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  • 华大基因发布基因组数据分析云计算平台BGI Online

    2015年4月20日,全球最大的基因组学研发机构华大基因在全球发布一款强大且具高安全性的基因组数据分析云计算平台服务产品 -- BGI Online。BGI Online为新一代测序项目的管理提供一站式解决方案,让用户可以轻松创建和运行复杂的数据分析流程。 [2015-4-21]

  • 追赶微生物组的热潮,你准备好了吗?(下)[创新技巧]

    有了新型的测序仪,人们开始着手研究健康的人体中生活着哪些类型的微生物。当然,同样是健康的人,你和我的微生物群落就大不相同,就算同一个人,不同部位的微生物也大相径庭。这种差异性使得人们难以描述“正常的”微生物组。于是,研究人员从数百名个体中采样,提取信息。他们关注各个部位,包括口腔、皮肤、鼻腔、肠道,以及泌尿生殖道。 [2015-4-3]

  • 追赶微生物组的热潮,你准备好了吗?(上)[创新技巧]

    有了新型的测序仪,人们开始着手研究健康的人体中生活着哪些类型的微生物。当然,同样是健康的人,你和我的微生物群落就大不相同,就算同一个人,不同部位的微生物也大相径庭。这种差异性使得人们难以描述“正常的”微生物组。于是,研究人员从数百名个体中采样,提取信息。他们关注各个部位,包括口腔、皮肤、鼻腔、肠道,以及泌尿生殖道。 [2015-4-2]

  • 赛默飞发布Ion Torrent技术更新和新产品预览

    赛默飞世尔科技于上周在佛洛里达州马可岛举办的基因组生物学技术进展年会(AGBT)上发布了Ion Torrent测序技术的最新进展情况,充分展示赛默飞在研发新一代测序业务上的努力和成果,从而进一步表明其致力于将新技术应用于临床研究的决心。 [2015-3-19]

  • 三篇文章介绍RNA-Seq数据分析的新工具[新品推荐]

    新年伊始,RNA-Seq的数据分析方法就如雨后春笋般涌现。在最近的一个月内,三篇介绍RNA-Seq数据分析新方法的文章发表在Nature集团旗下的刊物上,其中一篇发表在《Nature Methods》上,另外两篇都发表在《Nature Biotechnology》上。 [2015-3-17]

  • Illumina推出HLA分型的新模式[创新技巧]

    人类白细胞抗原(HLA)区域为各种疾病和状况提供了重要的见解。不幸的是,由于此区域的高度多态性,HLA分型存在不小的挑战。近日,Illumina公司宣布推出TruSight HLA,这个方案通过测序11个HLA基因而全面查看HLA区域,带来准确的HLA分型。 [2015-3-16]

  • 新一代测序2015更新:小鲜肉与大叔(下)

    小鲜肉常有,而大叔不常有。经过岁月的洗礼,大叔褪去了小鲜肉的稚嫩与青涩,愈发成熟,更显魅力。Illumina、Pacific Biosystems便是这样的帅大叔。他们上市多年,在市场上占据一定的地位,应用也日趋广泛。 [2015-3-11]

  • 新一代测序2015更新:小鲜肉与大叔(上)

    从2005年454公司首推新一代测序仪以来,转眼已是十年光阴。在这十年间,许多新平台问世,有的昙花一现,有的则从小鲜肉变成了帅大叔。当然,这是一个小鲜肉辈出的时代。新的平台仍在不断上市,带来进步,带来希望。 [2015-3-10]

  • 现在有机会试用纳米孔测序仪

    英国Oxford Nanopore Technologies公司近日宣布,它重新开放了MinION测序仪的早期试用计划,希望吸纳更多用户来参与。同时,越来越多的计划参与者开始展示和发表他们的结果。 [2015-3-4]

  • 让NGS的文库制备一步到位[新品推荐]

    在第16届基因组生物学技术进展大会(AGBT)召开前夕,Illumina公司宣布推出NeoPrep文库制备系统。这是一款数字微流体平台,能够大大简化新一代测序(NGS)的文库制备,带来测序即用的高质量文库。 [2015-3-3]

  • 单细胞转录组学的研究工具盘点[新品推荐]

    近几年,研究人员已经开发出一些工具,能够将几个组学学科的规模降至单细胞水平,包括转录组学。一些方法是基于新一代DNA测序,另一些则依靠显微镜或流式细胞仪。不过,这些方法都发现,细胞群体看似均一,其实是高度异质性的。 [2015-2-17]

  • 有一个地方,测序始终难以覆盖[创新技巧]

    也许你并不知道,人类基因组并没有测序完全。一些重复区域和难测序的序列始终犹抱琵琶半遮面。同时,遗传变异也是个挑战。在新一期的《BioTechniques》杂志中,Nathan Blow介绍了一些新的技术和方法,能帮助人们绘制这些难以读取的DNA片段。 [2015-2-16]

  • 来一次说做就做的测序

    虽然高通量新一代测序总体成本大幅下降,但想在二代测序平台上做出好的研究成果也并不便宜,尤其是在样本量大的时候。另外,如何解读海量测序数据的生物学意义也是一个很大的问题。可以说,基因组测序还远远没到想做就做的地步。 [2015-2-12]

  • Illumina推出四款新的测序系统[新品推荐]

    一年一度的摩根大通保健大会(JP Morgan Healthcare Conference)于1月12日在旧金山开幕。Illumina的CEO Jay Flatley昨日登上演讲台,宣布推出四款新的测序系统。这四款新平台分别是HiSeq X Five系统,HiSeq 3000和HiSeq 4000系统,以及NextSeq 550系统。 [2015-1-14]

  • 赛默飞推出三项针对遗传研究的创新技术

    近日,科学服务领域的世界领导者赛默飞(以下简称:赛默飞)推出了三项针对遗传研究的创新技术:用于加强Ion PGM系统中单核苷酸多态性 (SNP) 和插入缺失 (Indel) 检测性能的新型酶,用于基因遗传性耳聋研究的引物组,以及对靶向捕获引物设计热门网站AmpliSeq Designer的升级。 [2015-1-14]

  • 癌症研究概览13:技术因素

    幸运的是,Illumina的测序技术可无前提假设、高分辨率地分析基因组。良好的实验设计可进一步优化技术能力并产生更多可解释的可靠数据。这一部分将着重强调生物学研究的独特之处以及研究人员在设计实验时需要注意的事项。 [2014-12-31]

  • 癌症研究概览12:表观遗传学

    表观遗传学指基因表达的可遗传改变,而这一变化又并未伴随DNA序列的改变。遗传上相同的同卵双胞胎所表现出的微妙差异大多是由表观遗传差异造成的,越来越多的证据也表明异常的表观遗传学变化促成了疾病(如癌症)的发生。表观遗传变化是通过多个过程介导控制的,主要包括DNA甲基化、组蛋白修饰和核小体重塑。 [2014-12-30]

  • 癌症研究概览11:microRNA(miRNA)

    容易测定、相对稳定、对mRNA具有调控作用,这些特点让miRNA有潜力成为许多疾病包括癌症的标志物,但任何新发现的候选miRNA想要成为合格的生物标志物,还有很长的路要走。迄今为止的研究仍处于生物标志物发现的极早期阶段,下面的文章介绍了这一快速发展领域的技术和进展。 [2014-12-29]

  • 如何通过RNA-Seq了解转录本的结构[创新技巧]

    测序转录组的方法可不止一种。一些研究人员的目标是计数转录本,评估表达水平,则测序可代替DNA芯片。而另一些研究人员感兴趣的是转录本的结构。大家都知道,真核生物的基因常常经过选择性剪接。是否包含特定的外显子,这有着深远的生物学影响。 [2014-12-26]

  • 癌症研究概览10:基因组改变和拷贝数变异(CNV)

    新一代测序技术为以单碱基分辨率快速确定大量样本中的畸变提供了一套工具。大的样品组让我们能确定基因组改变的频率,并深入了解驱动疾病发展的关键基因和过程。使用这些技术的早期文章让我们初步感受到未来可预见的海量信息。最让人吃惊的现象是每个癌症是那么独特。 [2014-12-26]


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