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  • QIAGEN透露测序仪的更多细节

    AGBT 2013,目前规模最大的测序技术会议,于2013年2月20日-23日在美国佛罗里达州马可岛举行。QIAGEN公司在这次会议上向客户介绍了其新一代测序(NGS)的流程,旨在将这一突破性的技术常规应用在生命科学研究之外的领域,如临床研究和诊断。 [2013-2-26]

  • Illumina:85%的台式测序数据来自MiSeq

    AGBT 2013,目前规模最大的测序技术会议,于2013年2月20日-23日在美国佛罗里达州马可岛举行。纵观2013 AGBT的日程,基本都是关于“临床”、“癌症”、“基因组”、“测序”、“分析”。无疑,测序技术的应用是这届会议的亮点。不过,各大公司也有一些新技术与大家分享。 [2013-2-22]

  • 利用454测序技术进行HIV耐药检测可提高灵敏度[创新技巧]

    由于HIV繁殖存在错误率高的逆转录这一独特的复制过程,因此在药物治疗中也最易出现耐药性。当前,HIV耐药株已成为医学界面临的一个新挑战。利用454深度测序技术可以达到传统检测方法无法检测的灵敏度,除了可以进行定量检测耐药位点突变情况外,还可检测低至1%的突变情况,从而为HIV治疗提供了更加准确的信息。 [2013-2-19]

  • 2013新一代测序仪将走向何方

    尽管今年的摩根大通保健大会没有出现去年的新品频发的盛况,但新一代测序仪仍在不断进步。读长、准确性、通量、软件,无一不在变化,让测序更高、更快、更强。各大公司推出或即将推出哪些新产品?请看本文。 [2013-2-6]

  • NEB NGS文库制备产品之使用体会[心得点评]

    New England BioLabs(NEB)公司推出了30多款样品制备方面的产品(NEBNext系列),适合Illumina、454、Ion Torrent等多个平台。NEBNext DNA Sample Prep Master Mix Set for Illumina 是一款文库制备产品,适用于后续的定向富集或在Illumina的HiSeq或MiSeq平台上直接测序。这款试剂盒的效果如何?且看本文。 [2013-2-1]

  • Illumina宣布测序技术大创新

    Illumina公司近日宣布了一系列产品和技术上的创新,从样品制备到系统改进再到数据分析,这有望带来基因组研究上的新突破。随着平台的不断改进,测序速度、准确性、产量和流程都有望改善。 [2013-1-17]

  • 酸性矿山废水中微生物分布影响因素

    国内科学家对中国东南部14个地区的59个AMD样本进行了微生物群落分布的研究。通过对AMD样本中的微生物16SrRNA基因进行454测序,对测序结果进行了物种分布和聚类的分析,最终发现,影响微生物群落的主要因素并不是地域,而是环境的变化,如铁离子、硫酸根离子、有机物含量等等,相关学术论文发表在《自然》子刊ISME(International Society for Microbial Ecology)上。 [2013-1-17]

  • 454测序参与棉花基因组进化研究工作

    近日,来自8个国家的70多名科学家共同参与的国际合作项目----棉花基因组测序完成。该研究的学术文章《棉花基因组的多倍化及纤维的发育》发表在《自然》杂志上。研究中,科学家们结合传统的Sanger测序与新一代454测序技术对雷蒙德氏棉基因组进行了组装工作,获得了其87.7%的全基因组序列。 [2013-1-16]

  • PacBio助力100K基因组计划 从头解密10万种食源性致病菌

    Pacific Biosciences公司宣布加州大学Davis分校的研究人员将使用PacBio RS测序仪来进行100K基因组计划,该计划是去年由加州大学Davis分校、安捷伦公司和FDA共同发起的,旨在测序100,000种食源性致病菌的基因组。 [2013-1-15]

  • PacBio RS第三代单分子测序系统全球访谈纪要(三)[心得点评]

    生物通就几个广受关注的主题征询收集了众多声名赫赫的PacBio用户的心得意见,以用户现身说法的方式,“原汁原味”为您呈上这一第三代单分子测序系统全球访谈纪要系列报道。实现对碱基修饰进行直接测序的意义所在?本文介绍了碱基修饰直接测序法的经典案例,以及一些先行者的看法,包括NEB公司CSO Richard Roberts。 [2013-1-14]

  • PacBio RS第三代单分子测序系统全球访谈纪要(二)[心得点评]

    第三代单分子测序技术还值得继续关注吗?当然!PacBio最新升级的商品化试剂使得用户平均测序读长达到了前所未有的5000bp!PacBio单分子实时测序到底怎么样?生物通就几个广受关注的主题征询收集了众多声名赫赫的PacBio用户的心得意见,以用户现身说法的方式,“原汁原味”为您呈上这一第三代单分子测序系统全球访谈纪要系列报道。 [2012-12-28]

  • Ion PGM测序仪读长达到400 bp[新品推荐]

    Life Technologies公司近日宣布,适用于Ion PGM™测序仪的400 bp测序试剂盒已上市。读长的改善使产量增加,也带来了更完整的细菌de novo组装。目前Ion 318™芯片上的400 bp运行的产量可达1-2 Gb。 [2012-12-27]

  • 2012测序技术大事记

    这一年来,测序方面的进展和产品应该给大家留下了深刻的印象,几乎每个星期都有重要成果发表在顶级期刊上。新产品也在不断涌现,让我们离千元基因组的目标又近了一步。同时,单细胞测序技术的快速发展也有望揭开更多细胞的秘密。 [2012-12-25]

  • 2012最受欢迎的测序文章,点滴决定成败

    作为测序生力军的第三代测序技术能够大大增加测序的效率和通量,不过很显然第二代测序技术仍会继续被广泛采用。近日BioTechniques杂志评出了今年最受欢迎的两篇测序文章以飨读者,而这两篇文章正是目前技术过渡时期的写照。 [2012-12-20]

  • 眼见为实的电镜测序技术

    此前科学家们曾提出,基于电子显微镜的第三代DNA测序技术将能够得到超常的读长。今年有两项研究分别展示了这一理论的实用性,使电镜测序成为来年备受期待的新测序方法。 [2012-12-18]

  • HiSeq 2500:强大的测序仪如今更快更灵活[新品推荐]

    HiSeq 2000系统绝对是当前最广泛采用的新一代测序主流平台。HiSeq 1500/2500系统是这个平台中的最新成员。相同的核心结构,整合最新进展如内置簇生成和快速运行模式,可实现最快的无人值守流程:能够在大约24小时内完成整个基因组的测序,即“一天一个基因组”。 [2012-12-11]

  • 罗氏GS Junior测序帮助确认新型冠状病毒出现[创新技巧]

    454测序长度长的特点帮助了更高完整度的基因组拼接,从而可以进行氨基酸序列的比较,这对于确认一个新型病毒极为重要。GS Junior的快速测序、简单生物信息分析需求适合于此类急性传染性、爆发性事件的快速分子生物学检测。 [2012-12-10]

  • 如何快速发现肿瘤中的热点突变[新品推荐]

    如今,Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2如今经过扩展,靶定50个癌基因和肿瘤抑制基因的“热点”区域,广泛覆盖KRAS、BRAF和EGFR基因,让转化和临床研究人员能够快速追踪肿瘤学研究。 [2012-12-7]

  • 454测序应用于花生种子败育研究

    近期,国内学者们使用454测序平台对花生种子的转录组进行了研究1,通过对地面上与地下的种子转录组cDNA文库进行测序与拼接,获得了近30,000条contig序列。 [2012-12-7]

  • 新一代测序将如何改变法医基因组学[心得点评]

    Bruce Budowle博士是北德克萨斯大学健康科学中心(UNTHSC)应用遗传学研究所的执行主任,他领导了一组研究人员来探索法医学应用,如新一代测序。Budowle博士向我们谈论了他对NGS的想法以及NGS对法医基因组学的潜在影响。 [2012-12-6]


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