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  • Illumina宣布测序技术大创新

    Illumina公司近日宣布了一系列产品和技术上的创新,从样品制备到系统改进再到数据分析,这有望带来基因组研究上的新突破。随着平台的不断改进,测序速度、准确性、产量和流程都有望改善。 [2013-1-17]

  • 酸性矿山废水中微生物分布影响因素

    国内科学家对中国东南部14个地区的59个AMD样本进行了微生物群落分布的研究。通过对AMD样本中的微生物16SrRNA基因进行454测序,对测序结果进行了物种分布和聚类的分析,最终发现,影响微生物群落的主要因素并不是地域,而是环境的变化,如铁离子、硫酸根离子、有机物含量等等,相关学术论文发表在《自然》子刊ISME(International Society for Microbial Ecology)上。 [2013-1-17]

  • 454测序参与棉花基因组进化研究工作

    近日,来自8个国家的70多名科学家共同参与的国际合作项目----棉花基因组测序完成。该研究的学术文章《棉花基因组的多倍化及纤维的发育》发表在《自然》杂志上。研究中,科学家们结合传统的Sanger测序与新一代454测序技术对雷蒙德氏棉基因组进行了组装工作,获得了其87.7%的全基因组序列。 [2013-1-16]

  • PacBio助力100K基因组计划 从头解密10万种食源性致病菌

    Pacific Biosciences公司宣布加州大学Davis分校的研究人员将使用PacBio RS测序仪来进行100K基因组计划,该计划是去年由加州大学Davis分校、安捷伦公司和FDA共同发起的,旨在测序100,000种食源性致病菌的基因组。 [2013-1-15]

  • PacBio RS第三代单分子测序系统全球访谈纪要(三)[心得点评]

    生物通就几个广受关注的主题征询收集了众多声名赫赫的PacBio用户的心得意见,以用户现身说法的方式,“原汁原味”为您呈上这一第三代单分子测序系统全球访谈纪要系列报道。实现对碱基修饰进行直接测序的意义所在?本文介绍了碱基修饰直接测序法的经典案例,以及一些先行者的看法,包括NEB公司CSO Richard Roberts。 [2013-1-14]

  • PacBio RS第三代单分子测序系统全球访谈纪要(二)[心得点评]

    第三代单分子测序技术还值得继续关注吗?当然!PacBio最新升级的商品化试剂使得用户平均测序读长达到了前所未有的5000bp!PacBio单分子实时测序到底怎么样?生物通就几个广受关注的主题征询收集了众多声名赫赫的PacBio用户的心得意见,以用户现身说法的方式,“原汁原味”为您呈上这一第三代单分子测序系统全球访谈纪要系列报道。 [2012-12-28]

  • Ion PGM测序仪读长达到400 bp[新品推荐]

    Life Technologies公司近日宣布,适用于Ion PGM™测序仪的400 bp测序试剂盒已上市。读长的改善使产量增加,也带来了更完整的细菌de novo组装。目前Ion 318™芯片上的400 bp运行的产量可达1-2 Gb。 [2012-12-27]

  • 2012测序技术大事记

    这一年来,测序方面的进展和产品应该给大家留下了深刻的印象,几乎每个星期都有重要成果发表在顶级期刊上。新产品也在不断涌现,让我们离千元基因组的目标又近了一步。同时,单细胞测序技术的快速发展也有望揭开更多细胞的秘密。 [2012-12-25]

  • 2012最受欢迎的测序文章,点滴决定成败

    作为测序生力军的第三代测序技术能够大大增加测序的效率和通量,不过很显然第二代测序技术仍会继续被广泛采用。近日BioTechniques杂志评出了今年最受欢迎的两篇测序文章以飨读者,而这两篇文章正是目前技术过渡时期的写照。 [2012-12-20]

  • 眼见为实的电镜测序技术

    此前科学家们曾提出,基于电子显微镜的第三代DNA测序技术将能够得到超常的读长。今年有两项研究分别展示了这一理论的实用性,使电镜测序成为来年备受期待的新测序方法。 [2012-12-18]

  • HiSeq 2500:强大的测序仪如今更快更灵活[新品推荐]

    HiSeq 2000系统绝对是当前最广泛采用的新一代测序主流平台。HiSeq 1500/2500系统是这个平台中的最新成员。相同的核心结构,整合最新进展如内置簇生成和快速运行模式,可实现最快的无人值守流程:能够在大约24小时内完成整个基因组的测序,即“一天一个基因组”。 [2012-12-11]

  • 罗氏GS Junior测序帮助确认新型冠状病毒出现[创新技巧]

    454测序长度长的特点帮助了更高完整度的基因组拼接,从而可以进行氨基酸序列的比较,这对于确认一个新型病毒极为重要。GS Junior的快速测序、简单生物信息分析需求适合于此类急性传染性、爆发性事件的快速分子生物学检测。 [2012-12-10]

  • 如何快速发现肿瘤中的热点突变[新品推荐]

    如今,Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2如今经过扩展,靶定50个癌基因和肿瘤抑制基因的“热点”区域,广泛覆盖KRAS、BRAF和EGFR基因,让转化和临床研究人员能够快速追踪肿瘤学研究。 [2012-12-7]

  • 454测序应用于花生种子败育研究

    近期,国内学者们使用454测序平台对花生种子的转录组进行了研究1,通过对地面上与地下的种子转录组cDNA文库进行测序与拼接,获得了近30,000条contig序列。 [2012-12-7]

  • 新一代测序将如何改变法医基因组学[心得点评]

    Bruce Budowle博士是北德克萨斯大学健康科学中心(UNTHSC)应用遗传学研究所的执行主任,他领导了一组研究人员来探索法医学应用,如新一代测序。Budowle博士向我们谈论了他对NGS的想法以及NGS对法医基因组学的潜在影响。 [2012-12-6]

  • 454测序应用于HBV耐药性突变检测[创新技巧]

    目前,韩国的研究者们利用454测序平台对30个乙肝患者进行了深度测序,通过对每个患者的HBV样本进行平均1700倍的深度测序后,这种技术检测到了一些直接测序未检测到的突变位点,突变率从1.1%到23.8%不等。 [2012-12-6]

  • GS FLX+ 2.8软件带来更多的出色表现[新品推荐]

    GS FLX+系统连续创新,基于同样的机器,相同的化学反应,推出新的v2.8软件,带来更优秀的测序表现。目前基于软件的优化可达到稳定的高质量,更长读长的Shotgun测序结果。 [2012-12-6]

  • PacBio RS第三代单分子测序系统全球访谈纪要(一)[心得点评]

    第三代单分子测序技术还值得继续关注吗?当然!PacBio最新升级的商品化试剂使得用户平均测序读长达到了前所未有的5000bp!PacBio单分子实时测序到底怎么样?生物通就几个广受关注的主题征询收集了众多声名赫赫的PacBio用户的心得意见,以用户现身说法的方式,“原汁原味”为您呈上这一第三代单分子测序系统全球访谈纪要系列报道。 [2012-12-5]

  • 新一代测序又PK:Baylor HGSC报告Ion Proton测序心得[心得点评]

    Baylor HGSC目前拥有16台Illumina的HiSeq和2台MiSeq、4台Ion Torrent PGM和和4台Proton、3台罗氏/454仪器,1台PacBio RS以及若干台Sanger测序仪。他家的测序使用报告和比较,绝对够分量,不可不读…… [2012-12-5]

  • 万人药物基因组研究项目采用罗氏NimbleGen序列捕获技术

    来自美国的药物基因组研究专家将开展一个由一万人参加的药物基因组项目,将参加这个的医疗记录与他们的基因组信息进行关联,这些信息主要包括了84个与药物应答相关的基因情况。类似这样的项目将帮助更加合理的药物使用,减少药物副作用的产生,节省医疗开支。 [2012-11-28]


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