|
上海伯豪Illumina系列服务
上海伯豪平台介绍
1. Illumina新一代测序服务平台
上海伯豪自2009年起建立新一代测序平台，目前拥有Illumina Hiseq2500系统（1台），Illumina solexa GAⅡx系统（1台）。目前，上海伯豪针对全球客户提供基于Illumina新一代测序平台的各种服务，包括全基因组重测序、外显子组捕获测序、RAD-SEQ、全转录组测序、小RNA测序、lncRNA测序、RIP-SEQ、全基因组甲基化测序、ChIP-SEQ、MeDIP-SEQ等服务。
Illumina 二代测序技术路线
2. Illumina芯片服务平台
上海伯豪携手南方基因科技有限公司为广大用户提供Illumina芯片系列服务，该平台于2003年引进了美国Illumina微珠基因分型分析系统，成为全世界第三个拥有该高通量检测平台的单位，参加了国际Hapmap计划，承担了中国区的主要任务，各项技术指标名列全球之首。在承担国际计划之余，该平台还承担了多项国际、国内疾病基因组重点科研项目。
上海伯豪客户应用Illumina平台发表的部分文章
1. 使用Illumina芯片平台发表的部分文章
[1] Zhou L, Zhao X, Han Y, Lu Y, Shang Y, Liu C, Li T, Jin Z, Fan D, Wu K. Regulation of UHRF1 by miR-146a/b modulates gastric cancer invasion and metastasis. FASEB J. 2013 Aug 27. （IF5.704）
使用服务种类：Illumina Human 甲基化450K芯片服务
[2] Zhang L, Liu J, Zhao F, Ren H, Xu L, Lu J, Zhang S, Zhang X, Wei C, Lu G, Zheng Y, Du L. Genome-wide association studies for growth and meat production traits in sheep. PLoS One. 2013, 8(6):e66569. （IF4.092）
使用服务种类：Illumina OvineSNP50 Genotyping BeadChip服务
[3] Wang Z, Yan Z, Zhang B, Rao Z, Zhang Y, Liu J, Yu L, Zhao Y, Yang B, Wu T, Gao J. Identification of a 5-gene signature for clinical and prognostic prediction in gastric cancer patients upon microarray data. Med Oncol. 2013, 30(3):678. （IF2.147）
使用服务种类：Illumina Human WG-6表达谱芯片服务
[4] Liu J, Zhang L, Xu L, Ren H, Lu J, Zhang X, Zhang S, Zhou X, Wei C, Zhao F, Du L. Analysis of copy number variations in the sheep genome using 50K SNP BeadChip array. BMC Genomics. 2013 Apr 8. （IF4.397）
使用服务种类：Illumina OvineSNP50 Genotyping BeadChip服务
[5] Chen C, Chen W, Chen C, Moyzis R, He Q, Lei X, Li J, Wang Y, Liu B, Xiu D, Zhu B, Dong Q. Genetic variations in the serotoninergic system contribute to body-mass index in Chinese adolescents. PLoS One. 2013;8(3):e58717. （IF4.092）
使用服务种类：Illumina GoldenGate SNP芯片服务
[6] Jin S, Zhang X, Jia Z, Fu H, Zheng X, Sun X. Genetic linkage mapping and genetic analysis of QTL related to eye cross and eye diameter in common carp (Cyprinus carpio L.) using microsatellites and SNPs. Aquaculture. 2012, 358, 176-182. （IF2.179）
使用服务种类：Illumina GoldenGate定制芯片服务（鲤鱼）
[7] Hao D, Cheng H, Yin Z, Cui S, Zhang D, Wang H, Yu D. Identification of single nucleotide polymorphisms and haplotypes associated with yield and yield components in soybean (Glycine max) landraces across multiple environments. Theor Appl Genet. 2012, 124(3):447-58. （IF3.297）
使用服务种类：Illumina GoldenGate定制芯片服务（大豆）
[8] Jin S, Zhang X, Jia Z, Fu H, Zheng X, Sun X. Geneticlinkagemapping and geneticanalysis of QTLrelated to eyecross and eye diameter in common carp (Cyprinus carpio L.) using microsatellites and SNPs. Aquaculture. 2012, 358:176–182. （IF2.041）
使用服务种类：Illumina 定制SNP芯片服务
[9] Lin Y, Nie Y, Zhao J, Chen X, Ye M, Li Y, Du Y, Cao J, Shen B, Li Y. Genetic polymorphism at miR-181a binding site contributes to gastric cancer susceptibility. Carcinogenesis. 2012 Oct 10.
使用服务种类：Illumina Human V2 microRNA Expression BeadChips服务
[10] Li W, Jiang Y, Jin Q, Shi X, Jin J, Gao Y, Pan Y, Zhang H, Jiang J, Niu J. Expression and gene polymorphisms of interleukin 28B and hepatitis B virus infection in a Chinese Han population. Liver Int. 2011, 31(8):1118-26. （IF3.840）
使用服务种类：Illumina HumanWG-6 v3.0 Expression BeadChip服务
[11] The China Consortium for the Genetics of Autoimmune Thyroid Disease. A genome-wide association study identifies two new risk loci for Graves' disease. Nature Genetics. 2011, 43(9):897-901.（IF36.377）
使用服务种类：Illumina Human660-Quad BeadChips服务
文章相关新闻：Nature Genetics：GWAS发现Graves病两个新易感基因位点
[12] Peng J, Wang Z, Chen W, Ding Y, Wang H, Huang H, Huang W, Cai S. Integration of genetic signature and TNM staging system for predicting the relapse of locally advanced colorectal cancer. Int J Colorectal Dis. 2010, 25(11):1277-85. （IF2.645）
使用服务种类：Illumina DASL Cancer Panel服务
[13] Han JW, Zheng HF, Cui Y, et al. Genome-wide association study in a Chinese Han population identifies nine new susceptibility loci for systemic lupus erythematosus. Nature Genetics. 2009, 41(11):1234-7. （IF34.284）
使用服务种类：Illumina Human 610-Quad BeadChips服务
文章相关新闻：发现汉族人红斑狼疮易感基因
[14] Zhang XJ, Huang W, Yang S, et al. Psoriasis genome-wide association study identifies susceptibility variants within LCE gene cluster at 1q21. Nat Genet. 2009, 41(2):205-10.（IF34.284）
使用服务种类：Illumina Human 610-Quad BeadChips服务
文章相关新闻：银屑病易感基因LCE研究
2. 使用Illumina新一代测序平台发表的部分文章
[1] Qin L, Chen Y, Liu X, Ye S, Yu K, Huang Z, Yu J, Zhou X, Chen H, Mo D. Integrative Analysis of Porcine microRNAome during Skeletal Muscle Development. PLoS One. 2013, 8(9):e72418. （IF4.092）
使用服务种类：miRNA测序
[2] Sun X, Ruan R, Lin L, Zhu C, Zhang T, Wang M, Li H, Yu D. Genomewide investigation into DNA elements and ABC transporters involved in imazalil resistance in Penicillium digitatum. FEMS Microbiol Lett. 2013 Aug 17.（IF2.049）
使用服务种类：全基因组重测序服务
[3] Liu X, Lu Y, Yuan Y, Liu S, Guan C, Chen S, Liu Z. De Novo Transcriptome of Brassica juncea Seed Coat and Identification of Genes for the Biosynthesis of Flavonoids. PLoS One. 2013, 8(8):e71110. （IF4.092）
使用服务种类：RNA测序服务
文章相关新闻：荠菜型油菜种皮转录组De Novo拼接及类黄酮生物合成基因的鉴定
[4] Song Y, Ma K, Ci D, Zhang Z, Zhang D. Sexual dimorphism floral microRNA profiling and target gene expression in andromonoecious poplar (Populus tomentosa). PLoS One. 2013, 8(5):e62681. （IF4.092）
使用服务种类：小RNA测序服务
文章相关新闻：雌雄同株异花的毛白杨microRNA的性能分析以及对靶基因表达的影响
[5] Zou W, Chen D, Xiong M, Zhu J, Lin X, Wang L, Zhang J, Chen L, Zhang H, Chen H, Chen M, Jin M. Insights into the increasing virulence of the swine-origin pandemic H1N1/2009 influenza virus. Sci Rep. 2013, 3:1601.
使用服务种类：RNA测序服务
[6] Wang Q, Du HB, Li M, LI Y, Liu SN, Gao P, Zhang XL, Cheng J. MAPK Signal Transduction Pathway Regulation: A Novel Mechanism of Rat HSC-T6 Cell Apoptosis Induced by FUZHENGHUAYU Tablet. Evid Based Complement Alternat Med. 2013.（IF4.774）
使用服务种类：Affymetrix GeneChip Rat 230 2.0 Genome Array服务 / miRNA测序服务
[7] Wang T, Cui Y, Jin J, Guo J, Wang G, Yin X, He QY, Zhang G. Translating mRNAs strongly correlate to proteins in a multivariate manner and their translation ratios are phenotype specific. Nucleic Acids Res. 2013 Mar 21. （IF8.026）
使用服务种类：RNA测序服务
文章相关新闻：翻译组学研究首次建立相对定量化的中心法则
[8] Yang J, Duan S, Zhong R, Yin J, Pu J, Ke J, Lu X, Zou L, Zhang H, Zhu Z, Wang D, Xiao H, Guo A, Xia J, Miao X, Tang S, Wang G. Exome Sequencing Identified NRG3 as a Novel Susceptible Gene of Hirschsprung's Disease in a Chinese Population. Mol Neurobiol. 2013 Jan 12. （IF5.735）
使用服务种类：外显子捕获测序数据分析服务
[9] Li J, Li X, Chen Y, Yang Z, Guo S. Solexa sequencing based transcriptome analysis of Helicoverpa armigera larvae. Mol Biol Rep. 2012, 39(12):11051-9. （IF2.929）
使用服务种类：mRNA测序服务
[10] Ma L, Yang S, Zhao W, Tang Z, Zhang T, Li K. Identification and analysis of pig chimeric mRNAs using RNA sequencing data. BMC Genomics. 2012, 13(1):429. （IF4.073）
使用服务种类：mRNA测序服务
[11] Ye L, Su X, Wu Z, Zheng X, Wang J, Zi C, Zhu G, Wu S, Bao W. Analysis of Differential miRNA Expression in the Duodenum of Escherichia coli F18-Sensitive and -Resistant Weaned Piglets. PLoS One. 2012, 7(8):e43741. （IF4.092）
使用服务种类：miRNA测序服务
[12] Huang J, Deng Q, Wang Q, Li KY, Dai JH, Li N, Zhu ZD, Zhou B, Liu XY, Liu RF, Fei QL, Chen H, Cai B, Zhou B, Xiao HS, Qin LX, Han ZG. Exome sequencing of hepatitis B virus-associated hepatocellular carcinoma. Nat Genet. 2012 Aug 26. （IF35.532）
使用服务种类：全外显子组测序服务
文章相关新闻：Nature Genetics：HBV相关的肝细胞癌外显子组研究
[13] Wei X, Ju X, Yi X, Zhu Q, Qu N, Liu T, Chen Y, Jiang H, Yang G, Zhen R, Lan Z, Qi M, Wang J, Yang Y, Chu Y, Li X, Guang Y, Huang J. Identification of sequence variants in genetic disease-causing genes using targeted next-generation sequencing. PLoS One. 2011;6(12):e29500. （IF4.411）
使用服务种类：序列捕获测序服务 |
|
