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  • 快速可逆地编辑表观基因组的新方法

    斯坦福大学医学院的Gerald Crabtree领导的研究团队开发出一种新技术,能够将内源性的染色质复合物招募至任意的基因组位点,从而快速并可逆地编辑哺乳动物细胞系中的表观基因组。这项成果发表在《Nature Communications》上。 [2017/10/11]

  • RNA甲基化修饰(m6A)研究技术及方案设计

    m6A是一种动态可逆的修饰方式,在转录后调控中发挥作用,其在调控基因表达、剪接、RNA 编辑、RNA 稳定性、控制mRNA寿命和降解、介导环状RNA翻译[1]等方面扮演重要角色,具有重要的研究意义。 [2017/6/29]

  • 肿瘤相关超级增强子的研究方案及应用前景

    超级增强子是具有转录活性增强子的一个大簇, 富集高密度的关键转录因子(Master transcription factors)、辅因子(Cofactor)和增强子表观修饰标记(Histone modification marks)。 开展肿瘤相关超级增强子的研究,将有助深入解开肿瘤发病机制,并且可用于指导抗肿瘤药物的高效研发,具有重要的社会意义和经济价值。 [2017/6/28]

  • 表观遗传学在临床:监控吸烟喝酒,深入了解肥胖[创新技巧]

    表观遗传学研究的是不涉及DNA序列改变的基因表达和调控的可遗传变化。它通过在染色体上添加化学标签,来实现基因的开启或关闭。如今,表观遗传学不仅限于科学研究,也开始在临床应用中崭露头角。 [2017/2/20]

  • DNA甲基化分析:重亚硫酸盐转化之华山论剑[新品推荐]

    如果你不想把时间浪费在漫长的摸索中,商业化试剂盒的确是理想的选择。这些试剂盒经过专业团队的精心打磨,在性上都有一定的保证。那么,几种重亚硫酸盐转化试剂盒在实战中的表现谁更强呢?为了选出后继实验采用的试剂盒,塞浦路斯一个研究团队开展了一场华山论剑式的试剂盒比较。 [2016/8/2]

  • 辞旧迎新,ChIP都有哪些新玩法

    染色质免疫共沉淀ChIP的基础理念多年来并没有太大的改变,但开发者们一直在不断进行着优化。在辞旧迎新之际,让我们看看ChIP领域都有哪些值得期待的新东西。 [2015/12/31]

  • 无需参考的甲基化分析新方法[创新技巧]

    分析DNA甲基化的高通量方法大多依赖参考基因组,而许多物种不一定有。最近,奥地利的研究人员就开发出一种方法,在没有参考基因组的情况下分析DNA甲基化。这项成果于本周发表在《Cell Reports》上。 [2015/12/11]

  • 专家经验谈:如何进行DNA甲基化分析

    重亚硫酸盐测序本质上就是重亚硫酸盐转化与二代测序(NGS)的结合。这一技术是在全基因组范围内分析DNA甲基化的基础工具,也是是甲基化研究中最受欢迎的技术,哈佛医学院的张毅(Yi Zhang)教授说。 [2015/4/23]

  • 探索染色质动力学的新工具

    染色质动力学研究基本上是通过基因组规模的染色质免疫沉淀(ChIP-Seq)或DNA甲基化分析(亚硫酸氢盐测序),在一段时间内收集表观基因组的数据集。理论上虽然很简单,但这些研究仍然是浩大的工程。 [2015/3/24]

  • 单细胞表观遗传学研究指南(下)

    The Scientist最近撰文详细介绍了单细胞表观遗传学研究中的一些关键技术。这些技术可以帮助我们在单个细胞中检测DNA、组蛋白和染色质水平上的表观遗传学修饰。 [2015/2/10]

  • 单细胞表观遗传学研究指南(上)

    The Scientist最近撰文详细介绍了单细胞表观遗传学研究中的一些关键技术。这些技术可以帮助我们在单个细胞中检测DNA、组蛋白和染色质水平上的表观遗传学修饰。 [2015/2/9]

  • 5羟甲基化研究背景及与疾病的关系

    5hmC被称为哺乳动物DNA中的“第六碱基”。早在上世纪70年代,Penn等人首次发现在哺乳动物DNA中存在5-羟甲基化胞嘧啶(5hmC)。然而该发现并未得到反复证实,因而5hmC也没有受到应有的重视。直到2009年,Kriaucionis 和Tahiliani两位科学家证实小鼠的Purkinje细胞,颗粒神经元以及胚胎干细胞存在5hmC。5hmC可影响长期和短期的基因表达调控,因此在体内可能具有重要的生物学意义。 [2014/10/14]

  • 全基因组DNA甲基化研究的理想工具[新品推荐]

    为了在各个应用中实现经济高效的DNA甲基化分析,Illumina提供了一个可靠的甲基化分析平台,包括成熟的试剂以及iScan和HiScan® SQ系统。HumanMethylation450 BeadChip芯片以低成本带来了专家选择的全面覆盖和高通量的独特组合,让它成为筛查大的样本群体的理想选择,如全基因组关联研究(GWAS)队列。 [2014/9/24]

  • 多种工具带你深入DNA甲基化

    研究者们通过检测基因组的表观遗传学状态,鉴定了大量值得深入研究的甲基化区域。应该如何进一步研究或验证这些区域呢?对大量样本进行全基因组扫描显然是不现实的,这样做的成本太高。实际上,也没有必要为了部分区域去检测整个基因组DNA,本文介绍的工具就足以完成这样的任务。 [2014/9/19]

  • 如何高效地捕获甲基化的DNA[新品推荐]

    对于基因组水平的DNA甲基化研究,研究人员有很多选择,比如芯片或新一代测序,但是它们都有限制。表观遗传学研究人员需要的是一种能够选择性富集甲基化区域的工具,它必须全面,没有偏向性。罗氏NimbleGen的SeqCap Epi甲基化富集系统就是这样一种工具。 [2014/5/21]

  • 细胞遗传学家的新工具和新希望

    细胞遗传学意在确定一个基因组中与众不同的结构特征。这说起来容易,做起来难。多年来,研究人员手头的工具很有限,只有吉姆萨染色、FISH和DNA芯片。新兴的DNA测序技术将细胞遗传学的分辨率提高到前所未有的水平,缩小了分子细胞遗传学和分子遗传学之间的距离。 [2014/3/27]

  • 成功ChIP的三大秘诀

    在基因调控领域,可以说没有比表观遗传学更热的话题了。而染色质免疫沉淀ChIP是表观遗传学研究中最常用的技术。 [2014/2/24]

  • 罗氏甲基化捕获试剂创新甲基化研究方法

    最近在Nature Medicine上的一篇综述总结了近来表观遗传检测技术方面的进展,一些新的技术可能使得这些类检测价格降低、也更加高效,通过这些技术有可能使得研究者更好的了解疾病的机制、进行相关药物的研发。 [2014/2/11]

  • 新技术同时分析核小体定位和DNA甲基化[新品推荐]

    传统的方法能够独立确定核小体定位或DNA甲基化。然而,这些方法不能提供两者之间关系的信息。为此,Active Motif公司推出NOMe-Seq技术,首次实现同一DNA分子上多个表观遗传修饰之间关系的研究。 [2013/12/31]

  • 甲基化检测新方法—近红外荧光成像[创新技巧]

    DNA甲基化是表观遗传学的重要研究内容之一。当前研究方法有很多种,多是依赖于重亚硫酸盐处理。南京东南大学的客户发现一种快速简便的基于NC膜的近红外荧光检测方法研究启动子CpG岛的DNA甲基化。在NC膜上设计捕获探针用于检测DNA甲基化以及由其引起的基因转录水平上的表达变化。 [2013/12/3]


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