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  • PacBio RS第三代单分子测序系统全球访谈纪要(四)[心得点评]

    AGBT(基因组生物学技术进展年会)2013在今年2月底刚刚结束,会议之后,生物通立即采集更新了众多声名赫赫的顶尖实验室用户就PacBio系统在靶向测序和临床诊断中的应用的看法和心得,令这一全球访谈更加精彩,可别错过! [2013/4/3]

  • 转录组测序结合蛋白质组分析探索蝾螈再生奥秘[创新技巧]

    来自德国及美国等处的研究人员针对基因组特别大,难以进行全基因组测序的动物,提出了以转录组测序与蛋白质组分析联合以解析功能基因的策略,并以蝾螈进行实验,开辟了组织及器官再生研究的新思路。该研究成果已发表近期的《Genome Biology》杂志上。 [2013/4/3]

  • 华大科技解决杂合基因组组装难题[创新技巧]

    华大科技最新推出杂合基因组解决方案—Ultra-Deep De novo,可以帮助科研人员更加高效地解决杂合基因组组装难题。Ultra-Deep de novo方案将极大推动杂合基因组研究的进展,为快速获得这些物种的高质量基因组图谱提供了强有力的保障。 [2013/4/1]

  • 如何突破测序限制 发现稀有变异[创新技巧]

    尽管新一代DNA测序为疾病相关突变的检测和个性化药物的开发带来了巨大希望,但稀有变异的检测能力仍然受到限制,样品制备、测序和分析过程都有可能引入错误。尽管错误率仅有1%,但对于癌症研究人员来说还是没办法接受,这让人难以检测通常在疾病中扮演重要角色的稀有变异。为此,科学家们正在设法鉴定这些错误,并提高测序的准确性。 [2013/3/22]

  • GS Junior HLA分型获得欧洲认可[创新技巧]

    罗氏454测序在HLA分型方面的应用由来已久。最近,奥地利一实验室对临床样本通过GS Junior测序实现了高分辨率分型,该平台已经于去年底通过欧洲认证,将在纳入奥地利的医疗保险体系,用于病人移植前配型。 [2013/3/14]

  • 华大科技推出全新杂合基因组解决方案—Ultra-Deep De novo[新品推荐]

    2013年3月4日,深圳华大基因科技服务有限公司推出杂合基因组解决方案—Ultra-Deep De novo,可以帮助科研人员更加高效地解决杂合基因组组装难题。 [2013/3/11]

  • 利用454技术进行结核杆菌全基因组测序有效追踪疫情传播[创新技巧]

    众所周知,肺结核多数是由结核分枝杆菌感染肺部引起的肺部感染性疾病,已成为一个严重威胁人类健康的疾病。近期,据《PLoS Medicine》杂志报道,有研究者们利用454技术对86例人结核分枝杆菌进行了全基因组测序,并与传统分型技术结果进行了比较。 [2013/2/28]

  • Nabsys定位测序仪首次亮相AGBT

    AGBT 2013,目前规模最大的测序技术会议,于2013年2月20日-23日在美国佛罗里达州马可岛举行。Nabsys,一家DNA技术的创业型公司,在会议上展出了其固态基因测序仪。据介绍,这款仪器将会在今年下半年上市,价格大约在50,000美元。 [2013/2/27]

  • 转录组研究:从芯片到RNA-Seq

    新一代测序技术在爆炸式发展的同时,也衍生出许多其他技术创新。RNA深度测序(RNA-Seq)就是其中之一,这项技术使我们对细胞发育及其调控机制的理解,达到了前所未有的深度和广度。尽管研究细胞RNA并不是什么新鲜事,但RNA-Seq的出现大大拓展了转录组研究的规模,取得了累累硕果,这些是传统技术难以企及的。 [2013/2/26]

  • QIAGEN透露测序仪的更多细节

    AGBT 2013,目前规模最大的测序技术会议,于2013年2月20日-23日在美国佛罗里达州马可岛举行。QIAGEN公司在这次会议上向客户介绍了其新一代测序(NGS)的流程,旨在将这一突破性的技术常规应用在生命科学研究之外的领域,如临床研究和诊断。 [2013/2/26]

  • Illumina:85%的台式测序数据来自MiSeq

    AGBT 2013,目前规模最大的测序技术会议,于2013年2月20日-23日在美国佛罗里达州马可岛举行。纵观2013 AGBT的日程,基本都是关于“临床”、“癌症”、“基因组”、“测序”、“分析”。无疑,测序技术的应用是这届会议的亮点。不过,各大公司也有一些新技术与大家分享。 [2013/2/22]

  • 利用454测序技术进行HIV耐药检测可提高灵敏度[创新技巧]

    由于HIV繁殖存在错误率高的逆转录这一独特的复制过程,因此在药物治疗中也最易出现耐药性。当前,HIV耐药株已成为医学界面临的一个新挑战。利用454深度测序技术可以达到传统检测方法无法检测的灵敏度,除了可以进行定量检测耐药位点突变情况外,还可检测低至1%的突变情况,从而为HIV治疗提供了更加准确的信息。 [2013/2/19]

  • 2013新一代测序仪将走向何方

    尽管今年的摩根大通保健大会没有出现去年的新品频发的盛况,但新一代测序仪仍在不断进步。读长、准确性、通量、软件,无一不在变化,让测序更高、更快、更强。各大公司推出或即将推出哪些新产品?请看本文。 [2013/2/6]

  • NEB NGS文库制备产品之使用体会[心得点评]

    New England BioLabs(NEB)公司推出了30多款样品制备方面的产品(NEBNext系列),适合Illumina、454、Ion Torrent等多个平台。NEBNext DNA Sample Prep Master Mix Set for Illumina 是一款文库制备产品,适用于后续的定向富集或在Illumina的HiSeq或MiSeq平台上直接测序。这款试剂盒的效果如何?且看本文。 [2013/2/1]

  • Illumina宣布测序技术大创新

    Illumina公司近日宣布了一系列产品和技术上的创新,从样品制备到系统改进再到数据分析,这有望带来基因组研究上的新突破。随着平台的不断改进,测序速度、准确性、产量和流程都有望改善。 [2013/1/17]

  • 酸性矿山废水中微生物分布影响因素

    国内科学家对中国东南部14个地区的59个AMD样本进行了微生物群落分布的研究。通过对AMD样本中的微生物16SrRNA基因进行454测序,对测序结果进行了物种分布和聚类的分析,最终发现,影响微生物群落的主要因素并不是地域,而是环境的变化,如铁离子、硫酸根离子、有机物含量等等,相关学术论文发表在《自然》子刊ISME(International Society for Microbial Ecology)上。 [2013/1/17]

  • 454测序参与棉花基因组进化研究工作

    近日,来自8个国家的70多名科学家共同参与的国际合作项目----棉花基因组测序完成。该研究的学术文章《棉花基因组的多倍化及纤维的发育》发表在《自然》杂志上。研究中,科学家们结合传统的Sanger测序与新一代454测序技术对雷蒙德氏棉基因组进行了组装工作,获得了其87.7%的全基因组序列。 [2013/1/16]

  • PacBio助力100K基因组计划 从头解密10万种食源性致病菌

    Pacific Biosciences公司宣布加州大学Davis分校的研究人员将使用PacBio RS测序仪来进行100K基因组计划,该计划是去年由加州大学Davis分校、安捷伦公司和FDA共同发起的,旨在测序100,000种食源性致病菌的基因组。 [2013/1/15]

  • PacBio RS第三代单分子测序系统全球访谈纪要(三)[心得点评]

    生物通就几个广受关注的主题征询收集了众多声名赫赫的PacBio用户的心得意见,以用户现身说法的方式,“原汁原味”为您呈上这一第三代单分子测序系统全球访谈纪要系列报道。实现对碱基修饰进行直接测序的意义所在?本文介绍了碱基修饰直接测序法的经典案例,以及一些先行者的看法,包括NEB公司CSO Richard Roberts。 [2013/1/14]

  • PacBio RS第三代单分子测序系统全球访谈纪要(二)[心得点评]

    第三代单分子测序技术还值得继续关注吗?当然!PacBio最新升级的商品化试剂使得用户平均测序读长达到了前所未有的5000bp!PacBio单分子实时测序到底怎么样?生物通就几个广受关注的主题征询收集了众多声名赫赫的PacBio用户的心得意见,以用户现身说法的方式,“原汁原味”为您呈上这一第三代单分子测序系统全球访谈纪要系列报道。 [2012/12/28]


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