应用商店上线,带你轻松玩转DNA

    通过简单快速的检测,你可以了解有关血统、健康、营养和健身等方面的信息,比如设计一款适合你遗传组成的健康饮食,了解你患上心血管疾病的风险,了解你的母乳中有多少DHA,甚至根据你的DNA定制一款独一无二的围巾。总之,轻松玩转你的DNA。 [2017/7/27]

  • 癌症与免疫系统初探5:肿瘤免疫治疗

    基于树突状细胞(DC)的肿瘤疫苗耐受性良好,副作用少,可产生抗肿瘤的免疫应答,但从总体而言,它们的好处仍然有限。最近的研究表明,CD141+ DC在抗肿瘤反应中发挥重要作用。直接针对体内DC的疫苗目前正在开发中。 [2017/7/10]

  • PacBio 全长转录本测序发现新的前列腺癌生物标志物

    最新一期《Clinical Cancer Research》上刊登了来自美国明尼苏达大学研究团队关于前列腺癌肿瘤标志物的最新研究成果,文章题为“Androgen receptor variant AR-V9 is co-expressed with AR-V7 in prostate cancer metastases and predicts abiraterone resistance”。 [2017/7/6]

  • 癌症与免疫系统初探4:肿瘤微环境

    肿瘤微环境被定义为肿瘤存在的细胞环境。这包括周围的血管、免疫细胞、成纤维细胞、其他细胞、信号分子以及细胞外基质(ECM)。研究也报道了肿瘤与微环境之间的动态关系。 [2017/7/4]

  • miRNA的测序文库制备,你需要注意什么?[心得点评]

    miRNA通常是利用RT-qPCR和芯片来研究的,但miRNA测序却能让你发现一些新东西。尽管miRNA的测序在本质上与其他RNA相同,但样本处理时的一些步骤却是不同的。这篇文章将介绍一些最新的方法,帮助你高效制备miRNA-Seq的文库。 [2017/6/30]

  • 癌症与免疫系统初探3:肿瘤免疫编辑

    肿瘤免疫编辑是适应性和先天免疫系统控制肿瘤生长和塑造肿瘤免疫原性的过程。此过程包括三个阶段:清除(elimination)、平衡(equilibrium)和逃逸(escape)。 [2017/6/27]

  • 利用PacBio测序检测与胶质母细胞瘤相关但之前无法确定的结构变异

    为了改善胶质母细胞瘤的基因组DNA样品的结构变异检测,金唯智在PacBio Sequel平台上对人类样品进行了全基因组测序分析,成功鉴定出近20,000个之前无法确定的结构变异。 [2017/6/5]

  • 靶向富集:让测序经费花在刀刃上[心得点评]

    以外显子组为例,它仅占基因组的1%到2%,但却含有85%的已知致病突变。这么看来,与全基因组测序(WGS)相比,外显子组测序相当于减少了98%的测序工作。不用说,靶向测序集合(panel)更是大大减轻你的负担。在此,我们看看研究人员是如何开展靶向富集的,以及他们研究时的考虑因素。 [2017/5/22]

  • 癌症与免疫系统初探2:T细胞库和抗体库

    人体免疫系统提供一种保护作用,来对抗各种各样的病原体以及肿瘤。这种保护是通过B 细胞和T 细胞表面与致病性或病原体来源的抗原结合的巨大的受体库来介导的。T 细胞通过表达异二聚体(αβ 或γδ)细胞表面受体(T 细胞受体,或TCR)来介导细胞免疫,这需要异源细胞呈递与MHC结合的肽段抗原。 [2017/5/18]

  • PacBio将推出新的应用程序,协助稀有变异等分析

    随着新一代测序的日渐普及,大家手头的数据越来越多,不过,数据分析也成了更大的难题。为了帮助大家应对挑战,Pacific Biosciences公司将推出三款新的应用程序,可用于稀有变异、结构变异和微生物WGS的分析。 [2017/5/10]

  • Illumina 靶向测序定制Panel 服务全线开放

    Illumina 针对广大客户的需求,在固定内容的试剂盒或靶向集合之外,另推出Panel 定制服务。仅需提供目标区域,即可经由自助在线定制工具或Illumina专业设计服务,获得个性化的定制Panel。 [2017/4/28]

  • 从ccfDNA中挖掘深度信息,你需要这个一体化方案[新品推荐]

    由于ccfDNA通常以低浓度存在,带稀有突变或被片段化,故整个流程必须灵敏可靠。QIAGEN为研究人员从ccfDNA中挖掘深度信息提供了必需的一切:一个完整且简化的流程,覆盖采集、稳定、分离、分析和数据解释。快看QIAGEN的解决方案! [2017/4/24]

  • 癌症研究经验谈3:三位大师畅谈高通量测序对临床研究的影响

    测序技术已大大超出了Carlos Bustamante、Stephen Kingsmore和John Mattick三位博士的预期。如果你在他们的职业生涯的早期询问他们,是否有一天我们能在一天内测序人类全基因组,他们的反应将分别是:“疯言疯语!”,“绝对不可能。”以及“做梦也不敢想。” [2017/4/17]

  • 在miRNA测序中,别让接头二聚体和污染性RNA偷走了您的序列……[新品推荐]

    尽管NGS是发现新miRNA的默认工具,但市面上的文库制备试剂盒很繁琐,会引入偏向。因此,qPCR一直是定量miRNA表达的首选技术。如今,QIAseq miRNA Library Kit重新定义了小RNA测序产品,包含了其他测序试剂盒没有的一些独特功能。 [2017/4/11]

  • Science最新报道:单细胞测序助跑癌症精准分型

    麻省综合医院(MGH)、MIT布罗德研究所、哈佛大学近日在Science杂志上发表了一篇文章(3月31日),使用单细胞RNA测序技术,并结合癌症基因组图谱分析了星形细胞瘤和少突神经胶质瘤两种脑神经胶质瘤的细胞组成。通过细致全面的基因表达分析,结果显示两种肿瘤可能源自同一种神经前体细胞可以通过基因突变类型和微环境组成对该两种肿瘤进行区分。 [2017/4/1]

  • Oxford Nanopore推出新款纳米孔测序仪,并公开售价[新品推荐]

    英国生物技术公司Oxford Nanopore本周宣布,它的纳米孔测序产品家族添加了一个新成员:GridION X5。这个新的系统内最多能够带动五个MinION流动槽,并在单台设备中完成数据处理。 [2017/3/17]

  • 癌症研究经验谈2:靶向重测序实现了体细胞嵌合的高通量检测

    Saumya Jamuar博士是新加坡KK妇女儿童医院的临床遗传学家,也是Global Gene公司的联合创始人,这是一家创新的基因组学研究开发公司。他开创了第一种高通量的系统方法来鉴定与大脑皮质畸形相关的体细胞突变。他利用NGS开展此项研究,使用的是Illumina的MiSeq系统和TruSeq® Custom Amplicon assay。 [2017/3/16]

  • 癌症研究经验谈1:新一代测序是生物标志物发现的无价之宝

    现在,我们来聚焦一些顶尖的科学机构,看看他们如何利用新工具来改善癌症的诊断和治疗。Georges-François Leclerc中心的实验室研究人员利用MiSeq®和NextSeq® 500系列来开展RNA-Seq、ChIP-Seq和外显子组测序,以搜索与癌症相关的基因表达谱。 [2017/3/2]


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