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会议合作企业:

会议时间:11月5日 下午
会议地点:
北京海淀区三里河路一号,北京西苑饭店, 6号会议厅

本次会议实行邀请制,不设注册费。您可以通过点击下方的“报名注册”链接填写详细的报名信息,在收到确认函后即可凭邀请函参加本次会议。

温馨提示:参会者交通及住宿费用请自理。

讲者及报告摘要:

(暂定)报告题目:大豆泛基因组的最新研究进展

摘要:2020年6月17日23时,国际权威学术期刊《细胞》在线发表了中国科学院遗传与发育生物学研究所田志喜等科研团队关于大豆泛基因组的最新研究进展。研究团队利用最新组装策略,对26个大豆种质材料进行了高质量的基因组从头组装和精确注释,并在此基础上,结合已经发表的中黄13、Williams 82 和 W05 基因组,开展了系统的基因组比较,构建了高质量的基于图形结构泛基因组,挖掘到大量利用传统基因组不能鉴定到的大片段结构变异。该项成果突破传统线性基因组的存储形式,在植物中首次实现了基于图形结构基因组的构建,将引领全新的下一代基因组学研究思路和方法,被审稿人称为“基因组学的里程碑工作”,是中国科学院种子创新研究院建立后取得的又一重大研究突破。

田志喜,博士,研究员,博士生导师。中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员。 1997年获河北农业大学学士学位,2000获河北农业大学硕士学位,2007年获中国科学院遗传发育所博士学位。2007-2010年美国普渡大学博士后,2010-2011年普渡大学Research Geneticist。2012年入选中科院“百人计划”,终期评估优秀。2012年度获“国家优秀青年基金”资助,2015年度获“国家杰出青年基金”资助。2012年获得“中国科学青年之星金奖”,2016年获得“第十四届中国青年科技奖”,2017年获得“中青年科技创新领军人才”,2017年获得第三批国家“万人计划”领军人才。

(暂定)报告题目:高准确度长读长测序技术视野下的微生物领域研究

摘要:在微生物多样性测序领域,NGS的PE250对16S rDNA的V3V4测序已经得到了广泛应用,但这只能针对16S rDNA和真菌ITS的某一段特定可变区进行测序,在物种鉴定方面比较可靠的是分类到属水平,较少部分能分类到种水平,可见短读长问题具有很大的局限性。PacBio HiFi reads既兼顾长读长(up to 25kb)又具有高准确度(>Q20 准确率),一条read即可轻松覆盖16S全长,可以更好的实现微生物在种水平上的分类,获得更加深入更加全面的信息。一张8M SMRT芯片6小时即可完成16S全长测序,产量 up to 3.5M > Q20 reads, 测序成本媲美NGS。HiFi测序可用较低成本获得样本中16S、18S和ITS全长序列,并且相对于NGS能够在物种分类的准确性、物种鉴定多样性等方面更契合对样本微生物多样性研究需求。

朱宝利,博士,中国科学院微生物研究所二级研究员,博士生导师。

中国科学院大学医学院岗位教授,微生物基因组研究中心主任,病原微生物耐药与耐药基因组学北京市重点实验室主任;科技部国家微生物组战略规划编写组组长;中国生物工程学会微生物组与技术专业委员会主任委员,中国抗癌协会肿瘤与微生态专业委员会主任委员,中国营养学会益生菌与益生元分会副主委,北京生物工程学会常务理事,中国食源性微生物检测技术战略联盟常务理事,中国医药教育协会微生态与健康教育专业委员会副主委,中华预防医学会微生态分会委员,中国微生物学会分析微生物学会委员,《科学通报》编委。 1985年毕业于墨西哥国立自治大学生物系;1992年北京农业大学理学博士。1995年至1998年在英国剑桥Babarham Institute从事博士后研究;1999年至2000年在美国国家癌症研究院参加人类基因组计划研究工作;2001至2006年应聘任加利福尼亚州奥克兰儿童医院研究所助理研究员;2006年回国后,被中国科学院微生物研究所聘任为研究员,同时被聘为博士生导师。在国外工作学习期间,分别在Nature、Science、Genome Research等国际一流科技刊物上发表了20多篇论文。

(暂定)报告题目:基因组组装与蜱虫基因组

摘要:Among arthropod vectors, ticks transmit the most diverse human and animal pathogens, leading to an increasing number of new challenges worldwide. Here we sequenced and assembled high-quality genomes of six ixodid tick species and further resequenced 678 tick specimens to understand three key aspects of ticks: genetic diversity, population structure, and pathogen distribution. We explored the genetic basis common to ticks, including heme and hemoglobin digestion, iron metabolism, and reactive oxygen species, and unveiled for the first time that genetic structure and pathogen composition in different tick species are mainly shaped by ecological and geographic factors. We further identified species-specific determinants associated with different host ranges, life cycles, and distributions. The findings of this study are an invaluable resource for research and control of ticks and tick-borne diseases.

赵方庆,博士,中国科学院北京生命科学研究院研究员。 先后获得中科院百人计划(2011)、基金委优青基金(2017)、北京市杰出青年基金(2018)和国家杰出青年基金(2020)。2006年在中国科学院海洋研究所获博士学位,在此期间获“中国科学院院长特别奖”和“国家海洋科学技术奖一等奖”。2006年7月至2010年12月在美国宾州州立大学比较基因组学和生物信息学研究中心,从事计算生物学和基因组学研究工作。2011年被中国科学院北京生命科学研究院聘为“百人计划”研究员。现任中科院北京生科院科研部副主任、技术平台部主任、中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会副主任。在Briefings in Bioinformatics、Genomics, Proteomics & Bioinformatics、BMC Evolutionary Biology、Medicine in Microecology和Hereditas等国际学术刊物担任副主编或编委。主要致力于建立高效的算法模型和实验技术,探索人体微生物与非编码RNA的结构组成与变化规律,以期解析它们与人类健康和疾病的关系。在Cell、Gut、Nature Communications、Genome Biology、ISME J、Current Biology和Nucleic Acids Res 等刊物上发表通讯作者论文40余篇,平均影响因子超过12;论文总引用次数超过6000次(H-index 38),其中多篇入选ESI高被引论文;连续3年荣获“中国科学院优秀导师奖”(2017,2018,2019)。


会议日程:


时间

题目

主讲人

单位

13:30-14:00

注册签到

14:00-14:10

开幕致辞

TBD

基因有限公司

TBD

PacBio

14:10-14:30

PacBio测序技术的发展历程

TBD

PacBio

14:30-15:00

大豆泛基因组的最新研究进展

田志喜 博士,研究员

中国科学院遗传与发育生物学研究所

15:00-15:30

高准确度长读长测序技术视野下的微生物领域研究

朱宝利 博士,研究员

中国科学院微生物研究所

15:30-15:50

茶歇

15:50-16:20

基因组组装与蜱虫基因组

赵方庆,博士,研究员

中国科学院北京生命科学研究院

16:20-16:50

全长转录本测序技术应用分享

TBD

TBD

16:50-17:20

高精准,长读长HiFiReads带来革命性的技术提升

翁亮

PacBio中国市场经理

17:20-17:40

文库构建流程总览

赵黎明

基因有限公司


感谢上海环亚生物科技有限公司、美国安捷伦公司、美国Thermo fisher公司,以及美国Covaris 公司对本次大会提供了赞助和支持!

交通指引:

地铁4号线动物园站D口出,西南方向步行500米即可到达;
地铁6号/9号线白石桥南站B口出,东北方向步行750米即可到达。


大会联系人:梁兆心
手机/微信:15810151580
座机:(010)51665161-138
邮箱:liangzhaoxin@genecompany.com
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