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  • 鉴别DNA甲基化,总有一款工具适合你

    一谈到真核遗传,众所周知基因组仅仅是个起点,目前表观基因组的研究正是炙手可热。自2009年以来,表观遗传学修饰已使遗传字母表扩充到了八个成员A、C、G、T、5-mC、5-hmC、5-fC和5-caC。除了标准甲基化形式5-mC,其他甲基化类型也逐渐成为研究热点。这几种甲基化修饰就像亲兄弟,要准确分辨它们可并不容易,本文就为您初步总结了几种甲基化识别方法和工具。 [2012/8/27]

  • 第七种碱基5fC在基因组中的分布[创新技巧]

    来自英国剑桥大学的研究人员绘制了第一张小鼠胚胎干细胞中5-甲酰基胞嘧啶(5fC)的基因组分布图,并评估了5fC在分化中的可能作用。该研究成果于8月17日发表在《Genome Biology》上。 [2012/8/22]

  • 30分钟 超快速的亚硫酸氢盐转化[新品推荐]

    EpiTect Fast Bisulfite Conversion Kit能够在30分钟内非常高效地将未甲基化的胞嘧啶转化成尿嘧啶,且转化率超过99%。而创新的DNA保护技术能确保高效的DNA变性,但不会降解,获得高的DNA产量和重复的结果。 [2012/8/2]

  • 快速可靠的甲基化分析,无需亚硫酸氢盐转化[新品推荐]

    最近,QIAGEN推出了一款新产品EpiTect Methyl II PCR Array System,无需亚硫酸氢盐转化,即可快速准确地检测单个基因或一组基因的DNA甲基化状态。EpiTect Methyl II PCR Array System采用创新的MethylScreen技术,实现了单个基因以及疾病和通路聚焦的一组基因中CpG岛DNA甲基化的快速准确检测。 [2012/7/23]

  • 关联研究组蛋白修饰和甲基化的新技术[创新技巧]

    DNA甲基化、染色质修饰和DNA序列之间的复杂关系似乎很难用现有的技术来阐明。于是,两个独立的研究小组将亚硫酸氢盐测序与染色质免疫沉淀(ChIP)结合起来,直接拷问遗传学和表观遗传学过程。这两项研究成果均发表于《Genome Research》6月刊上。 [2012/6/11]

  • 5-hmC的研究工具盘点[选购宝典]

    2011年至今,5-hmC已有多篇文章发表,怎一个火字了得!相信在未来几年又会引发一个新的研究热潮。若要了解5-hmC的功能,研究人员首先需要定位并追踪这种修饰,以便了解它如何随着细胞的改变而改变。除了5-hmC的抗体,文献报道了哪些研究方法?而各大公司又推出了哪些产品呢? [2012/5/14]

  • 染色质分析工具及其应用(三)[创新技巧]

    过去,Dey使用免疫沉淀来解决这些问题。就目前这项研究以及今后的研究而言,EpiQ试剂盒不能取代免疫沉淀技术,而是作为补充。它给出信息,说明在哪些条件下需要用染色质免疫沉淀来进一步分析。 [2012/3/12]

  • 染色质分析工具及其应用(二)[创新技巧]

    “这个试剂盒的主要应用不太在于发现什么,而是为了解基因是否表达提供了一个捷径。一旦你了解了这个,你就能设计实验,来更详细地了解为什么是这样,”这位意大利教授如是说。 [2012/3/8]

  • 染色质分析工具及其应用(一)[新品推荐]

    目前定量确定染色质结构状态的方法较为复杂,且耗时长。它需要从细胞中分离出细胞核,并进行染色质消化,通常需要两天以上才能完成。有了EpiQ试剂盒,无需分离细胞核,6小时即可获得染色质结构的数据。此外,该试剂盒只需要较少量的细胞(低至50,000个)就能开展分析。 [2012/3/7]

  • 焦磷酸测序在甲基化分析中的应用[创新技巧]

    焦磷酸测序技术(Pyrosequencing)作为一种新的序列分析技术,能够快速地检测甲基化的频率,对样品中的甲基化位点进行定性及定量检测,为甲基化研究提供了新的途径。对于已确定的目标区域的甲基化定量分析,传统的焦磷酸测序不啻为最佳方法。 [2011/8/17]

  • 5-羟甲基胞嘧啶(5-hmC)的研究工具[新品推荐]

    一些人将5-mC称为第五种碱基,那么5-hmC就是第六种碱基。这种碱基的确切功能仍在研究中,但普遍认为它参与了DNA去甲基化或基因表达调控。之前,一直缺乏一种技术来准确灵敏地检测5-hmC,如今,多家公司推出了相关的检测工具。 [2011/6/22]

  • 在基因组范围定位DNA甲基化[创新技巧]

    DNA甲基化在哺乳动物基因表达中扮演了重要角色。尽管通过线粒体遗传且随时间稳定,但是细胞分化、疾病或环境影响都会改变DNA甲基化的模式。近年来,科学家们开发出多种新方法,试图在基因组范围定位DNA甲基化。 [2011/6/21]

  • 五花八门的DNA甲基化检测(下)[创新技巧]

    近年来涌现出不少DNA甲基化的检测技术,少说也有十几种。大致可以分为两类:特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析,后者也称为甲基化图谱分析(methylation profiling)。下面生物通给大家介绍一些常用的方法。 [2011/6/20]

  • 五花八门的DNA甲基化检测(上)[创新技巧]

    近年来涌现出不少DNA甲基化的检测技术,少说也有十几种。大致可以分为两类:特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析,后者也称为甲基化图谱分析(methylation profiling)。下面生物通给大家介绍一些常用的方法。 [2011/6/17]

  • DNA甲基化检测的序曲——亚硫酸氢盐转化[选购宝典]

    在检测DNA甲基化的众多方法中,研究人员常常会使用到一项技术,那就是亚硫酸氢盐转化。尽管在理论上很简单,但亚硫酸氢盐处理真正要做起来却不那么容易。目前市场上有多个厂家提供亚硫酸氢盐转化试剂盒,生物通这就给您介绍一下各个产品,以及选购中的注意事项。 [2011/6/16]

  • 甲基化DNA的富集 小磁珠立大功[选购宝典]

    在具体介绍甲基化检测的技术之前,我们先来插一段甲基化DNA的富集。许多研究人员都会在亚硫酸氢盐转化之前富集甲基化的DNA。一来可降低背景,二来也可节约成本。目前有两种基本方法,一个是利用5’-甲基胞嘧啶的抗体来捕获甲基化DNA,即甲基-DNA免疫沉淀(MeDIP);另一个是利用包含了甲基-CpG结合结构域(MBD)的蛋白来得到同样的结果。 [2011/6/13]

  • Sigma推出第二代ChIP试剂盒[新品推荐]

    在表观遗传学方面,Sigma-Aldrich公司拥有丰富的产品线,包括Imprint DNA修饰试剂盒、Imprint ChIP试剂盒、Imprint 甲基化DNA检测试剂盒以及DNA纯化、定量PCR、测序和反应纯化等产品。近日,Sigma又推出了第二代的染色质免疫沉淀试剂盒——Imprint Ultra ChIP试剂盒,提升了检测的灵敏度,能为新一代测序带来最佳结果。 [2011/5/13]

  • 飞一般的DNA甲基化检测[新品推荐]

    默克密理博公司近日推出一款极速重亚硫酸盐处理试剂盒(CpGenome™ Turbo Bisulfite Modification Kit),让你体验极为快速的重亚硫酸盐转化。此款试剂盒不仅能提高实验速度,还能保证检测的灵敏度和转化效果。 [2011/4/27]

  • 甲基化芯片在白血病研究中的应用[创新技巧]

    上海血液学研究所所长陈赛娟院士实验室最近通过对急性单核细胞白血病样本的筛查,发现DNMT3A(DNA甲基化相关基因)存在高频突变现象。进一步研究发现DNMT3A突变会降低其编码的酶活性,并且通过DNA甲基化芯片技术(MeDIP-chip)和表达谱芯片技术证实了DNMT3A突变对DNA甲基化模式和基因表达具有重要影响,为研究DNMT3A在M5亚型急性单核细胞白血病中的功能机制提供了线索。 [2011/4/8]

  • 高分辨率熔点分析技术进行冻存组织样本甲基化的检测[创新技巧]

    启动子高度甲基化是恶性肿瘤基因转录中的一种很常见的现象,被视为细胞恶性转化的标志之一。DNA 甲基化分析是一种基因检测工具,用于早期癌症检测、风险评估与治疗疗效评估,具有非常诱人的前景。当前研究的目的,是对结直肠癌个体冻存 FFPE 组织上启动子甲基化检测 HRM 分析进行评价及确证。 [2011/1/21]


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