课程安排：
| 课程内容 |
授课时间 |
费用 |
1、 Linux操作基础 |
3.5h |
4000 |
1.1 Linux操作系统的目录结构 |
1.2 Linux操作系统常用命令 |
1.3 Vi编辑器的使用 |
2、Perl 语言在生物信息学的基本应用 |
4.5h |
2.1 Perl的基本元素 |
2.2 Perl的生物信息应用示例 （ DNA复制、DNA转录、RNA翻译、遗传漂变等的模拟、GC含量统计 、读写序列文件 ） |
2.3 生物信息模块 |
解析常用数据库文件格式 |
程序从web下载文件 |
序列反转和翻译 |
获取motif上下游序列 |
统计分子量和密码子 |
转换blast格式 |
3、全局比对&局部比对 |
4h |
BLAST、MEGA、CLUSTAL、MUSCLE等常用软件使用，结果及常
见疑难问题解析； |
4、基因组注释和基因注释 |
12h |
4.1 串联重复序列及转座因子的注释 |
4.2 基因结构预测 |
4.3 基因功能预测 |
4.4 非编码RNA的预测 |
4.5 基因调控元件的注释 |
4.6 常用数据库、常用数据格式介绍与运用 |
5、生物信息绘图 |
8h |
5.1 R语言的绘图功能及应用案例 |
R的对象与属性、基本符号、数据结构、程序设计、数据的读取与存储 |
5.2 基础绘图工具 |
绘图函数及绘图参数介绍；画图面板分割及图形保存； |
图形案例分析
（散点图、条形图、文氏图、饼图、盒形图、频率直方图及热图的绘制） |
【注】：深圳华大基因学院保留对以上课程信息（包括主题、课程安排和其他细节等）进行调整的权利，具体课程信息以实际上课为准。
【讲师团队】
我们的讲师来自工作一线，项目经验丰富，多次参与重大项目和论文撰写，有开发生物信息学软件的宝贵实战经验，对生物信息学有全面了解和深刻认识。每个专题主讲一人，助教两名，同时指导项目讨论及辅导实践上机。
李建文：华大基因研究院生物信息部核心技术开发部门负责人；主要研究方向为基因组分析 基因注释 分子进化； 有着丰富的生物信息实战经验，负责了黄瓜、大熊猫、白菜、小麦、鸭子、企鹅等基因组注释及进化的研究工作，已在nature系列杂志上发表文章四篇。华大基因学院特聘专职讲师，培训经验丰富，责任心强，讲解细致，举一反三。
- Huang, S. .. Li, J. .. et al. The genome of the cucumber, Cucumis sativus L. Nature genetics 41, 1275-1281, doi:10.1038/ng.475 (2009).
- Zheng, Y. .. Li, J. .. et al. Sequencing, annotation and comparative analysis of nine BACs of giant panda (Ailuropoda melanoleuca). Science China. Life sciences 53, 107-111, doi:10.1007/s11427-010-0001-z (2010).
- Li, R. .. Li, J. .. et al. The sequence and de novo assembly of the giant panda genome. Nature 463, 311-317, doi:10.1038/nature08696 (2010).
- Wang, X... Li, J. .. et al. The genome of the mesopolyploid crop species Brassica rapa. Nature genetics 43, 1035-1039, doi:10.1038/ng.919 (2011).
- Yan, G... Li, J. .. et al. Genome sequencing and comparison of two nonhuman primate animal models, the cynomolgus and Chinese rhesus macaques. Nature biotechnology 29, 1019-1023, doi:10.1038/nbt.1992 (2011).
汪亮：华大基因研究院生物云计算产品设计-产品经理；主要研究方向为第二代测序数据分析处理，小RNA注释，预测和差异分析；全基因组重测序数据的基因组变异检测；华大基因学院专职讲师，培训经验丰富，思路清晰，责任心强，英语流利。
参与项目
1. 参与BGI的生物云计算平台Easy Genomics的研发，产品荣获《Bio-IT World》杂志第八届最佳实践奖。
2、参与ACRG项目完成100对肝癌样本的疾病基因组学研究。发现与肝癌相关的通路以及基因。?
3、有多年miRNA分析工作经验，参与过包括已发表的蚂蚁基因组项目（Science期刊），以及RNA-edting项目中的miRNA分析(Nature Biotechnology期刊)
【课程对象】
·从事生命科学、农学、医学等领域的高校学生
·迫切希望提升生物信息分析能力的学者
【收费标准】
·注册费：4000 元/人，学生（持学生证）3600 元/人。含学费、资料费、上机费、其他材料费；
·培训期间可免费提供工作餐，可协助安排住宿，住宿费用自理。
·特别说明：本次课程限定名额30 名，为确保培训资源得到最佳利用，请尽快申请报名参加。
【优惠政策】
·华大基因长期合作伙伴可用积分兑换抵减注册费。
【联系方式】 
·联系电话：0755-25273851 培训中心（咨询时间：周一至周五9:00-18:00）
·E-mail：training@service.genomics.cn |
