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  • NimbleGen SeqCap RNA序列富集系统, 让您的RNA测序事半功倍!

    现在开始,携手罗氏,您的 RNA 测序将进入新的时代!罗氏 NimbleGen 序列捕获家族的新成员 SeqCap RNA 系列产品,通过对目标 RNA 区域的靶向富集能够显著降低 RNA-seq 对于测序量的要求并极大增加低表达转录本的覆盖度, 大大降低您进行基因表达相关研究的成本。 [2015/7/27]

  • Genome Biology:RNA-seq需要多长的读长?

    随着新一代测序(NGS)的读长在不断增长,研究人员也开始纠结:到底多长的读长才合适?双端测序是不是优于单端测序?近日,康奈尔大学维尔医学院的研究人员在《Genome Biology》杂志上发表文章,认为对于差异表达分析而言,读长并非越长越好。不过,双端测序和长的读长无疑能改善剪接的检测。 [2015/7/22]

  • 别样精彩:新一代测序的新应用盘点

    不仅仅是1,000美元基因组的新闻和对医疗保健的改善,基因组学正迅速成为我们日常生活中的一部分。每种生物体的DNA都可以被研究,而它的应用也同样广泛,人们找到更好的方式来制造啤酒和奶酪。 [2015/7/22]

  • 测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台[新品推荐]

    10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,引起业界关注。GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,产生长片段信息(10-100 kb),实现结构变异和单体型等分析。 [2015/7/3]

  • 多篇文章介绍掌上测序仪的新兴应用[创新技巧]

    Oxford Nanopore的MinION掌上测序仪近来有点火。这边厢,公司正忙着升级仪器,发布新产品;那边厢,用户也在不断发表研究成果,从全长cDNA测序到快速的病原体测序。 [2015/6/19]

  • 【新技术】只需一步就能制备靶向测序文库,你信吗?

    VariantPro™ Capture Technology是基于多重PCR的新一代靶向测序文库制备技术,克服了长期困扰着基于PCR技术的靶向文库制备中的许多限制,如糟糕的序列均一性,丢失的靶标序列,繁复的实验流程,冗长的人工操作时间,以及高昂的前期设备投入。 [2015/6/11]

  • 从芯片到RNA-seq的转型之路

    自二十世纪九十年代中期以来,芯片就一直是基因组表达分析的中坚力量。不过随着测序成本的直线下降,RNA测序(RNA-seq)成为了越来越受欢迎的转录组分析方法。The Scientist杂志与多位专家共同探讨了从芯片到RNA-seq的过渡,希望帮助研究者们顺利度过这段艰难的转型期,最终实现华丽转身。 [2015/6/10]

  • 华大基因超级测序仪上市 挑战Illumina HiSeq系列

    作为全球最大的基因组研究机构,华大基因(BGI)也迎来了自己的测序仪。上周末,在欧洲人类遗传学会议上,华大基因展出了首款DNA测序仪。这款名为Revolocity™的超级测序仪,是基于华大基因子公司Complete Genomics开发的技术。 [2015/6/10]

  • 【新技能】“接力PCR”,仅一步完成靶标捕获和文库扩增

    Relay-PCR™技术的革命性创新在于,可以控制特异性引物(OmegaPrimer™)只在最初靶标捕获的两个循环中发挥作用,之后会自动切换到由通用引物引导的以相同效率进行的文库扩增,获得均一性非常高的文库(已有的实验数据表明,均一性超过97%)。 [2015/6/8]

  • 强强联手,有望将测序读长延伸至100 kb

    Pacific Biosciences这两年一直在努力证明自己的与众不同,它的RS II测序仪能从头组装人类基因组,而不使用现有的参考基因组作为模板。这个过程被称为从头组装(de novo assembly),比定位到参考基因组更加困难,也更加昂贵,不过它也带来了复杂变异的重要信息。 [2015/6/4]

  • 【新技能】Omega引物提升特异性超过26,000倍,你想到了吗?

    由于形似Ω,我们称它为OmegaPrimer。Omega primer是由3个功能区段组成:3p臂( 3p arm)是聚合酶延伸反应的启动子;5p臂(5p arm)是结合DNA模板序列的锚;分隔两臂的环(loop)。这么“怪”的引物有什么与众不同吗?因为这样的设计从根本上优于传统的引物,不信,你往下看…… [2015/6/4]

  • 瓶中基因组计划与测序参考材料

    如今,测序人员有了一个重要的新工具来了解他们的仪器和检测表现如何,那就是美国国家标准与技术研究所(NIST)指定为“参考材料”的DNA样本。这个DNA样本最初由一位犹他州的妇女在1980年捐献,被认为是世界上研究最透彻的二倍体人类基因组。 [2015/5/25]

  • 沉迷大数据,NGS挑战重重[心得点评]

    在这个时代,各行各业都对大数据痴迷,基因组学也不例外。也许,这源于一种与生俱来的需求,我们渴望了解遗传组成如何控制人类生活的方方面面。近日,Jeffrey S. Buguliskis博士在GEN网站上讨论了大数据带来的挑战。 [2015/5/22]

  • 靶向测序:表达谱分析的新选择

    靶向测序让研究人员能够最大限度利用他们的测序运行,将精力集中在那些感兴趣的序列上。例如,Moreno正在测试一种109个基因的集合,其中包括他之前鉴定出的24个基因。为了获得那些数据,Moreno利用Cellular Research的Precise Molecular Indexing分析,来捕获样本中的目标序列。 [2015/5/22]

  • Oxford Nanopore这次又发布了什么?

    近日,Oxford Nanopore公司在伦敦举行了London Calling用户会议,发布了一些新产品。其中,最受期待的还是首席技术官Clive Brown的报告。当然,他也没让大家失望。与会者称这次发布会是“改变游戏规则的”,形容当时的气氛就像2007年苹果发布iPhone一样。这会不会有些夸张?让我们来看这次会议的一些亮点。 [2015/5/18]

  • 遗传病家系的高通量测序:您需要了解的一些事

    高通量测序技术的出现与普及,为遗传病的研究带来了前所未有的机会。它提高了遗传病致病基因克隆和鉴定的效率,使人类对自身基因功能的认识大大加速。本文对遗传病家系的高通量测序分析提出一些注意事项,希望有助于相关的研究。 [2015/5/6]

  • 癌症研究中的数据挖掘工具[选购宝典]

    对于癌症研究人员而言,采集数据仅仅是个开始;找到引起或促进疾病的基因才是“压力山大”。关键的挑战在于找出特定的突变,它们引发正常细胞癌变。此时此刻,大多数的癌症驱动突变都隐藏在遗传信息的海洋之中。如何大海捞针?这些新的计算和生物信息学工具也许能帮助你。 [2015/4/30]

  • 如何理解PacBio的准确度?

    第三代测序中的PacBio单分子实时(Single Molecule Real-Time, SMRT)DNA测序可以实现超过99.999%(QV50)的高度精确测序,且不受DNA序列中GC和AT含量的影响,平均读长可达10-15kb(最长>40kb),这是如何实现的呢?这是因为SMRT技术在与DNA测序精确度相关的三个方面均有独到之处…… [2015/4/29]

  • 华大基因发布基因组数据分析云计算平台BGI Online

    2015年4月20日,全球最大的基因组学研发机构华大基因在全球发布一款强大且具高安全性的基因组数据分析云计算平台服务产品 -- BGI Online。BGI Online为新一代测序项目的管理提供一站式解决方案,让用户可以轻松创建和运行复杂的数据分析流程。 [2015/4/21]

  • 追赶微生物组的热潮,你准备好了吗?(下)[创新技巧]

    有了新型的测序仪,人们开始着手研究健康的人体中生活着哪些类型的微生物。当然,同样是健康的人,你和我的微生物群落就大不相同,就算同一个人,不同部位的微生物也大相径庭。这种差异性使得人们难以描述“正常的”微生物组。于是,研究人员从数百名个体中采样,提取信息。他们关注各个部位,包括口腔、皮肤、鼻腔、肠道,以及泌尿生殖道。 [2015/4/3]


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