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  • 福利贴 Illumina测序方法汇总[创新技巧]

    在高通量测序中,Illumina的测序仪一直是重要的工具。然而,人们渐渐发现,标准的操作步骤已不能满足他们的特定需求。于是,研究人员不断开发出新的NGS样品制备方法,以解决新的挑战。为此,Illumina编辑了一份小册子,收录了近年来发表的各种Illumina测序应用。 [2014/6/26]

  • QIAGEN推出3款NGS样品制备新产品[新品推荐]

    自QIAGEN宣布要推出新一代测序仪以来,大家都在翘首盼望这台新仪器的上市。年初,QIAGEN表示将在今年推出GeneReader测序仪,不过,5月份他们又改口了,说要延迟到2015年推出。唉,我们等到花儿也谢了。但是,GeneReader虽没来,NGS样品制备方面的新产品却在不断上市。 [2014/6/23]

  • 如何确定新突变是否是体细胞突变[创新技巧]

    在研究DNA样品中的突变时,确定新的序列变化到底是体细胞突变,还是生殖细胞系的多态性,这似乎是件挺困难的事。最近,西班牙纳瓦拉大学(University of Navarra)的研究人员介绍了一种非常简单的方法,可在没有配对组织样品时鉴定DNA样品中的体细胞突变。 [2014/6/16]

  • 利用NimbleGen序列捕获技术实现定向RNA-Seq[创新技巧]

    最近在Nature Protocols杂志上在线发表的一篇文章介绍了利用NimbleGen序列捕获技术进行转录组定向测序,用于RNA研究中基因发现和表达定量。 [2014/6/5]

  • 对付无法培养的微生物 宏基因组学研究策略[创新技巧]

    与大肠杆菌不同,绝大多数微生物不能在琼脂板或液体培养基中培养,这使得科学家无法研究它们的生物学、生物化学以及对生态、健康和疾病的贡献。Schloss和Handelsman将无法培养微生物的问题比喻成希腊神话中的戈尔迪之结,并提出了两个基本的解决方案。一是要弄清楚如何培养这些无法培养的东西。二是用利剑斩断这个结,这种策略被称为宏基因组学。 [2014/5/29]

  • 强大的NGS分析软件CLC Genomics Workbench[新品推荐]

    随着新一代测序(NGS)技术的发展,测序仪的通量不断提高,使得测序成本持续下降。这当然是大家喜闻乐见的。然而,海量数据的产生,也为数据分析带来了不小的挑战。好在强大的NGS分析软件不断出现,能帮助研究人员应对这一挑战。今天,我们就给大家介绍一款深受欢迎的软件CLC Genomics Workbench。 [2014/5/28]

  • Illumina推出HiSeq v4试剂,产量高达1 Tb[新品推荐]

    生物通报道 Illumina公司近日发布了新的HiSeq v4试剂,能够比现有的v3试剂带来更高的产量,同时显著减少运行时间。有了v4试剂,HiSeq 2500每次运行能产生40亿个reads和1 Tb的数据总输出量。这种新的能力让研究人员以无与伦比的规模开展基因组、外显子组和转录组分析。 [2014/5/21]

  • NGS数据分析的捷径:云计算[新品推荐]

    测序完成了?这真是个好消息。不过别高兴地太早,更艰巨的工作在等着你呢。数据分析,也不是一项轻松的任务。对于这个问题,传统的解决方案是将存储和计算分析的工作交给计算机集群,但这是许多研究人员无法企及的。如今,越来越多的研究人员选择了另一条道路。他们利用Dropbox和Gmail的服务,将他们的工作移至云端。 [2014/4/22]

  • Illumina发布癌症研究的新产品[新品推荐]

    Illumina继年初推出NextSeq 500和HiSeq X Ten测序系统之后,日前再次推出新产品,能从与癌症相关的血液和组织中发现基因组变异。这些新产品将充分利用该公司的新一代测序和芯片扫描系统,为基础和临床癌症研究带来完整的解决方案。 [2014/4/15]

  • 如何研究复杂遗传病的机制[创新技巧]

    在分析遗传机制时,人们不仅仅要覆盖单个或多个基因,还需要构建完整的突变谱,从更大的视角去了解疾病。这不但有利于基础研究,也有利于未来的疗法开发。那么,具体策略如何呢?Oxford Gene Technology(OGT)公司近日发布了基因组分析的白皮书,介绍了临床遗传学研究的策略。 [2014/4/11]

  • NGS文库制备新品实现5-hmC分析[新品推荐]

    近年来,新一代测序(NGS)平台在甲基化研究中开始崭露头角。它们带来了非常灵敏的DNA甲基化图谱,以单分子分辨率覆盖整个CpG岛。然而,对于时下热门的5-hmC研究,似乎还缺乏专门的样品制备工具。为此,Zymo Research公司近日推出两款新的NGS文库制备试剂盒,适用于全基因组范围的5-hmC和5-mC分析。 [2014/4/10]

  • PacBio升级分析软件 实现两项新应用[新品推荐]

    Pacific Biosciences公司近日宣布了其单分子实时(SMRT)DNA测序平台的软件升级。SMRT Analysis 2.2提供了增强的功能,支持两项新的应用:Iso-Seq™全长转录本/异构体测序以及人类白细胞抗原(HLA)单体型定相。 [2014/4/8]

  • 访谈后记——PacBio完成大型基因组测序项目例证(下篇)

    自《全球访谈纪要:PacBio RS第三代单分子测序系统》专题发布以来,不断有读者来电来函参与讨论,其中讨论较多的一条是,PacBio技术是否只在微生物领域才能发挥得淋漓尽致,换句话说,是否应用到大型基因组测序项目中就大打折扣。本期笔者将通过几个大型基因组测序项目的案例分析形式,以自己粗浅的知识和检索概括,就该问题展开白话式的剖析。 [2014/4/4]

  • 访谈后记——PacBio完成大型基因组测序项目例证(上篇)

    自《全球访谈纪要:PacBio RS第三代单分子测序系统》专题发布以来,不断有读者来电来函参与讨论,其中讨论较多的一条是,PacBio技术是否只在微生物领域才能发挥得淋漓尽致,换句话说,是否应用到大型基因组测序项目中就大打折扣。本期笔者将通过几个大型基因组测序项目的案例分析形式,以自己粗浅的知识和检索概括,就该问题展开白话式的剖析。 [2014/4/3]

  • SMRT测序改善CRISPR效果的评估[创新技巧]

    新兴的CRISPR技术在短短一年多的时间内掀起了基因组编辑的热潮。然而,对于这些基因改造手段的效率和结果,我们仍难以评估。最近,单分子测序带来了一个好消息。研究人员证实,单分子实时(SMRT)测序技术能够同时测定任何位点的基因组编辑结果。这项研究成果发表在3月27日的《Cell Reports》上。 [2014/4/1]

  • 甲基化研究方法的革新——罗氏NimbleGen SeqCap Epi产品在中国上市

    罗氏NimbleGen公司 最新上市的SeqCap Epi基因组DNA甲基化序列富集产品,结合二代测序,可以进行在单碱基分辨率的样品甲基化分析。该产品系列包括:固定内容的、人类全基因组水平的可甲基化位点的DNA片段富集方案;以及,适合于各种不同应用的由客户自选区域的目标序列富集产品。 [2014/3/25]

  • NGS样品制备指南之自动化篇[新品推荐]

    在经历了几年的高速发展之后,新一代测序仪终于放慢了脚步。如今,样品制备成为NGS中新的亮点。新试剂、新仪器不断涌现,以缩短时间,提高通量。同时,新方法也在不断被开发,以处理更少的样本,如单细胞。这一次,生物通带您走近NGS的样品制备,看看有哪些新工具能帮助我们应对样品制备的挑战。 [2014/3/21]

  • NGS样品制备指南之RNA篇[新品推荐]

    在经历了几年的高速发展之后,新一代测序仪终于放慢了脚步。如今,样品制备成为NGS中新的亮点。新试剂、新仪器不断涌现,以缩短时间,提高通量。同时,新方法也在不断被开发,以处理更少的样本,如单细胞。这一次,生物通带您走近NGS的样品制备,看看有哪些新工具能帮助我们应对样品制备的挑战。 [2014/3/20]

  • NGS样品制备指南之DNA篇[新品推荐]

    在经历了几年的高速发展之后,新一代测序仪终于放慢了脚步。如今,样品制备成为NGS中新的亮点。新试剂、新仪器不断涌现,以缩短时间,提高通量。同时,新方法也在不断被开发,以处理更少的样本,如单细胞。这一次,生物通带您走近NGS的样品制备,看看有哪些新工具能帮助我们应对样品制备的挑战。 [2014/3/18]

  • transOMIC重拳推出新生代NGS靶向富集产品——TargetRich®

    TransOMIC的新产品TargetRich®是专门为靶向富集而生的一款新生代靶向捕获产品。真正的一管操作,基于巢式PCR技术经两步PCR富集过程加之两步纯化步骤,1.25小时手工操作即可完成靶向富集的上机测序文库构建。省时省力省心的设计,真正贴心的产品形式,对靶向区域的高效击中捕获,适用于低DNA含量样本,提供量身定制的客户需求产品,产品的多种优势使其成为一款性价比非常高的靶向富集产品选择。 [2014/3/14]


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