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在这里,您将:
• 了解转录组学最新进展,主流前沿研究思路;
• 掌握转录组常用分析软件的使用方法和分析要点;
• 解决转录组项目设计和执行过程中遇到的实际问题,加快成果转化;
• 掌握用R语言进行常规数据处理、统计分析的方法;
• 技术学到手,能运用R绘图工具实现图形的绘制。
2016年12月19-23日,我们与您不见不散! |
【课程安排】
| 模块 |
收费 |
时间 |
课程 |
时长 |
形式 |
选修一 |
3600元/人 |
2016/12/19
(星期一) |
1. RNA-seq进展及热点介绍 |
1h |
理论 |
2. denovo和定量分析介绍 |
6h |
理论 +实操 |
2.1 denovo组装 |
2.2 unigene注释 |
2.3 表达定量分析 |
2.4 差异表达基因筛选 |
2.5 显著性富集分析 |
2.6 案例解析 |
3. 上机实践 |
3.1 Blast2GO、WEGO介绍 |
3.2 显著性富集分析(DAVID、KO2BAS) |
3.3 聚类分析(Cluster、treeview、Genesis) |
3.4 GSEA介绍 |
2016/12/20
(星期二) |
4. 全转录组分析介绍 |
7h |
理论 +实操 |
4.1 基本数据处理 |
4.2 数据比对和统计分析 |
4.3 点突变检测:SNP、SNV分析 |
4.4 点突变检测:RNA编辑 |
4.5 结构变异检测:可变剪切 |
4.6 结构变异检测:基因融合 |
4.7 lncRNA分析介绍 |
4.8 案例解析 |
5 上机实践 |
5.1 IGV可视化介绍 |
5.2 时间序列分析 |
2016/12/21
(星期三) |
6. 非编码RNA分析介绍 |
7h |
理论 +实操 |
6.1 小RNA分类注释 |
6.2 预测新的miRNA |
6.3 靶基因预测 |
6.4 靶基因功能富集 |
6.5 互作调控分析(miRNA和mRNA、IncRNA) |
7. 上机实践 |
7.1 靶基因预测(psRNATarget、micro-T) |
7.2 可视化工具介绍(RNAstructure、Cytoscape) |
7.3 案例解析 |
选修二 |
3600元/人 |
2016/12/22
(星期四) |
1. R语言简介、功能及基本语法介绍 |
4h |
理论 |
1.1 R及RStudio软件的安装、运行及使用 |
1.2 R语法介绍(R基本符号,数据结构,程序设计) |
1.3 上机实操 |
2. 数据处理功能及统计应用 |
4h |
理论+实操 |
2.1 数据的读取与存储 |
2.2 字符及字符串操作 |
2.3 数据处理 |
2.4 统计分析 |
2016/12/23
(星期五) |
3. R语言的绘图功能及应用案例
3.1 基础绘图工具(绘图函数、参数、画图面板分割及图形的保存)
3.2 图形案例实际制作 (散点图、条形图、文氏图 、
饼图、热图等) |
7h |
理论+实操 |
赠送线上课程(巩固学习) |
R语言绘图在线学习课程 |
一年有效观看时间 |
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【注】:深圳市华大基因学院保留对以上课程信息(包括主题、课程安排和其他细节)进行调整的权利,具体课程信息以实际上课为准。
【讲师团队】
• 我们的讲师均项目经验及实战经验丰富,多次参与重大项目和论文撰写,有开发生物信息学软件的宝贵实战经验,对生物信息学有全面了解和深刻认识。每个专题主讲师一人,老师配备助教,同时指导项目讨论及辅导实践上机。
【培训对象】
• 从事生命科学、农学、医学等领域科研工作者和高校教师及研究生;
• 迫切希望提升转录组生物信息分析能力、R绘图技能的学者;
【收费标准】
• 详见“课程安排”; 注册费含学费、资料费、上机费、餐费等。
• 培训期间协助安排住宿,住宿费用自理。
【优惠政策】
• 同时选择所有选修课程可以享受600元优惠,即同时报两门选修课: 6600元/人。
• 凡华大基因长期业务合作伙伴和华大基因生物信息学培训班老学员,单选课程可享受9.5折优惠
• 4+1团体优惠,即同一单位有4人同时报名参加该期培训班,可额外免费赠送1个名额(只限于同一期培训班)
(以上优惠政策不能同时享用,最终优惠解释权归华大基因所有)
【注意事项】
• 请您在开班前将您的详细培训需求反馈给我们,以保证本次培训能更好的满足您的需求。
• 请您携带自己的手提电脑,以便能将相关软件拷回使用。
【联系方式】
• 联系电话:0755-36352044 对外培训组(咨询时间:周一至周五9:00-12:00 14:00-18:00)
• E-mail:training@service.genomics.cn 咨询
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