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  • 赛默飞世尔重磅推出两款测序仪[新品推荐]

    开学伊始,赛默飞世尔就发布重磅消息,即将推出两款新一代测序(NGS)系统。这也是赛默飞世尔收购Life Technologies以来,首次扩展测序产品线。新的Ion S5和Ion S5 XL将组成Ion Torrent的中端产品线,其价格和通量介于Ion PGM和Ion Proton之间。 [2015-9-3]

  • 专家经验谈:如何减轻你的测序负担

    芯片是目前临床上检测CNV的主要工具,但芯片检测在有些方面也是力不从心。举例来说,芯片只能帮助我们判断是否存在序列重复(或缺失),要获得更加全面的信息只能求助于二代测序(NGS)。NGS可以达到更高的分辨率,还能同时检出倒置、易位等其他结构异常,甚至为人们提供SNP和indel的信息。 [2015-8-26]

  • 新一代测序在临床诊断中的应用[创新技巧]

    利用新一代测序(NGS)来做出诊断,在如今的诊疗机构中越来越普遍。由Illumina、赛默飞世尔和Pacific Biosciences的测序仪所推动,临床实验室正在生产大量的DNA序列数据。因此,研究人员和临床遗传学家发现将医学谜题转化成临床行动比以往更容易。 [2015-8-4]

  • 癌症检测新热点:基因集合检测

    美国临床化学协会(AACC)年会于本周在亚特兰大召开。Howe及其他演讲者在研讨会上表示,基于新一代测序的基因集合利用单个检测来研究多个基因,周转时间较快,且费用与其他分析相当。对于癌症检测,基因集合通常包含50-500个基因。 [2015-7-31]

  • RNA样本制备过程中实现NGS测序reads的初净化

    NGS,说起来简单,做起来难,说起来全是泪呀,最难的当属后期的数据分析。数百万个零碎片段,排好序,拼凑完,才能拿到数据库里进行比对和功能分析。殊不知,有时候比对出来的却不是你想要的转录组数据,而是核糖体rRNA的序列信息,这时候,你的心情如何? [2015-7-29]

  • NimbleGen SeqCap RNA序列富集系统, 让您的RNA测序事半功倍!

    现在开始,携手罗氏,您的 RNA 测序将进入新的时代!罗氏 NimbleGen 序列捕获家族的新成员 SeqCap RNA 系列产品,通过对目标 RNA 区域的靶向富集能够显著降低 RNA-seq 对于测序量的要求并极大增加低表达转录本的覆盖度, 大大降低您进行基因表达相关研究的成本。 [2015-7-27]

  • Genome Biology:RNA-seq需要多长的读长?

    随着新一代测序(NGS)的读长在不断增长,研究人员也开始纠结:到底多长的读长才合适?双端测序是不是优于单端测序?近日,康奈尔大学维尔医学院的研究人员在《Genome Biology》杂志上发表文章,认为对于差异表达分析而言,读长并非越长越好。不过,双端测序和长的读长无疑能改善剪接的检测。 [2015-7-22]

  • 别样精彩:新一代测序的新应用盘点

    不仅仅是1,000美元基因组的新闻和对医疗保健的改善,基因组学正迅速成为我们日常生活中的一部分。每种生物体的DNA都可以被研究,而它的应用也同样广泛,人们找到更好的方式来制造啤酒和奶酪。 [2015-7-22]

  • 测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台[新品推荐]

    10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,引起业界关注。GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,产生长片段信息(10-100 kb),实现结构变异和单体型等分析。 [2015-7-3]

  • 多篇文章介绍掌上测序仪的新兴应用[创新技巧]

    Oxford Nanopore的MinION掌上测序仪近来有点火。这边厢,公司正忙着升级仪器,发布新产品;那边厢,用户也在不断发表研究成果,从全长cDNA测序到快速的病原体测序。 [2015-6-19]

  • 【新技术】只需一步就能制备靶向测序文库,你信吗?

    VariantPro™ Capture Technology是基于多重PCR的新一代靶向测序文库制备技术,克服了长期困扰着基于PCR技术的靶向文库制备中的许多限制,如糟糕的序列均一性,丢失的靶标序列,繁复的实验流程,冗长的人工操作时间,以及高昂的前期设备投入。 [2015-6-11]

  • 从芯片到RNA-seq的转型之路

    自二十世纪九十年代中期以来,芯片就一直是基因组表达分析的中坚力量。不过随着测序成本的直线下降,RNA测序(RNA-seq)成为了越来越受欢迎的转录组分析方法。The Scientist杂志与多位专家共同探讨了从芯片到RNA-seq的过渡,希望帮助研究者们顺利度过这段艰难的转型期,最终实现华丽转身。 [2015-6-10]

  • 华大基因超级测序仪上市 挑战Illumina HiSeq系列

    作为全球最大的基因组研究机构,华大基因(BGI)也迎来了自己的测序仪。上周末,在欧洲人类遗传学会议上,华大基因展出了首款DNA测序仪。这款名为Revolocity™的超级测序仪,是基于华大基因子公司Complete Genomics开发的技术。 [2015-6-10]

  • 【新技能】“接力PCR”,仅一步完成靶标捕获和文库扩增

    Relay-PCR™技术的革命性创新在于,可以控制特异性引物(OmegaPrimer™)只在最初靶标捕获的两个循环中发挥作用,之后会自动切换到由通用引物引导的以相同效率进行的文库扩增,获得均一性非常高的文库(已有的实验数据表明,均一性超过97%)。 [2015-6-8]

  • 强强联手,有望将测序读长延伸至100 kb

    Pacific Biosciences这两年一直在努力证明自己的与众不同,它的RS II测序仪能从头组装人类基因组,而不使用现有的参考基因组作为模板。这个过程被称为从头组装(de novo assembly),比定位到参考基因组更加困难,也更加昂贵,不过它也带来了复杂变异的重要信息。 [2015-6-4]

  • 【新技能】Omega引物提升特异性超过26,000倍,你想到了吗?

    由于形似Ω,我们称它为OmegaPrimer。Omega primer是由3个功能区段组成:3p臂( 3p arm)是聚合酶延伸反应的启动子;5p臂(5p arm)是结合DNA模板序列的锚;分隔两臂的环(loop)。这么“怪”的引物有什么与众不同吗?因为这样的设计从根本上优于传统的引物,不信,你往下看…… [2015-6-4]

  • 瓶中基因组计划与测序参考材料

    如今,测序人员有了一个重要的新工具来了解他们的仪器和检测表现如何,那就是美国国家标准与技术研究所(NIST)指定为“参考材料”的DNA样本。这个DNA样本最初由一位犹他州的妇女在1980年捐献,被认为是世界上研究最透彻的二倍体人类基因组。 [2015-5-25]

  • 沉迷大数据,NGS挑战重重[心得点评]

    在这个时代,各行各业都对大数据痴迷,基因组学也不例外。也许,这源于一种与生俱来的需求,我们渴望了解遗传组成如何控制人类生活的方方面面。近日,Jeffrey S. Buguliskis博士在GEN网站上讨论了大数据带来的挑战。 [2015-5-22]

  • 靶向测序:表达谱分析的新选择

    靶向测序让研究人员能够最大限度利用他们的测序运行,将精力集中在那些感兴趣的序列上。例如,Moreno正在测试一种109个基因的集合,其中包括他之前鉴定出的24个基因。为了获得那些数据,Moreno利用Cellular Research的Precise Molecular Indexing分析,来捕获样本中的目标序列。 [2015-5-22]

  • Oxford Nanopore这次又发布了什么?

    近日,Oxford Nanopore公司在伦敦举行了London Calling用户会议,发布了一些新产品。其中,最受期待的还是首席技术官Clive Brown的报告。当然,他也没让大家失望。与会者称这次发布会是“改变游戏规则的”,形容当时的气氛就像2007年苹果发布iPhone一样。这会不会有些夸张?让我们来看这次会议的一些亮点。 [2015-5-18]


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