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  • 测序超级细菌 希望与困难同在

    全基因组测序有望阻止,至少是扼制,传染病在医院的爆发,但它目前仍不是标准程序。Lauren Ware在BioTechniques上深入探讨了测序疾病爆发的好处和障碍。 [2014-8-28]

  • 走向云端的高通量测序——数据分析与瓶颈

    尽管你可能对它还不熟悉,但云计算可以很好的为中小型实验室服务,为他们解决高通量测序的数据分析难题。为此,Nathan Blow博士在Biotechniques上撰文对这一技术进行了详细的介绍。 [2014-8-11]

  • 走向云端的高通量测序

    尽管你可能对它还不熟悉,但云计算可以很好的为中小型实验室服务,为他们解决高通量测序的数据分析难题。为此,Nathan Blow博士在Biotechniques上撰文对这一技术进行了详细的介绍。 [2014-8-8]

  • MiSeqDx系统获科学家精选大奖

    SelectScience近日宣布,2013年度科学家精选之最佳临床实验室新产品大奖(Scientists’ Choice Award for Best New Clinical Laboratory Product)的得主是Illumina的MiSeqDx系统。这一奖项在最近召开的AACC大会上颁给了Illumina的市场情报主管Tony Salerno。 [2014-8-7]

  • 自动化NGS文库制备的4点建议[心得点评]

    随着测序费用的下降,新一代测序(NGS)文库制备的费用已占了实验室测序经费的很大一部分。如今,在许多实验中,文库制备的费用几乎与测序相当。同时,制备文库也要花费相当多的精力。若是将这一过程自动化,不仅能够减少样品之间的可变性,而且能让此过程自动运行,无需人工干预。 [2014-7-28]

  • QIAGEN新推14种基因靶向富集产品[新品推荐]

    QIAGEN的新一代测序(NGS)产品家族又添新成员了。近日,QIAGEN公司宣布推出14种新的GeneRead™ DNAseq V2 gene panels,靶定广泛的癌症相关基因或区域。这些产品被用在测序运行之前,以富集感兴趣的基因。它们也可以定制,包括临床相关的其他基因或区域,并与任何NGS测序仪兼容。 [2014-7-22]

  • 新一代测序新面临的六大挑战

    当年,Solexa品牌还在的时候,MassGenomics的Dan Koboldt就提出了新一代测序(NGS)面临的一些挑战,包括生物信息学算法的问题,以及读长太短,工具太贵,经验太少。如今,这些问题中的大部分都已解决。不过,别高兴得太早。Koboldt认为,我们面临更新、更难的挑战。 [2014-7-15]

  • 福利贴 Illumina测序方法汇总[创新技巧]

    在高通量测序中,Illumina的测序仪一直是重要的工具。然而,人们渐渐发现,标准的操作步骤已不能满足他们的特定需求。于是,研究人员不断开发出新的NGS样品制备方法,以解决新的挑战。为此,Illumina编辑了一份小册子,收录了近年来发表的各种Illumina测序应用。 [2014-6-26]

  • QIAGEN推出3款NGS样品制备新产品[新品推荐]

    自QIAGEN宣布要推出新一代测序仪以来,大家都在翘首盼望这台新仪器的上市。年初,QIAGEN表示将在今年推出GeneReader测序仪,不过,5月份他们又改口了,说要延迟到2015年推出。唉,我们等到花儿也谢了。但是,GeneReader虽没来,NGS样品制备方面的新产品却在不断上市。 [2014-6-23]

  • 如何确定新突变是否是体细胞突变[创新技巧]

    在研究DNA样品中的突变时,确定新的序列变化到底是体细胞突变,还是生殖细胞系的多态性,这似乎是件挺困难的事。最近,西班牙纳瓦拉大学(University of Navarra)的研究人员介绍了一种非常简单的方法,可在没有配对组织样品时鉴定DNA样品中的体细胞突变。 [2014-6-16]

  • 利用NimbleGen序列捕获技术实现定向RNA-Seq[创新技巧]

    最近在Nature Protocols杂志上在线发表的一篇文章介绍了利用NimbleGen序列捕获技术进行转录组定向测序,用于RNA研究中基因发现和表达定量。 [2014-6-5]

  • 对付无法培养的微生物 宏基因组学研究策略[创新技巧]

    与大肠杆菌不同,绝大多数微生物不能在琼脂板或液体培养基中培养,这使得科学家无法研究它们的生物学、生物化学以及对生态、健康和疾病的贡献。Schloss和Handelsman将无法培养微生物的问题比喻成希腊神话中的戈尔迪之结,并提出了两个基本的解决方案。一是要弄清楚如何培养这些无法培养的东西。二是用利剑斩断这个结,这种策略被称为宏基因组学。 [2014-5-29]

  • 强大的NGS分析软件CLC Genomics Workbench[新品推荐]

    随着新一代测序(NGS)技术的发展,测序仪的通量不断提高,使得测序成本持续下降。这当然是大家喜闻乐见的。然而,海量数据的产生,也为数据分析带来了不小的挑战。好在强大的NGS分析软件不断出现,能帮助研究人员应对这一挑战。今天,我们就给大家介绍一款深受欢迎的软件CLC Genomics Workbench。 [2014-5-28]

  • Illumina推出HiSeq v4试剂,产量高达1 Tb[新品推荐]

    生物通报道 Illumina公司近日发布了新的HiSeq v4试剂,能够比现有的v3试剂带来更高的产量,同时显著减少运行时间。有了v4试剂,HiSeq 2500每次运行能产生40亿个reads和1 Tb的数据总输出量。这种新的能力让研究人员以无与伦比的规模开展基因组、外显子组和转录组分析。 [2014-5-21]

  • NGS数据分析的捷径:云计算[新品推荐]

    测序完成了?这真是个好消息。不过别高兴地太早,更艰巨的工作在等着你呢。数据分析,也不是一项轻松的任务。对于这个问题,传统的解决方案是将存储和计算分析的工作交给计算机集群,但这是许多研究人员无法企及的。如今,越来越多的研究人员选择了另一条道路。他们利用Dropbox和Gmail的服务,将他们的工作移至云端。 [2014-4-22]

  • Illumina发布癌症研究的新产品[新品推荐]

    Illumina继年初推出NextSeq 500和HiSeq X Ten测序系统之后,日前再次推出新产品,能从与癌症相关的血液和组织中发现基因组变异。这些新产品将充分利用该公司的新一代测序和芯片扫描系统,为基础和临床癌症研究带来完整的解决方案。 [2014-4-15]

  • 如何研究复杂遗传病的机制[创新技巧]

    在分析遗传机制时,人们不仅仅要覆盖单个或多个基因,还需要构建完整的突变谱,从更大的视角去了解疾病。这不但有利于基础研究,也有利于未来的疗法开发。那么,具体策略如何呢?Oxford Gene Technology(OGT)公司近日发布了基因组分析的白皮书,介绍了临床遗传学研究的策略。 [2014-4-11]

  • NGS文库制备新品实现5-hmC分析[新品推荐]

    近年来,新一代测序(NGS)平台在甲基化研究中开始崭露头角。它们带来了非常灵敏的DNA甲基化图谱,以单分子分辨率覆盖整个CpG岛。然而,对于时下热门的5-hmC研究,似乎还缺乏专门的样品制备工具。为此,Zymo Research公司近日推出两款新的NGS文库制备试剂盒,适用于全基因组范围的5-hmC和5-mC分析。 [2014-4-10]

  • PacBio升级分析软件 实现两项新应用[新品推荐]

    Pacific Biosciences公司近日宣布了其单分子实时(SMRT)DNA测序平台的软件升级。SMRT Analysis 2.2提供了增强的功能,支持两项新的应用:Iso-Seq™全长转录本/异构体测序以及人类白细胞抗原(HLA)单体型定相。 [2014-4-8]

  • 访谈后记——PacBio完成大型基因组测序项目例证(下篇)

    自《全球访谈纪要:PacBio RS第三代单分子测序系统》专题发布以来,不断有读者来电来函参与讨论,其中讨论较多的一条是,PacBio技术是否只在微生物领域才能发挥得淋漓尽致,换句话说,是否应用到大型基因组测序项目中就大打折扣。本期笔者将通过几个大型基因组测序项目的案例分析形式,以自己粗浅的知识和检索概括,就该问题展开白话式的剖析。 [2014-4-4]


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