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  • 单分子测序揭示植物的复杂转录组[创新技巧]

    高粱是一种重要的经济作物,也有望作为生物燃料。近日,美国科罗拉多州立大学和国家基因组资源中心的研究人员对高粱的转录组进行了深入分析。研究小组鉴定出新的基因,以及比预期更多的选择性剪接。这项成果发表在《Nature Communications》上。 [2016-7-14]

  • 你的实验室领取自己的云平台了吗[新品推荐]

    新一代测序自从大红大紫以来,数据分析一直是其痛点。几十到一百多bp的短读长想要拼接出几十G的基因组序列,需要极强的运算能力和数据储存能力。这催生了科研领域的云计算平台。高大上的云计算曾经是王谢堂前燕,但它已经做好准备飞入寻常百姓家。赶快注册属于您实验室的云,让云计算平台助您解决瓶颈打开桎梏,在大数据的新世界里展翅高飞! [2016-7-8]

  • 循环游离DNA也能直接建库了[新品推荐]

    如今,人们通常利用新一代测序(NGS)技术对cfDNA进行高通量分析,看看哪些基因有突变,并根据突变信息来确定下一步的诊疗方案。从理论上说,这是一种简单易懂的方法,不过,血清或血浆中的cfDNA浓度极低,这为测序文库的制备带来了挑战。 [2016-6-28]

  • 对付新发传染病,当然要有新式武器

    尽管寨卡病毒早在1947年就已经被科学家发现,但它真正开始蔓延,就是在最近几年。对于这些新发传染病,科学家和临床医生希望能获得疾病的许多细节,而基因测序也许能揭示它的作用机制,并指导疗法的开发。简言之,科学家对疾病了解得越多,他们就越有可能知道应该如何治疗。 [2016-6-24]

  • Fluidigm推出单细胞TCR测序产品[新品推荐]

    为了在单细胞水平实现深度的T细胞分析,Fluidigm近日在C1™系统上推出了一个全新的免疫学应用 – Single-Cell TCR Sequencing。这个应用可揭开每个细胞的T细胞受体(TCR)α和β链,同时发现相应的基因表达特征,为研究人员拷问T细胞的功能反应提供了一种新方法。 [2016-6-13]

  • 全基因组测序策略大比拼[心得点评]

    随着NGS技术的进步和成本的下降,人们主张通过全面测序来鉴定肿瘤的突变图谱,这激发了全外显子组和全基因组测序的应用。Clinical OMICs近期发表的一篇文章就比较了全基因组测序的策略。 [2016-6-3]

  • 测序污染有多危险,如何防范与去除[实验手册]

    毫无疑问,在实验过程中越早剔除污染物越好,“这些污染会增加实验直接的成本,”来自爱丁堡大学的Dominik Laetsch 说,出现污染,“每分钱理论上你得到的核苷酸信息就越少,”因为需要花时间处理和分析不需要的序列。但也有个好消息——即使序列中充满了 PhiX、引物、载体和不想要物种的基因,还是能在别人看到你最终公布的基因组之前剔除它们。 [2016-6-2]

  • iPhone供电的纳米孔测序仪有望上市

    Oxford Nanopore的用户组会议于上周四在伦敦召开。媒体并没有被邀请,不过一些用户和博主已经在Twitter上透露了最新消息。Oxford Nanopore正在开发一款智能手机供电的纳米孔测序仪以及一款低成本的文库制备系统。 [2016-6-1]

  • DNA证据不可靠?有人躺着也中枪

    通过犯罪现场的一根头发,或一个血斑,警察也许就能够锁定犯罪嫌疑人。DNA证据的使用让许多不法分子落入了法网。然而,《科学美国人》杂志报道,过度依赖这些证据也是有风险的。 [2016-5-25]

  • QIAGEN推出快速建库新工具[新品推荐]

    近年来,新一代测序(NGS)技术蓬勃发展,也实现了许多激动人心的应用。然而,尽管NGS技术在不断改进,但文库制备仍然是整个流程中最大的瓶颈之一。它有许多值得吐槽的地方,比如步骤多,耗时长,样品有可能损失,也有可能引入操作误差。 [2016-5-25]

  • 10X Genomics发布升级版测序平台[新品推荐]

    备受关注的测序公司10X Genomics近日宣布正式推出升级版测序平台Chromium系统。此系统是基于原先的10X GemCode技术,但包含了一系列完整的流程方案,可实现多个应用。 [2016-5-24]

  • 新一代测序在癌症中的临床应用

    如今,新一代测序主要应用在癌症预防和治疗中的哪些方面?美国罕见病基因组研究所的研究人员不久前在《Frontiers in Genetics》杂志上进行了详细介绍。在这篇文章中,他们回顾了新一代测序近期的科研和临床应用,同时,他们强调了100%基因组测序的重要性,也就是测序高度重复的非编码序列。 [2016-5-17]

  • 单细胞研究指南:RNA-seq方法比较

    多细胞生物的每个细胞都携带着相同的遗传学信息。不过,近年来蓬勃发展的单细胞研究告诉我们,每一个细胞都是独一无二的。The Scientist杂志最近联系了单细胞研究领域的一些专家,请他们分享了在单细胞中进行转录研究的秘诀。希望帮助研究者们更好地构建文库,处理和分析结果数据。 [2016-5-17]

  • 单细胞研究指南:测序方法大比拼

    多细胞生物的每个细胞都携带着相同的遗传学信息。不过,近年来蓬勃发展的单细胞研究告诉我们,每一个细胞都是独一无二的。The Scientist杂志最近联系了单细胞研究领域的一些专家,请他们分享了在单细胞中进行转录研究的秘诀。希望帮助研究者们更好地构建文库,处理和分析结果数据。 [2016-5-13]

  • 单细胞研究指南:细胞分离

    多细胞生物的每个细胞都携带着相同的遗传学信息。不过,近年来蓬勃发展的单细胞研究告诉我们,每一个细胞都是独一无二的。The Scientist杂志最近联系了单细胞研究领域的一些专家,请他们分享了在单细胞中进行转录研究的秘诀。希望帮助研究者们更好地构建文库,处理和分析结果数据。 [2016-5-12]

  • Clontech为免疫组库测序推出新品[新品推荐]

    目前,NGS技术已经越来越多地应用于人类T细胞受体(TCR)多样性的研究。不过,在利用传统方法生成TCR测序文库时,往往只包含TCR可变区的一部分,而且需要用到复杂的多重PCR策略。为此,Clontech(Takara旗下)近日推出了一个新的解决方案。 [2016-5-6]

  • 让基因组测序绕过PCR扩增[创新技巧]

    在基因组测序中,PCR扩增似乎是绕不过去的一步。然而,PCR也带来一些问题,包括不均匀扩增,导致某些序列的比例过高。对目前的新一代测序(NGS)平台而言,测序某些碱基组成上存在严重偏向的基因组区域仍是一大挑战。在GEN杂志上,Patricia Fitzpatrick Dimond博士介绍了PCR-Free的基因组测序。 [2016-5-5]

  • QIAGEN推出液体活检新产品[新品推荐]

    为了促进液体活检研究的数据分析,QIAGEN公司近日推出了RNA-seq Explorer Solution。这是一种新的工具,整合了Ingenuity® Pathway Analysis™、Biomedical Genomics Workbench®及其他QIAGEN生物信息学方案,有助于改善癌症的检测、诊断和治疗。 [2016-4-19]

  • 微生物组研究手册(信息学工具)

    微生物几乎是无所不在的,它们对生态环境和人体健康起到了不容忽视的作用。然而人们对微生物的了解还相当匮乏,因为许多微生物是无法在实验室中培养的。工欲善其事,必先利其器。我们在这里介绍一些最新的微生物组研究工具和相关技术,包括基因组和转录组的纯化、生物信息学工具、质谱分析、微生物组操纵方法等等。 [2016-4-13]

  • 联川50个肿瘤热点基因Panel上市!

    联川生物推出了VariantPro™ Cancer HotSpots Panel是按100%扩增覆盖50个肿瘤基因的热点区域设计,实现了高性价比,最少人工操作(只需5分钟),超高分辨率地分析和揭示50个肿瘤基因热点区域所有临床相关的突变。 [2016-4-12]


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