Twist Bioscience NGS 甲基化检测系统为鉴定人类基因组中的甲基化区域提供了一个可靠、端到端的样本制备解决方案。此工作流程采用了 New England Biolabs® 的独特酶处理过程，对 DNA 的破坏更小，同时还使用了 Twist 的定制甲基化组合设计。
无论是研究细胞分化还是进行液体活检筛查癌症，该系统都可提供现有的最高效的甲基化检测。
Twist Bioscience 甲基化检测系统网络研讨会
Topic 1 创新的甲基化检测系统助力您的甲基化研究
演讲嘉宾： 陈思远博士    Twist Bioscience     首席技术官
                  言 野博士       Twist Bioscience     中国区应用专家团队经理
Topic 2 泛癌种甲基化检测开发和应用
演讲嘉宾： 陈志伟 博士      基准医疗     研发副总裁
本次网络研讨会您将了解到：
  • Twist NGS 甲基化检测系统与传统重亚硫酸氢盐测序工作流程相比的众多优势；
  • 如何克服甲基化测序捕获前转化困难，减少脱靶捕获；
  • 探究端到端的甲基化测序工作流程如何为表观遗传学研究带来更高置信度的甲基化碱基识别；
  • Twist现有甲基化产品用户使用经验分享。
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演讲嘉宾：

陈思远 博士

首席技术官，Twist Bioscience

陈博士在 NGS、合成生物学和其他生命科学领域创新产品的开创、开发和商业化方面均具有着丰富的洞察力。他在 Twist 成立不久既已加入，负责领导合成生物学和 NGS 产品线的产品研发。陈博士构思并开发了包括 SARS-CoV-2 和其他传染病的合成标准品在内的 NGS 新产品线，开发了基因合成和 NGS 靶向富集的生物化学、工作流程、试剂盒，搭建了相应的生产系统，并与硬件、软件和硅基工程师共同合作，创建了公司的 DNA 合成器原型，并发展为规模化生产机器，用于 Twist 的基础生产工艺。陈博士在寡核苷酸合成和合成寡核苷酸的应用领域发表了大量的同行评议论文并获得专利。他在威斯康星大学麦迪逊分校获得化学博士学位，在北京大学获得化学学士学位。

言野 博士

专家团队经理，Twist Bioscience

言野博士，毕业于中国科学院。目前领导 Twist Bioscience 中国区现场应用专家团队，担任应用专家团队经理一职。主要负责为二代测序靶向解决方案的相关客户提供售前技术支持，同时也向客户就基因合成、寡核苷酸库、蛋白突变文库以及 DNA 存储等合成生物学方面的解决方案提供技术支持。加入 Twist Bioscience 之前，言野博士曾担任 Illumina 中国区现场应用科学家，在二代测序方面有着丰富的经验，也曾担任 Beckman Coulter 中国区市场部产品专员，在流式细胞仪方面也有丰富的经验。

陈志伟 博士

基准医疗，研发副总裁

陈志伟博士目前担任基准医疗研发副总裁一职，此前他于 2016 至 2018 年就职于美国加利福尼亚州的 Thermo Fisher 公司，2012 至 2016 就职于美国 Illumina 公司，2008 至 2012 年在美国加州的 DoE-Sandia 国家实验室工作。陈博士本科毕业于华南理工大学，并在中国科学院微生物研究所取得博士学位。

Twist Bioscience 甲基化检测系统的主要优势

端到端的解决方案

  • 更先进的未甲基化胞嘧啶的酶法转化
  • 使用高性能定制 Twist 探针可获得均一捕获
  • 使用经过优化的试剂提高了中靶率

创新的文库制备

  • 更高的文库复杂度和更好的 GC 平衡带来更好的结果
  • 比重亚硫酸氢盐转化多检测 15% 的 CpG
  • 样本损伤更少，支持低的样本起始量
  • 可轻松将工作流程加入到现有的甲基化测序流程中

经过优化的杂交试剂

  • 可在不牺牲性能的情况下调整杂交时间
  • 使用甲基化增强剂提高了中靶率
  • 杂交时间少于 4 小时

高效定制组合*

  • 复杂的设计，准确的合成和严格的 QC，能最大限度提高捕获的均一性和重现性
  • 可同时捕获正义链、反义链、甲基化和未甲基化的 DNA
  • 拥有各种组合大小、靶向区域和多重捕获需要的卓越性能
  • 可轻松添加或加密组合内容

* 需要单独订购

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用于 Twist 靶向甲基化测序的 NEBNext® Em-seq™ 试剂盒
Twist Bioscience 与 New England Biolabs（NEB）合作，提供了一个新的甲基化测序工作流程，提高了文库质量，消除了制备过程中破坏性重亚硫酸氢盐处理的需要。 该工作流程使用酶法转化未甲基化的胞嘧啶（见图），以鉴定甲基胞嘧啶（5mC）和羟甲基胞嘧啶（5hmC）的位点。 酶法转化可以产生更完整的文库，具有更好的代表性，最终实现了更灵敏的甲基化检测。文库制备系统适用于全基因组测序和 Twist 甲基化组合的下游富集。
EM-Seq 转化涉及一系列酶促步骤，将未甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶。最终结果与常规的重亚硫酸氢盐转化相同，使得 EM-seq 与现有使用 Bismark 和 bwa-meth 的分析流程兼容。

图 1：M-Seq 转化涉及一系列酶促反应来鉴定未甲基化的胞嘧啶。在第 1 个反应中，10-11 易位双加氧酶 2（TET2）将甲基化胞嘧啶（5mC 和 5hmC）转化为 5-羧基胞嘧啶（5caC），氧化增强剂使 5hmC 糖基化（5ghmC）。这些反应可保护 5mC 和 5hmC 免受下游脱氨基反应影响。DNA 发生变性，然后 APOBEC 将胞嘧啶脱氨成尿嘧啶。随后的 PCR 扩增将经过修饰的 5mC 和 5hmC 转化为胞嘧啶，将尿嘧啶转化为胸腺嘧啶。PCR 完成后，核苷酸占比与重亚硫酸氢盐转化的 DNA 相同，使得 Em-seq 与现有的 Bismark 和 bwa-meth 等分析流程兼容。

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产品目录

SKU 产品说明
101976 用于 Twist 靶向甲基化测序的 NEBNext® Em-seq™ 试剂盒，96 个样本
103558 Twist 甲基化增强剂，96 个反应
100767 Twist 通用阻断剂，96 个反应
100984 Twist 结合和纯化磁珠试剂盒，96 个反应
101175 Twist 快速杂交与清洗试剂盒，96 个反应
103496 Twist 靶向甲基化测序工作流程，96 x 12 个反应（包含上述所有试剂）
还提供 2 个反应和 12 个反应的规格用于富集。
Twist 定制组合可单独订购。请联系销售代表了解详细信息。

 

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