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  • 关于ccfDNA的提取,你想知道的都在这里 [心得点评]

    自2015年以来,液体活检就在医疗诊断领域掀起了一阵新风暴。这是一种非侵入性的方法,有望替代目前的侵入性方法,在早期实现疾病的诊断和监控。如今,液体活检已经应用在无创产前诊断(NIPT)、癌症的诊断和治疗等多个方面。在这些检测中,两大主角分别是循环游离DNA(ccfDNA)和循环肿瘤细胞(CTC)。 [2016-12-1]

  • 赛默飞世尔再推癌症检测产品,分析肿瘤微环境的免疫反应

    赛默飞世尔科技公司近日宣布,适用于癌症研究的靶向检测产品线又增添四款新产品,包括Oncomine Immune Response Research Assay,它能够拷问肿瘤微环境,并鉴定免疫治疗临床试验中的预测性标志物。这一系列产品适用于Ion Torrent NGS平台,与FFPE样品兼容。 [2016-11-18]

  • 测序愈发常见,而疾病不再罕见

    罕见,有时是好事,比如奇异的珍宝、名贵的字画;有时又是坏事,比如罕见的疾病。尽管许多疾病在现阶段都得到了很好的治疗,但对研究人员来说,罕见病似乎仍是无法逾越的高山。好在,基因组时代已经来临。在这一期的《Clinical OMICs》上,Jeffrey Buguliskis博士介绍了测序技术对罕见病诊断的影响。 [2016-11-11]

  • QIAGEN推出液体活检的一体化试剂盒[新品推荐]

    液体活检的市场日渐红火,各大公司都推出了相关的产品。上周,在美国人类遗传学学会(ASHG)的年会上,QIAGEN公司推出了一个液体活检分析的专用解决方案 – QIAseq® cfDNA All-in-One Kit。 [2016-10-27]

  • 肿瘤精准医学,NGS领头羊的新征程[2016 CSCO年会]

    自2015年初美国总统奥巴马在国情咨文中提出精准医学以来,这个名词就成为了生命科学和医学领域最热门的话题之一。遗传信息的检测与解读是整个精准医学的核心,而新一代基因测序(NGS)是破译遗传信息最为重要的手段。在这样的背景下,2016 CSCO年会期间召开的Illumina卫星会异常火爆,开场前二十分钟会场门外就大排长龙。 [2016-9-30]

  • 扫盲贴:如何评估NGS文库的质量?[心得点评]

    NGS文库制备的目标是在DNA或cDNA片段上连接厂家特异的接头,让它们能够在NGS平台上测序。这个概念似乎非常简单,不过实现这个目标可比你想象的要复杂得多,而只有严格的质量控制才能确保最佳的结果。近日,QIAGEN的产品专家Verena Schramm就介绍了这一过程。 [2016-9-29]

  • PacBio发布新款测序仪的数据集

    Pacific Biosciences公司周二发布了拟南芥(Arabidopsis thaliana)的数据集和de novo基因组组装结果,这是首次在新款测序仪Sequel系统上完成,利用了两个SMRT Cell,运行时间为12小时。 [2016-9-29]

  • 探索神秘的微生物群落

    微生物虽然看不见,但却是无处不在的。人体的肠道和皮肤、地球的海洋和土壤,甚至植物的叶片和种子,都有它们的身影。在大多数情况下,这些微生物群落是由许多不同的物种组成的。研究人员试图鉴定这些微生物群落的组成,但相当有难度。Sarah Webb在这一期的《BioTechniques》上介绍了目前的进展。 [2016-9-1]

  • Fluidigm推出强大的自动化文库制备系统[新品推荐]

    Fluidigm近日宣布推出Juno™ 靶向DNA测序文库制备系统。这是一个具有扩展性的文库制备方案,适合中等至高通量的新一代测序(NGS)。它将Fluidigm的Juno微流体自动化平台与多重扩增相结合,让实验室能够更快速、更经济地测序更多样品。 [2016-8-23]

  • QIAGEN推出‘数字NGS’新产品[新品推荐]

    QIAGEN公司近日宣布推出一套新颖的新一代测序集合产品。这些QIAseq NGS panel是基于专有的数字NGS技术,对DNA、RNA和miRNA实现无偏向的准确定量。 [2016-8-5]

  • 人机大战:NGS文库构建和序列捕获大比拼

    在NGS过程中,构建基因文库是整个测序进程中第一个步骤,也是最为关键步骤,基因文库的质量直接影响后续的测序工作。虽然二代测序技术发展迅速,但是基因文库的构建仍然是一项十分耗费时间以及重复性高的工作。 [2016-8-2]

  • 单分子测序揭示植物的复杂转录组[创新技巧]

    高粱是一种重要的经济作物,也有望作为生物燃料。近日,美国科罗拉多州立大学和国家基因组资源中心的研究人员对高粱的转录组进行了深入分析。研究小组鉴定出新的基因,以及比预期更多的选择性剪接。这项成果发表在《Nature Communications》上。 [2016-7-14]

  • 你的实验室领取自己的云平台了吗[新品推荐]

    新一代测序自从大红大紫以来,数据分析一直是其痛点。几十到一百多bp的短读长想要拼接出几十G的基因组序列,需要极强的运算能力和数据储存能力。这催生了科研领域的云计算平台。高大上的云计算曾经是王谢堂前燕,但它已经做好准备飞入寻常百姓家。赶快注册属于您实验室的云,让云计算平台助您解决瓶颈打开桎梏,在大数据的新世界里展翅高飞! [2016-7-8]

  • 循环游离DNA也能直接建库了[新品推荐]

    如今,人们通常利用新一代测序(NGS)技术对cfDNA进行高通量分析,看看哪些基因有突变,并根据突变信息来确定下一步的诊疗方案。从理论上说,这是一种简单易懂的方法,不过,血清或血浆中的cfDNA浓度极低,这为测序文库的制备带来了挑战。 [2016-6-28]

  • 对付新发传染病,当然要有新式武器

    尽管寨卡病毒早在1947年就已经被科学家发现,但它真正开始蔓延,就是在最近几年。对于这些新发传染病,科学家和临床医生希望能获得疾病的许多细节,而基因测序也许能揭示它的作用机制,并指导疗法的开发。简言之,科学家对疾病了解得越多,他们就越有可能知道应该如何治疗。 [2016-6-24]

  • Fluidigm推出单细胞TCR测序产品[新品推荐]

    为了在单细胞水平实现深度的T细胞分析,Fluidigm近日在C1™系统上推出了一个全新的免疫学应用 – Single-Cell TCR Sequencing。这个应用可揭开每个细胞的T细胞受体(TCR)α和β链,同时发现相应的基因表达特征,为研究人员拷问T细胞的功能反应提供了一种新方法。 [2016-6-13]

  • 全基因组测序策略大比拼[心得点评]

    随着NGS技术的进步和成本的下降,人们主张通过全面测序来鉴定肿瘤的突变图谱,这激发了全外显子组和全基因组测序的应用。Clinical OMICs近期发表的一篇文章就比较了全基因组测序的策略。 [2016-6-3]

  • 测序污染有多危险,如何防范与去除[实验手册]

    毫无疑问,在实验过程中越早剔除污染物越好,“这些污染会增加实验直接的成本,”来自爱丁堡大学的Dominik Laetsch 说,出现污染,“每分钱理论上你得到的核苷酸信息就越少,”因为需要花时间处理和分析不需要的序列。但也有个好消息——即使序列中充满了 PhiX、引物、载体和不想要物种的基因,还是能在别人看到你最终公布的基因组之前剔除它们。 [2016-6-2]

  • iPhone供电的纳米孔测序仪有望上市

    Oxford Nanopore的用户组会议于上周四在伦敦召开。媒体并没有被邀请,不过一些用户和博主已经在Twitter上透露了最新消息。Oxford Nanopore正在开发一款智能手机供电的纳米孔测序仪以及一款低成本的文库制备系统。 [2016-6-1]

  • DNA证据不可靠?有人躺着也中枪

    通过犯罪现场的一根头发,或一个血斑,警察也许就能够锁定犯罪嫌疑人。DNA证据的使用让许多不法分子落入了法网。然而,《科学美国人》杂志报道,过度依赖这些证据也是有风险的。 [2016-5-25]


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