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  • Oxford Nanopore这次又发布了什么?

    近日,Oxford Nanopore公司在伦敦举行了London Calling用户会议,发布了一些新产品。其中,最受期待的还是首席技术官Clive Brown的报告。当然,他也没让大家失望。与会者称这次发布会是“改变游戏规则的”,形容当时的气氛就像2007年苹果发布iPhone一样。这会不会有些夸张?让我们来看这次会议的一些亮点。 [2015/5/18]

  • 遗传病家系的高通量测序:您需要了解的一些事

    高通量测序技术的出现与普及,为遗传病的研究带来了前所未有的机会。它提高了遗传病致病基因克隆和鉴定的效率,使人类对自身基因功能的认识大大加速。本文对遗传病家系的高通量测序分析提出一些注意事项,希望有助于相关的研究。 [2015/5/6]

  • 癌症研究中的数据挖掘工具[选购宝典]

    对于癌症研究人员而言,采集数据仅仅是个开始;找到引起或促进疾病的基因才是“压力山大”。关键的挑战在于找出特定的突变,它们引发正常细胞癌变。此时此刻,大多数的癌症驱动突变都隐藏在遗传信息的海洋之中。如何大海捞针?这些新的计算和生物信息学工具也许能帮助你。 [2015/4/30]

  • 如何理解PacBio的准确度?

    第三代测序中的PacBio单分子实时(Single Molecule Real-Time, SMRT)DNA测序可以实现超过99.999%(QV50)的高度精确测序,且不受DNA序列中GC和AT含量的影响,平均读长可达10-15kb(最长>40kb),这是如何实现的呢?这是因为SMRT技术在与DNA测序精确度相关的三个方面均有独到之处…… [2015/4/29]

  • 华大基因发布基因组数据分析云计算平台BGI Online

    2015年4月20日,全球最大的基因组学研发机构华大基因在全球发布一款强大且具高安全性的基因组数据分析云计算平台服务产品 -- BGI Online。BGI Online为新一代测序项目的管理提供一站式解决方案,让用户可以轻松创建和运行复杂的数据分析流程。 [2015/4/21]

  • 追赶微生物组的热潮,你准备好了吗?(下)[创新技巧]

    有了新型的测序仪,人们开始着手研究健康的人体中生活着哪些类型的微生物。当然,同样是健康的人,你和我的微生物群落就大不相同,就算同一个人,不同部位的微生物也大相径庭。这种差异性使得人们难以描述“正常的”微生物组。于是,研究人员从数百名个体中采样,提取信息。他们关注各个部位,包括口腔、皮肤、鼻腔、肠道,以及泌尿生殖道。 [2015/4/3]

  • 追赶微生物组的热潮,你准备好了吗?(上)[创新技巧]

    有了新型的测序仪,人们开始着手研究健康的人体中生活着哪些类型的微生物。当然,同样是健康的人,你和我的微生物群落就大不相同,就算同一个人,不同部位的微生物也大相径庭。这种差异性使得人们难以描述“正常的”微生物组。于是,研究人员从数百名个体中采样,提取信息。他们关注各个部位,包括口腔、皮肤、鼻腔、肠道,以及泌尿生殖道。 [2015/4/2]

  • 赛默飞发布Ion Torrent技术更新和新产品预览

    赛默飞世尔科技于上周在佛洛里达州马可岛举办的基因组生物学技术进展年会(AGBT)上发布了Ion Torrent测序技术的最新进展情况,充分展示赛默飞在研发新一代测序业务上的努力和成果,从而进一步表明其致力于将新技术应用于临床研究的决心。 [2015/3/19]

  • 三篇文章介绍RNA-Seq数据分析的新工具[新品推荐]

    新年伊始,RNA-Seq的数据分析方法就如雨后春笋般涌现。在最近的一个月内,三篇介绍RNA-Seq数据分析新方法的文章发表在Nature集团旗下的刊物上,其中一篇发表在《Nature Methods》上,另外两篇都发表在《Nature Biotechnology》上。 [2015/3/17]

  • Illumina推出HLA分型的新模式[创新技巧]

    人类白细胞抗原(HLA)区域为各种疾病和状况提供了重要的见解。不幸的是,由于此区域的高度多态性,HLA分型存在不小的挑战。近日,Illumina公司宣布推出TruSight HLA,这个方案通过测序11个HLA基因而全面查看HLA区域,带来准确的HLA分型。 [2015/3/16]

  • 新一代测序2015更新:小鲜肉与大叔(下)

    小鲜肉常有,而大叔不常有。经过岁月的洗礼,大叔褪去了小鲜肉的稚嫩与青涩,愈发成熟,更显魅力。Illumina、Pacific Biosystems便是这样的帅大叔。他们上市多年,在市场上占据一定的地位,应用也日趋广泛。 [2015/3/11]

  • 新一代测序2015更新:小鲜肉与大叔(上)

    从2005年454公司首推新一代测序仪以来,转眼已是十年光阴。在这十年间,许多新平台问世,有的昙花一现,有的则从小鲜肉变成了帅大叔。当然,这是一个小鲜肉辈出的时代。新的平台仍在不断上市,带来进步,带来希望。 [2015/3/10]

  • 现在有机会试用纳米孔测序仪

    英国Oxford Nanopore Technologies公司近日宣布,它重新开放了MinION测序仪的早期试用计划,希望吸纳更多用户来参与。同时,越来越多的计划参与者开始展示和发表他们的结果。 [2015/3/4]

  • 让NGS的文库制备一步到位[新品推荐]

    在第16届基因组生物学技术进展大会(AGBT)召开前夕,Illumina公司宣布推出NeoPrep文库制备系统。这是一款数字微流体平台,能够大大简化新一代测序(NGS)的文库制备,带来测序即用的高质量文库。 [2015/3/3]

  • 单细胞转录组学的研究工具盘点[新品推荐]

    近几年,研究人员已经开发出一些工具,能够将几个组学学科的规模降至单细胞水平,包括转录组学。一些方法是基于新一代DNA测序,另一些则依靠显微镜或流式细胞仪。不过,这些方法都发现,细胞群体看似均一,其实是高度异质性的。 [2015/2/17]

  • 有一个地方,测序始终难以覆盖[创新技巧]

    也许你并不知道,人类基因组并没有测序完全。一些重复区域和难测序的序列始终犹抱琵琶半遮面。同时,遗传变异也是个挑战。在新一期的《BioTechniques》杂志中,Nathan Blow介绍了一些新的技术和方法,能帮助人们绘制这些难以读取的DNA片段。 [2015/2/16]

  • 来一次说做就做的测序

    虽然高通量新一代测序总体成本大幅下降,但想在二代测序平台上做出好的研究成果也并不便宜,尤其是在样本量大的时候。另外,如何解读海量测序数据的生物学意义也是一个很大的问题。可以说,基因组测序还远远没到想做就做的地步。 [2015/2/12]

  • Illumina推出四款新的测序系统[新品推荐]

    一年一度的摩根大通保健大会(JP Morgan Healthcare Conference)于1月12日在旧金山开幕。Illumina的CEO Jay Flatley昨日登上演讲台,宣布推出四款新的测序系统。这四款新平台分别是HiSeq X Five系统,HiSeq 3000和HiSeq 4000系统,以及NextSeq 550系统。 [2015/1/14]

  • 赛默飞推出三项针对遗传研究的创新技术

    近日,科学服务领域的世界领导者赛默飞(以下简称:赛默飞)推出了三项针对遗传研究的创新技术:用于加强Ion PGM系统中单核苷酸多态性 (SNP) 和插入缺失 (Indel) 检测性能的新型酶,用于基因遗传性耳聋研究的引物组,以及对靶向捕获引物设计热门网站AmpliSeq Designer的升级。 [2015/1/14]

  • 癌症研究概览13:技术因素

    幸运的是,Illumina的测序技术可无前提假设、高分辨率地分析基因组。良好的实验设计可进一步优化技术能力并产生更多可解释的可靠数据。这一部分将着重强调生物学研究的独特之处以及研究人员在设计实验时需要注意的事项。 [2014/12/31]


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