摘要：单细胞全长转录组技术可以揭示单个细胞中转录本的动态变化及序列结构的变化，具有二代测序单细胞转率组技术无法获得的优势；然而目前全长单细胞转率组技术一直受到低通量、高成本和高错误率等限制，无法广泛应用。我们开发了HIT-scISOseq技术，该方法通过生物素捕获全长cDNA，再通过首尾连接文库将多个全长cDNA序列连接成长链cDNA分子，从而实现了高通量的单细胞全长转录组测序。HIT-scISOseq在单个 SMRT Cell中产生10M以上高精度全长转率本，其通量是目前全长单细胞技术（scISOseq）的8倍左右，大幅降低了单细胞全长转率组的测序成本和时间。应用上述技术，我们研究了4000个正常和8000个受伤的角膜上皮细胞的全长转录组图谱，构建了细胞特异的动态转录组景观图谱，发现了大量的新的异构体，并确定了与损伤相关的转率本切换表达事件和细胞状态特异的转率本，充分实现了单细胞全长转率组技术的优势。因此，我们开发的技术为单细胞全长转录组学领域提供了一种操作简单、低成本和高通量的方法。
肖传乐，生物信息学博士，中山大学中山眼科中心副研究员
中山大学中山眼科中心眼科学国家重点实验室独立PI。中组部万人计划青年拔尖人才，广东省杰出青年基金获得者。长期致力于三代测序数据分析方法开发及应用研究，近年来针对三代测序基因组学和表观遗传学基础研究及应用的计算瓶颈问题建立了系列关键算法和支撑软件。目前以第一或通讯作者在Nature Methods、Molecular Cell、Nature Communications（2篇）等期刊发表高水平SCI论文二十余篇，先后开发NECAT、DeepMod、MECAT，MECAT2和FANSe2等十余个生物信息学分析工具，Frontiers in Genetics专刊特邀编辑，Genome Biology、Nature Communications、Briefing in Bioinformatics等专业期刊审稿人。本次会议将会分享高通量单细胞全长转录组技术研究(HIT-scISOseq)方面的内容。
